109 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_1416 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_1416  hypothetical protein  100 
 
 		 205 aa  421  1e-117  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00239057  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1796  hypothetical protein  29.67 
 
 		 189 aa  79.7  0.00000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.501764 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1032  hypothetical protein  28.38 
 
 		 145 aa  56.2  0.0000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.332642 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0553  MSHA pilin protein MshC  30.52 
 
 		 155 aa  54.7  0.0000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00995446  normal  0.374252 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3690  methylation site containing protein  43.75 
 
 		 185 aa  52.8  0.000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3267  hypothetical protein  31.21 
 
 		 146 aa  50.4  0.00002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.347086  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3759  MSHA pilin protein MshC  26.09 
 
 		 158 aa  49.3  0.00004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00178977  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0364  MshA, mannose-sensitive haemaglutinin  45.24 
 
 		 163 aa  48.9  0.00006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0735599  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0842  hypothetical protein  33.73 
 
 		 193 aa  48.5  0.00006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4104  MSHA pilin protein MshC  25.32 
 
 		 157 aa  47.4  0.0001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3315  general secretion pathway protein G  40.98 
 
 		 143 aa  46.6  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.82991  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3149  general secretion pathway protein G  42.62 
 
 		 143 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.907974  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0964  pilin, putative  36.76 
 
 		 187 aa  46.6  0.0002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0885526  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3464  hypothetical protein  31.58 
 
 		 172 aa  46.6  0.0002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3758  hypothetical protein  37.25 
 
 		 174 aa  47  0.0002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3326  pilin, putative  36.76 
 
 		 187 aa  47  0.0002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0266287  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002375  MSHA pilin protein MshA  44.19 
 
 		 168 aa  46.6  0.0002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0138724  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0872  hypothetical protein  31.58 
 
 		 172 aa  46.6  0.0002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1033  pilin, putative  36.76 
 
 		 187 aa  46.6  0.0002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0234716  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0898  hypothetical protein  31.58 
 
 		 172 aa  46.6  0.0002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0907  hypothetical protein  31.58 
 
 		 172 aa  46.6  0.0002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1066  pilin, putative  36.76 
 
 		 187 aa  46.6  0.0002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00196226  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0971  general secretion pathway protein H  28.36 
 
 		 173 aa  47.4  0.0002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3217  hypothetical protein  30.99 
 
 		 108 aa  47  0.0002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000170582 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4105  MSHA pilin protein MshA  41.86 
 
 		 171 aa  46.2  0.0003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0473  methylation site containing protein  28.03 
 
 		 174 aa  46.2  0.0003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000513166  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0461  MSHA pilin protein MshA  38.33 
 
 		 172 aa  46.2  0.0003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0550  methylation site containing protein  37.25 
 
 		 218 aa  46.6  0.0003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000424061  normal  0.764365 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2913  hypothetical protein  40.91 
 
 		 182 aa  46.2  0.0003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0551  MSHA pilin protein MshA  44.19 
 
 		 173 aa  45.8  0.0004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000258454  normal  0.542221 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3761  MSHA pilin protein MshA  41.86 
 
 		 178 aa  45.8  0.0004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000202365  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0576  hypothetical protein  37.25 
 
 		 174 aa  45.8  0.0004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0726397 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3781  hypothetical protein  39.58 
 
 		 172 aa  45.4  0.0005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3363  methylation  46.15 
 
 		 139 aa  45.8  0.0005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.57133  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3760  methylation site containing protein  41.86 
 
 		 176 aa  45.8  0.0005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000143336  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3989  pilin, putative  42.86 
 
 		 187 aa  45.8  0.0005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.387559 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1141  V10 pilin  46.51 
 
 		 163 aa  45.4  0.0006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0395  methylation site containing protein  28.57 
 
 		 211 aa  45.1  0.0007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0635812  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3821  hypothetical protein  37.74 
 
 		 173 aa  45.1  0.0007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4407  MSHA pilin protein MshC  28.03 
 
 		 154 aa  45.1  0.0007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.318857  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2827  MSHA pilin protein MshA  44.19 
 
 		 178 aa  45.1  0.0008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.99325  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3689  pilin, putative  35.29 
 
 		 186 aa  45.1  0.0008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3341  methylation  30.88 
 
 		 205 aa  44.3  0.001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000885834  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3296  methylation site containing protein  39.53 
 
 		 173 aa  44.3  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3478  methylation site containing protein  41.86 
 
 		 169 aa  44.3  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000141512  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3520  methylation site containing protein  45.24 
 
 		 201 aa  44.7  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3744  methylation site containing protein  41.86 
 
 		 173 aa  44.3  0.001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.144711  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0460  MSHA pilin protein MshB  28.57 
 
 		 201 aa  44.7  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.671  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0398  MSHA pilin protein MshC  29.22 
 
 		 149 aa  44.7  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.556071  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0976  pilin, putative  41.82 
 
 		 180 aa  44.3  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0485556  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0448  hypothetical protein  44.19 
 
 		 191 aa  44.3  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0552  MSHA pilin protein MshA  42.86 
 
 		 159 aa  44.3  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00386307  normal  0.526597 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1380  methylation site containing protein  44.19 
 
 		 190 aa  44.3  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0516  methylation site containing protein  44.19 
 
 		 172 aa  44.7  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00623258  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0391  hypothetical protein  44.19 
 
 		 138 aa  43.9  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  7.588550000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0856  methylation site containing protein  40.91 
 
 		 182 aa  43.5  0.002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3828  methylation site containing protein  41.86 
 
 		 172 aa  43.5  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000000112537  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0530  hypothetical protein  44.19 
 
 		 192 aa  43.9  0.002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0566  MSHA pilin protein MshB  29.41 
 
 		 205 aa  43.9  0.002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.571105  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03468  Tfp pilus assembly protein major pilin PilA  36.36 
 
 		 141 aa  43.5  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2521  hypothetical protein  43.9 
 
 		 193 aa  43.5  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4106  MSHA pilin protein MshB  27.94 
 
 		 205 aa  43.1  0.003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3340  methylation  44.19 
 
 		 172 aa  43.1  0.003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000827612  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0435  methylation site containing protein  42.86 
 
 		 201 aa  43.1  0.003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3745  methylation site containing protein  29.41 
 
 		 201 aa  42.7  0.003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0403042  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3983  methylation site containing protein  43.18 
 
 		 165 aa  43.1  0.003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3657  methylation site containing protein  27.94 
 
 		 205 aa  43.1  0.003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000205665  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0067  hypothetical protein  37.31 
 
 		 169 aa  43.1  0.003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0396  methylation site containing protein  32.39 
 
 		 169 aa  43.1  0.003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0195536  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0490  MSHA pilin protein MshB  27.94 
 
 		 205 aa  42.7  0.003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000965015  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03692  hypothetical protein  41.86 
 
 		 151 aa  43.1  0.003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2452  methylation site containing protein  43.9 
 
 		 197 aa  43.1  0.003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00816638  normal  0.444869 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1956  hypothetical protein  33.33 
 
 		 189 aa  43.1  0.003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0620526  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3316  methylation site containing protein  43.9 
 
 		 177 aa  43.1  0.003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.192216  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0464  hypothetical protein  41.86 
 
 		 191 aa  42.7  0.003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0511  MSHA pilin protein MshB  27.94 
 
 		 205 aa  42.7  0.003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000086206  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3822  putative V10 pilin  39.53 
 
 		 163 aa  43.1  0.003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0476  type IV pilus, mannose-sensitive hemagglutinin A  39.53 
 
 		 157 aa  42.7  0.003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.903201  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0477  type IV pilus, mannose-sensitive hemagglutinin A  39.53 
 
 		 156 aa  43.1  0.003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.581973  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0472  methylation site containing protein  27.94 
 
 		 205 aa  42.7  0.004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00000795599  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0708  methylation site containing protein  32.35 
 
 		 170 aa  42.7  0.004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0386199  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0760  type II secretory pathway, pseudopilin PulG  39.53 
 
 		 156 aa  42.4  0.004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.014468  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1794  hypothetical protein  41.67 
 
 		 163 aa  42.7  0.004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.786211 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3829  MSHA pilin protein MshB  27.94 
 
 		 205 aa  42.7  0.004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000000175672  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1108  methylation site containing protein  27.81 
 
 		 163 aa  42.7  0.004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.105316  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0491  methylation site containing protein  37.21 
 
 		 186 aa  42.7  0.004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000497616  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0514  MSHA pilin protein MshB  27.94 
 
 		 205 aa  42.7  0.004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00061527  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4159  hypothetical protein  40.48 
 
 		 193 aa  42.4  0.005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003563  type II secretory pathway pseudopilin PulG  33.9 
 
 		 163 aa  42.4  0.005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0512  methylation site containing protein  37.21 
 
 		 182 aa  42.4  0.005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000175657  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3480  methylation site containing protein  38.1 
 
 		 205 aa  42  0.006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000493749  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3698  methylation site containing protein  42.86 
 
 		 192 aa  42  0.006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.452925  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3074  pilin, putative  36.23 
 
 		 178 aa  42  0.006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3315  pilin, putative  44.74 
 
 		 185 aa  42  0.006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.540059  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1507  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  25.93 
 
 		 121 aa  42  0.006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000010883  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0515  methylation site containing protein  37.21 
 
 		 168 aa  42  0.006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000372661  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3479  methylation site containing protein  39.53 
 
 		 169 aa  42  0.007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000294883  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3656  methylation site containing protein  39.53 
 
 		 169 aa  42  0.007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00406084  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0397  methylation site containing protein  38.1 
 
 		 163 aa  41.6  0.007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.061774  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4411  methylation site containing protein  33.33 
 
 		 219 aa  42  0.007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000316241  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>