164 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_00259 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_00259  putative Mannose-sensitive agglutinin (MSHA) biogenesis protein MshC (pilus type IV)  100 
 
 		 153 aa  312  9e-85  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0178  prepilin-type cleavage/methylation  33.33 
 
 		 188 aa  83.6  8e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0398  MSHA pilin protein MshC  32.08 
 
 		 149 aa  67.4  0.00000000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.556071  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3339  methylation  34.88 
 
 		 157 aa  65.1  0.0000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000729468  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2828  MSHA pilin protein MshC  30.82 
 
 		 162 aa  63.2  0.000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4104  MSHA pilin protein MshC  29.75 
 
 		 157 aa  61.2  0.000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4568  MSHA pilin protein MshC  31.4 
 
 		 182 aa  58.2  0.00000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.116926  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0569  MSHA pilin protein MshC  28.66 
 
 		 162 aa  57.8  0.00000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0474  methylation site containing protein  30.82 
 
 		 162 aa  56.6  0.0000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00105235  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3653  methylation site containing protein  30.19 
 
 		 162 aa  55.8  0.0000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0517  MSHA pilin protein MshC  32.3 
 
 		 162 aa  55.8  0.0000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.426127  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4407  MSHA pilin protein MshC  45.61 
 
 		 154 aa  55.8  0.0000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.318857  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3477  methylation site containing protein  29.56 
 
 		 162 aa  54.3  0.0000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000223181  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0462  MSHA pilin protein MshC  30.97 
 
 		 163 aa  53.9  0.0000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.551025  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3827  methylation site containing protein  30.43 
 
 		 162 aa  53.5  0.000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000859994  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3743  methylation site containing protein  29.8 
 
 		 159 aa  52.8  0.000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.160506  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3759  MSHA pilin protein MshC  40.58 
 
 		 158 aa  52.8  0.000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00178977  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0478  type IV pilus, prepilin-like protein (MSHC)  25.27 
 
 		 204 aa  52.4  0.000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.993627  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0553  MSHA pilin protein MshC  41.38 
 
 		 155 aa  52.8  0.000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00995446  normal  0.374252 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0492  methylation site containing protein  36.23 
 
 		 160 aa  51.6  0.000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00337293  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0513  methylation site containing protein  36.23 
 
 		 162 aa  51.6  0.000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00478235  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3341  methylation  40.91 
 
 		 182 aa  51.2  0.000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1036  hypothetical protein  48.98 
 
 		 131 aa  51.2  0.000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0364  MshA, mannose-sensitive haemaglutinin  29.03 
 
 		 163 aa  50.8  0.000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0735599  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4410  methylation site containing protein  62.07 
 
 		 175 aa  49.7  0.00001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000246782  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0396  methylation site containing protein  62.07 
 
 		 169 aa  49.7  0.00001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0195536  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3296  methylation site containing protein  42.86 
 
 		 173 aa  48.9  0.00002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03692  hypothetical protein  32.43 
 
 		 151 aa  49.3  0.00002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0551  MSHA pilin protein MshA  62.07 
 
 		 173 aa  49.7  0.00002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000258454  normal  0.542221 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3761  MSHA pilin protein MshA  62.07 
 
 		 178 aa  49.3  0.00002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000202365  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3866  hypothetical protein  33.33 
 
 		 191 aa  48.5  0.00003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2827  MSHA pilin protein MshA  45.45 
 
 		 178 aa  48.5  0.00003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.99325  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0476  type IV pilus, mannose-sensitive hemagglutinin A  31.19 
 
 		 157 aa  48.5  0.00003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.903201  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1176  hypothetical protein  50 
 
 		 163 aa  48.1  0.00004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002375  MSHA pilin protein MshA  62.07 
 
 		 168 aa  48.1  0.00004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0138724  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2151  membrane protein  67.74 
 
 		 186 aa  48.5  0.00004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.899411  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0530  hypothetical protein  34.07 
 
 		 192 aa  48.1  0.00004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3760  methylation site containing protein  58.62 
 
 		 176 aa  47.8  0.00005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000143336  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00258  MSHA pilin protein MshA  54.35 
 
 		 163 aa  48.1  0.00005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0464  hypothetical protein  32.61 
 
 		 191 aa  48.1  0.00005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0552  MSHA pilin protein MshA  58.62 
 
 		 159 aa  47.8  0.00006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00386307  normal  0.526597 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4106  MSHA pilin protein MshB  55.26 
 
 		 205 aa  47.4  0.00007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1141  V10 pilin  53.66 
 
 		 163 aa  47.4  0.00007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3657  methylation site containing protein  55.26 
 
 		 205 aa  47.4  0.00007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000205665  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0397  methylation site containing protein  58.62 
 
 		 163 aa  47.4  0.00008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.061774  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0448  hypothetical protein  55.26 
 
 		 191 aa  47  0.00008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0842  hypothetical protein  29.9 
 
 		 193 aa  47  0.00009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3478  methylation site containing protein  58.62 
 
 		 169 aa  47  0.00009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000141512  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0461  MSHA pilin protein MshA  58.62 
 
 		 172 aa  47  0.00009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0516  methylation site containing protein  58.62 
 
 		 172 aa  46.6  0.0001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00623258  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0999  methylation site containing protein  45.1 
 
 		 164 aa  46.6  0.0001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0926979  normal  0.0597088 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1064  methylation site containing protein  45.1 
 
 		 164 aa  47  0.0001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.691522  normal  0.0588159 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0856  methylation site containing protein  50 
 
 		 182 aa  47  0.0001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3744  methylation site containing protein  58.62 
 
 		 173 aa  47  0.0001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.144711  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1003  methylation site containing protein  45.1 
 
 		 164 aa  46.6  0.0001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.102399 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0566  MSHA pilin protein MshB  58.33 
 
 		 205 aa  46.6  0.0001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.571105  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2860  methylation site containing protein  46.3 
 
 		 167 aa  46.6  0.0001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0477  type IV pilus, mannose-sensitive hemagglutinin A  58.62 
 
 		 156 aa  46.6  0.0001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.581973  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4569  MSHA pilin protein MshA  60.71 
 
 		 187 aa  45.8  0.0002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.442923  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3340  methylation  46.34 
 
 		 172 aa  46.2  0.0002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000827612  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3479  methylation site containing protein  55.17 
 
 		 169 aa  45.8  0.0002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000294883  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1101  methylation site containing protein  62.96 
 
 		 167 aa  45.8  0.0002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000943511 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0473  methylation site containing protein  55.17 
 
 		 174 aa  46.2  0.0002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000513166  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0708  methylation site containing protein  53.12 
 
 		 170 aa  46.2  0.0002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0386199  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3745  methylation site containing protein  51.28 
 
 		 201 aa  45.8  0.0002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0403042  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3656  methylation site containing protein  55.17 
 
 		 169 aa  46.2  0.0002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00406084  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0460  MSHA pilin protein MshB  57.89 
 
 		 201 aa  45.8  0.0002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.671  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3315  pilin, putative  55.17 
 
 		 185 aa  45.8  0.0002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.540059  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3828  methylation site containing protein  55.17 
 
 		 172 aa  45.8  0.0002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000000112537  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0567  methylation site containing protein  55.17 
 
 		 169 aa  46.2  0.0002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.468703  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0568  methylation site containing protein  61.29 
 
 		 169 aa  46.2  0.0002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.238644  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0491  methylation site containing protein  55.17 
 
 		 186 aa  45.8  0.0002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000497616  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0512  methylation site containing protein  55.17 
 
 		 182 aa  45.8  0.0002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000175657  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0573  MshA, mannose-sensitive haemaglutinin  55.17 
 
 		 166 aa  45.8  0.0002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.200044 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1109  hypothetical protein  63.33 
 
 		 166 aa  45.8  0.0002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4105  MSHA pilin protein MshA  55.17 
 
 		 171 aa  45.4  0.0003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0515  methylation site containing protein  55.17 
 
 		 168 aa  45.4  0.0003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000372661  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3480  methylation site containing protein  52.63 
 
 		 205 aa  45.4  0.0003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000493749  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0472  methylation site containing protein  52.63 
 
 		 205 aa  45.4  0.0003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00000795599  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3983  methylation site containing protein  47.37 
 
 		 165 aa  45.1  0.0003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0760  type II secretory pathway, pseudopilin PulG  29.57 
 
 		 156 aa  45.4  0.0003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.014468  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3266  methylation site containing protein  62.96 
 
 		 167 aa  45.4  0.0003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4409  methylation site containing protein  57.14 
 
 		 166 aa  45.1  0.0003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000123074  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0395  methylation site containing protein  52.63 
 
 		 211 aa  45.4  0.0003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0635812  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3074  pilin, putative  58.62 
 
 		 178 aa  45.4  0.0003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3444  methylation site containing protein  62.96 
 
 		 167 aa  45.4  0.0003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00280491 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0511  MSHA pilin protein MshB  52.63 
 
 		 205 aa  44.7  0.0004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000086206  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4159  hypothetical protein  65.38 
 
 		 193 aa  44.7  0.0004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3341  methylation  54.05 
 
 		 205 aa  45.1  0.0004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000885834  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0490  MSHA pilin protein MshB  52.63 
 
 		 205 aa  44.7  0.0004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000965015  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3822  putative V10 pilin  43.59 
 
 		 163 aa  45.1  0.0004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002378  MSHA pilin protein MshC  36.36 
 
 		 153 aa  44.3  0.0005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0204489  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0514  MSHA pilin protein MshB  52.63 
 
 		 205 aa  44.7  0.0005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00061527  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4408  MSHA pilin protein MshA  58.62 
 
 		 170 aa  44.7  0.0005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00456827  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0898  hypothetical protein  58.62 
 
 		 172 aa  44.7  0.0005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0907  hypothetical protein  58.62 
 
 		 172 aa  44.7  0.0005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3464  hypothetical protein  58.62 
 
 		 172 aa  44.7  0.0005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3829  MSHA pilin protein MshB  52.63 
 
 		 205 aa  44.7  0.0005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000000175672  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0872  hypothetical protein  58.62 
 
 		 172 aa  44.7  0.0005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0550  methylation site containing protein  52.63 
 
 		 218 aa  44.7  0.0005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000424061  normal  0.764365 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>