39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_0763 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_0763  general secretion pathway protein H  100 
 
 		 188 aa  360  6e-99  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.612491  normal  0.122141 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5690  general secretion pathway protein H  57.14 
 
 		 187 aa  150  1e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.138037  normal  0.133551 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0924  general secretion pathway protein H  54.81 
 
 		 151 aa  144  1e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0280079  normal  0.859469 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3522  general secretion pathway protein H  54.14 
 
 		 162 aa  141  4e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0510608  normal  0.632823 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0653  general secretion pathway protein H  52.94 
 
 		 182 aa  139  1.9999999999999998e-32  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0219082  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0674  general secretion pathway protein H  52.94 
 
 		 182 aa  139  1.9999999999999998e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0856392  normal  0.35732 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0535  general secretion pathway protein H  56 
 
 		 155 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1322  general secretion pathway protein H  58.06 
 
 		 129 aa  133  9.999999999999999e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1080  general secretion pathway protein H  51.61 
 
 		 154 aa  111  5e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.28383  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3420  general secretion pathway protein H  44.44 
 
 		 176 aa  105  4e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000465918 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3129  general secretion pathway protein H  48.25 
 
 		 167 aa  96.3  3e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0375089 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3195  general secretion pathway protein H  30.72 
 
 		 150 aa  67.4  0.0000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.255687  hitchhiker  0.00307792 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2780  general secretion pathway protein H  34.27 
 
 		 196 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3513  general secretion pathway protein H  34.27 
 
 		 199 aa  66.2  0.0000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0013  general secretion pathway protein H  34.27 
 
 		 199 aa  66.2  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1885  general secretion pathway protein H  34.27 
 
 		 199 aa  66.2  0.0000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.096237  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2667  general secretion pathway protein H  34.27 
 
 		 199 aa  66.2  0.0000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.668264  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0225  general secretion pathway protein H  34.27 
 
 		 199 aa  66.2  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0013  general secretion pathway protein H  34.04 
 
 		 199 aa  65.1  0.0000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.036848  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55520  type II secretion system protein  36.84 
 
 		 149 aa  63.9  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0464256 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0012  general secretion pathway protein H  32.56 
 
 		 196 aa  62  0.000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2203  general secretion pathway protein H  35.66 
 
 		 148 aa  61.6  0.000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0134021  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4832  general secretion pathway protein H  43.48 
 
 		 149 aa  61.2  0.000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3239  general secretion pathway protein H  32.87 
 
 		 189 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.707083 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3075  general secretion pathway protein H  33.56 
 
 		 191 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000021149 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4496  general secretion pathway protein H  33.59 
 
 		 193 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.818073  normal  0.141626 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0058  general secretion pathway protein H  31.88 
 
 		 210 aa  54.3  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0013  general secretion pathway protein H  31.01 
 
 		 189 aa  53.5  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0057  general secretion pathway protein H  31.01 
 
 		 189 aa  53.5  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.128144  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0076  general secretion pathway protein H  39.44 
 
 		 189 aa  52.8  0.000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.692629  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3941  general secretion pathway protein H  37.14 
 
 		 193 aa  52.8  0.000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.1806 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0057  general secretion pathway protein H  39.44 
 
 		 182 aa  52.8  0.000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.12302  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0047  general secretion pathway protein H  38.57 
 
 		 182 aa  51.2  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.909533  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3385  general secretion pathway protein H  36.59 
 
 		 174 aa  46.6  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3222  general secretion pathway protein H  29.23 
 
 		 166 aa  44.7  0.0009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1897  general secretion pathway protein H  30.77 
 
 		 172 aa  43.5  0.002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0055  putative general secretion pathway protein J  40.54 
 
 		 224 aa  41.2  0.009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0954003  normal  1 
 
 
-
 
NC_009705  YpsIP31758_B0019  type IV prepilin domain-containing protein PilS  28.42 
 
 		 175 aa  41.2  0.009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0045  putative general secretion pathway protein J  40.54 
 
 		 234 aa  41.2  0.01  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>