42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A3129 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A3129  general secretion pathway protein H  100 
 
 		 167 aa  317  6e-86  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0375089 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3420  general secretion pathway protein H  51.92 
 
 		 176 aa  144  8.000000000000001e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000465918 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5690  general secretion pathway protein H  52.48 
 
 		 187 aa  126  1.0000000000000001e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.138037  normal  0.133551 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0674  general secretion pathway protein H  49.65 
 
 		 182 aa  112  2.0000000000000002e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0856392  normal  0.35732 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0653  general secretion pathway protein H  49.65 
 
 		 182 aa  112  3e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0219082  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0763  general secretion pathway protein H  48.25 
 
 		 188 aa  111  5e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.612491  normal  0.122141 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3522  general secretion pathway protein H  44.59 
 
 		 162 aa  104  7e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0510608  normal  0.632823 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1322  general secretion pathway protein H  49.62 
 
 		 129 aa  100  7e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1080  general secretion pathway protein H  53.47 
 
 		 154 aa  100  1e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.28383  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0924  general secretion pathway protein H  46.76 
 
 		 151 aa  100  1e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0280079  normal  0.859469 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0535  general secretion pathway protein H  47.02 
 
 		 155 aa  93.6  1e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2203  general secretion pathway protein H  37.58 
 
 		 148 aa  65.1  0.0000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0134021  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55520  type II secretion system protein  47.22 
 
 		 149 aa  63.5  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0464256 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3195  general secretion pathway protein H  44.44 
 
 		 150 aa  61.6  0.000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.255687  hitchhiker  0.00307792 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4832  general secretion pathway protein H  44 
 
 		 149 aa  59.7  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2667  general secretion pathway protein H  41.67 
 
 		 199 aa  58.5  0.00000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.668264  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0013  general secretion pathway protein H  41.67 
 
 		 199 aa  58.5  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1885  general secretion pathway protein H  41.67 
 
 		 199 aa  58.5  0.00000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.096237  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3513  general secretion pathway protein H  41.67 
 
 		 199 aa  58.5  0.00000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2780  general secretion pathway protein H  41.67 
 
 		 196 aa  58.5  0.00000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0225  general secretion pathway protein H  41.67 
 
 		 199 aa  58.5  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0013  general secretion pathway protein H  44.44 
 
 		 199 aa  57.8  0.00000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.036848  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0012  general secretion pathway protein H  43.06 
 
 		 196 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3941  general secretion pathway protein H  29.03 
 
 		 193 aa  52.4  0.000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.1806 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4496  general secretion pathway protein H  32.73 
 
 		 193 aa  51.2  0.000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.818073  normal  0.141626 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3075  general secretion pathway protein H  37.63 
 
 		 191 aa  47.8  0.00008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000021149 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3239  general secretion pathway protein H  29.05 
 
 		 189 aa  46.6  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.707083 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0076  general secretion pathway protein H  28.85 
 
 		 189 aa  46.6  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.692629  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0057  general secretion pathway protein H  28.85 
 
 		 189 aa  45.8  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.128144  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0013  general secretion pathway protein H  28.85 
 
 		 189 aa  45.8  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0058  general secretion pathway protein H  28.76 
 
 		 210 aa  45.4  0.0004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0057  general secretion pathway protein H  36.47 
 
 		 182 aa  44.7  0.0006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.12302  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3222  general secretion pathway protein H  32.19 
 
 		 166 aa  44.3  0.0007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1897  general secretion pathway protein H  35.21 
 
 		 172 aa  44.3  0.0009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0962  Tfp pilus assembly protein FimT-like protein  45 
 
 		 162 aa  42.7  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.582094  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0271  putative pilin protein PilA  47.83 
 
 		 154 aa  42.7  0.002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.148513  normal  0.384028 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4587  general secretion pathway protein H  29.33 
 
 		 206 aa  43.1  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.248042  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5161  type IV pilin structural subunit  40.32 
 
 		 179 aa  42.4  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0047  general secretion pathway protein H  35.37 
 
 		 182 aa  41.6  0.006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.909533  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3255  hypothetical protein  38.16 
 
 		 140 aa  41.2  0.007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3194  hypothetical protein  33.75 
 
 		 163 aa  41.2  0.007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.697618  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2375  general secretion pathway protein J  50 
 
 		 223 aa  40.8  0.009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.69272  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>