85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewana3_3653 on replicon NC_008577
Organism: Shewanella sp. ANA-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008577  Shewana3_3653  methylation site containing protein  100 
 
 		 162 aa  327  5.0000000000000004e-89  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3477  methylation site containing protein  96.91 
 
 		 162 aa  318  1.9999999999999998e-86  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000223181  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0474  methylation site containing protein  96.91 
 
 		 162 aa  315  2e-85  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00105235  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4104  MSHA pilin protein MshC  84.62 
 
 		 157 aa  268  2e-71  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3827  methylation site containing protein  77.78 
 
 		 162 aa  260  4e-69  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000859994  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0517  MSHA pilin protein MshC  77.16 
 
 		 162 aa  258  3e-68  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.426127  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0513  methylation site containing protein  76.54 
 
 		 162 aa  258  3e-68  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00478235  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0569  MSHA pilin protein MshC  79.63 
 
 		 162 aa  253  8e-67  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0492  methylation site containing protein  77.85 
 
 		 160 aa  249  1e-65  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00337293  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3339  methylation  55.84 
 
 		 157 aa  168  3e-41  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000729468  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0553  MSHA pilin protein MshC  56.21 
 
 		 155 aa  167  5e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00995446  normal  0.374252 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4407  MSHA pilin protein MshC  55.48 
 
 		 154 aa  163  1.0000000000000001e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.318857  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3759  MSHA pilin protein MshC  51.63 
 
 		 158 aa  154  5.0000000000000005e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00178977  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0462  MSHA pilin protein MshC  53.59 
 
 		 163 aa  146  1.0000000000000001e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.551025  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3743  methylation site containing protein  50.65 
 
 		 159 aa  139  1.9999999999999998e-32  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.160506  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0398  MSHA pilin protein MshC  48.08 
 
 		 149 aa  128  3e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.556071  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2828  MSHA pilin protein MshC  36.71 
 
 		 162 aa  75.5  0.0000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4568  MSHA pilin protein MshC  35.29 
 
 		 182 aa  74.7  0.0000000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.116926  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0178  prepilin-type cleavage/methylation  29.59 
 
 		 188 aa  60.8  0.000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3267  hypothetical protein  32.05 
 
 		 146 aa  57  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.347086  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00259  putative Mannose-sensitive agglutinin (MSHA) biogenesis protein MshC (pilus type IV)  30.19 
 
 		 153 aa  55.8  0.0000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1142  cellulose binding, type IV  29.33 
 
 		 146 aa  53.1  0.000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3341  methylation  38.18 
 
 		 182 aa  51.2  0.000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4408  MSHA pilin protein MshA  32.69 
 
 		 170 aa  48.1  0.00005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00456827  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0392  hypothetical protein  39.29 
 
 		 150 aa  48.1  0.00006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000497888  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2001  hypothetical protein  34.78 
 
 		 167 aa  47.4  0.00009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3656  methylation site containing protein  47.92 
 
 		 169 aa  45.8  0.0003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00406084  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3479  methylation site containing protein  47.92 
 
 		 169 aa  45.4  0.0003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000294883  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0567  methylation site containing protein  47.92 
 
 		 169 aa  45.8  0.0003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.468703  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3368  general secretion pathway protein H  25.15 
 
 		 178 aa  44.7  0.0005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0737 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0842  hypothetical protein  41.18 
 
 		 193 aa  44.7  0.0005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03692  hypothetical protein  52.38 
 
 		 151 aa  44.7  0.0005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0516  methylation site containing protein  43.75 
 
 		 172 aa  44.7  0.0006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00623258  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002375  MSHA pilin protein MshA  57.58 
 
 		 168 aa  44.3  0.0007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0138724  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0491  methylation site containing protein  60 
 
 		 186 aa  43.1  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000497616  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3760  methylation site containing protein  51.22 
 
 		 176 aa  43.5  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000143336  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3761  MSHA pilin protein MshA  51.22 
 
 		 178 aa  43.5  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000202365  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0512  methylation site containing protein  60 
 
 		 182 aa  43.5  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000175657  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0473  methylation site containing protein  57.58 
 
 		 174 aa  43.5  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000513166  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0573  MshA, mannose-sensitive haemaglutinin  32.97 
 
 		 166 aa  43.5  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.200044 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3821  hypothetical protein  31.48 
 
 		 173 aa  43.9  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0551  MSHA pilin protein MshA  43.75 
 
 		 173 aa  43.5  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000258454  normal  0.542221 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4410  methylation site containing protein  43.75 
 
 		 175 aa  43.1  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000246782  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2827  MSHA pilin protein MshA  60 
 
 		 178 aa  43.5  0.001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.99325  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20891  pilin  45.83 
 
 		 170 aa  43.5  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0755  general secretion pathway protein H  25.47 
 
 		 155 aa  43.1  0.001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3828  methylation site containing protein  43.75 
 
 		 172 aa  43.5  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000000112537  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0515  methylation site containing protein  57.58 
 
 		 168 aa  42.7  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000372661  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0477  type IV pilus, mannose-sensitive hemagglutinin A  56.67 
 
 		 156 aa  42.7  0.002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.581973  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0476  type IV pilus, mannose-sensitive hemagglutinin A  56.67 
 
 		 157 aa  43.1  0.002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.903201  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0568  methylation site containing protein  41.67 
 
 		 169 aa  43.1  0.002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.238644  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4105  MSHA pilin protein MshA  60 
 
 		 171 aa  42.7  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3074  pilin, putative  52.78 
 
 		 178 aa  42.4  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0397  methylation site containing protein  54.55 
 
 		 163 aa  43.1  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.061774  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1898  general secretion pathway protein G  28.42 
 
 		 167 aa  42.4  0.003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3296  methylation site containing protein  54.55 
 
 		 173 aa  42  0.003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00258  MSHA pilin protein MshA  48.65 
 
 		 163 aa  42.4  0.003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4409  methylation site containing protein  53.85 
 
 		 166 aa  42  0.003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000123074  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3478  methylation site containing protein  48.78 
 
 		 169 aa  42  0.003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000141512  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3340  methylation  60 
 
 		 172 aa  42.4  0.003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000827612  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0396  methylation site containing protein  54.55 
 
 		 169 aa  42.4  0.003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0195536  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20881  pilin  45.24 
 
 		 159 aa  42  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.493249 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3744  methylation site containing protein  56.67 
 
 		 173 aa  42  0.003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.144711  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0552  MSHA pilin protein MshA  54.55 
 
 		 159 aa  42.4  0.003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00386307  normal  0.526597 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0461  MSHA pilin protein MshA  54.55 
 
 		 172 aa  42  0.003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0176  prepilin-type cleavage/methylation  53.33 
 
 		 212 aa  42  0.004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03690  hypothetical protein  28.75 
 
 		 149 aa  41.6  0.004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3989  pilin, putative  62.07 
 
 		 187 aa  41.6  0.005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.387559 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0180  prepilin-type cleavage/methylation  42.62 
 
 		 280 aa  41.2  0.006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3983  methylation site containing protein  39.58 
 
 		 165 aa  41.2  0.006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3326  pilin, putative  56.67 
 
 		 187 aa  41.2  0.006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0266287  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0856  methylation site containing protein  47.22 
 
 		 182 aa  41.2  0.006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2522  pilin  36.73 
 
 		 176 aa  40.8  0.007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0964  pilin, putative  56.67 
 
 		 187 aa  41.2  0.007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0885526  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1033  pilin, putative  56.67 
 
 		 187 aa  41.2  0.007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0234716  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3584  fimbrial protein PilA  36.73 
 
 		 176 aa  40.8  0.007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.194411  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0364  MshA, mannose-sensitive haemaglutinin  38.16 
 
 		 163 aa  41.2  0.007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0735599  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0976  pilin, putative  58.62 
 
 		 180 aa  40.8  0.007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0485556  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3102  hypothetical protein  30.36 
 
 		 157 aa  40.8  0.007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1066  pilin, putative  56.67 
 
 		 187 aa  40.8  0.007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00196226  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0049  pilin polypeptide PilA-like  35.94 
 
 		 144 aa  40.8  0.008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0965276  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0883  general secretion pathway protein H  53.12 
 
 		 146 aa  40.8  0.008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0109332  normal  0.107815 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3315  pilin, putative  51.43 
 
 		 185 aa  40.8  0.008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.540059  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0448  hypothetical protein  46.67 
 
 		 191 aa  40.4  0.009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3689  pilin, putative  47.37 
 
 		 186 aa  40.4  0.009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>