231 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcryo_0271 on replicon NC_007969
Organism: Psychrobacter cryohalolentis K5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007969  Pcryo_0271  putative pilin protein PilA  100 
 
 		 154 aa  317  3e-86  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.148513  normal  0.384028 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3175  Fimbrial protein pilin  27.01 
 
 		 134 aa  73.6  0.0000000000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3896  Fimbrial protein pilin  35.51 
 
 		 133 aa  71.6  0.000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4819  general secretion pathway protein H  34.38 
 
 		 138 aa  67  0.00000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.80083  normal  0.111143 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0680  fimbrial protein pilin  32.61 
 
 		 136 aa  62.8  0.000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2629  type IV pilus subunit PilA  32.84 
 
 		 138 aa  61.6  0.000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0475  fimbrial protein pilin  38.13 
 
 		 139 aa  60.5  0.000000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.665132  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1999  fimbrial protein  35.17 
 
 		 153 aa  60.8  0.000000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3176  Fimbrial protein pilin  34.75 
 
 		 137 aa  59.7  0.00000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4536  fimbrial protein pilin  32.61 
 
 		 136 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3356  fimbrial protein pilin: general secretion pathway protein H  33.78 
 
 		 137 aa  58.5  0.00000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.669833  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0463  type 4 fimbrial pilin signal peptide protein  33.54 
 
 		 167 aa  57.4  0.00000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.961425  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12104  fimbrial protein  32.52 
 
 		 165 aa  56.6  0.0000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.246946  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0675  fimbrial protein pilin  31.16 
 
 		 136 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0357739 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0634  fimbrial protein pilin  30.43 
 
 		 136 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2173  methylation  29.93 
 
 		 146 aa  55.5  0.0000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3422  fimbrial protein pilin  34.53 
 
 		 148 aa  55.1  0.0000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2126  methylation  33.82 
 
 		 146 aa  55.1  0.0000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.196428  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3575  putative major pilin subunit  31.78 
 
 		 148 aa  52.4  0.000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.270372  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1383  type IV pilin PilE  51.11 
 
 		 135 aa  52.4  0.000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.140998  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2904  putative type 4 fimbrial biogenesis transmembrane protein  37.8 
 
 		 168 aa  52  0.000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.3004 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2914  type IV pilin PilE  37.89 
 
 		 144 aa  50.8  0.000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0462503 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0421  methylation site containing protein  33.86 
 
 		 142 aa  49.3  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000175547  normal  0.0256712 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0872  general secretion pathway protein H  58.33 
 
 		 152 aa  48.9  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.854476  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5185  protein involved in methylation  33.33 
 
 		 174 aa  48.9  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.101493  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1265  methylation  31.97 
 
 		 160 aa  48.9  0.00003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00964428  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4782  Tfp pilus assembly protein  29.88 
 
 		 179 aa  48.9  0.00003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.26372 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0682  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  50 
 
 		 165 aa  48.5  0.00004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0723462  hitchhiker  0.000000000174273 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2664  methylation  65.79 
 
 		 160 aa  48.1  0.00004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0249  fimbrial protein pilin  32.21 
 
 		 165 aa  48.1  0.00004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0477  prepilin-type cleavage/methylation  65.71 
 
 		 148 aa  48.1  0.00004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.695821  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3946  fimbrial protein pilin  30.43 
 
 		 169 aa  48.5  0.00004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00129399 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0652  putative major pilin subunit  32.61 
 
 		 145 aa  48.1  0.00004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2540  fimbrial protein pilin  62.86 
 
 		 140 aa  47.8  0.00005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3945  fimbrial protein pilin  30.43 
 
 		 166 aa  48.1  0.00005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.373423  hitchhiker  0.00130999 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0765  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  38.96 
 
 		 170 aa  47.4  0.00006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.000000000473938  hitchhiker  1.49827e-16 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2540  general secretion pathway protein H  31.72 
 
 		 147 aa  47.4  0.00006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.13206  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2663  type IV pilus biogenesis protein PilE  34.18 
 
 		 142 aa  47.8  0.00006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.839094  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4444  type IV pilin  35.79 
 
 		 160 aa  47.4  0.00007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0927  type IV pilus biogenesis protein  66.67 
 
 		 142 aa  47.4  0.00007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4674  methylation  31.61 
 
 		 169 aa  47.4  0.00007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.953976  normal  0.930835 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0697  pilus assembly protein major pilin PilA  36.88 
 
 		 154 aa  47.4  0.00007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3344  prepilin-type cleavage/methylation  50 
 
 		 148 aa  47.4  0.00007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.62769  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0210  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  36.59 
 
 		 154 aa  47.4  0.00007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000000103934  normal  0.61486 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0480  pilin subfamily protein  53.49 
 
 		 174 aa  47.4  0.00008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0314  general secretion pathway protein  34.44 
 
 		 147 aa  47  0.00009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3385  fgenesh4_pg.C_scaffold_2883000002  42 
 
 		 199 aa  47  0.00009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0627  putative major pilin subunit  26.06 
 
 		 147 aa  47  0.00009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3255  hypothetical protein  36.17 
 
 		 140 aa  47  0.00009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3387  fgenesh4_pg.C_scaffold_2883000002  58.33 
 
 		 196 aa  47  0.00009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.437334  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5161  type IV pilin structural subunit  53.66 
 
 		 179 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0417  pilin, putative  36.08 
 
 		 138 aa  46.6  0.0001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2449  Fimbrial protein pilin  63.89 
 
 		 162 aa  46.6  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.000426279  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2200  pilus assembly protein PilA  58.33 
 
 		 111 aa  46.2  0.0001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.360457  hitchhiker  0.000654211 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2275  general secretion pathway protein H  57.14 
 
 		 164 aa  46.2  0.0001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2997  type II secretion system protein G  47.92 
 
 		 135 aa  47  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000413298 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2882  methylation  63.64 
 
 		 132 aa  46.6  0.0001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.938712  normal  0.364905 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3388  methylation  34.21 
 
 		 138 aa  47  0.0001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0612  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  63.89 
 
 		 161 aa  46.6  0.0001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0186796 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17770  prepilin-type N-terminal cleavage/methylation domain-containing protein  38.46 
 
 		 135 aa  46.6  0.0001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.775526 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1058  Tfp pilus assembly protein major pilin PilA-like protein  59.46 
 
 		 176 aa  46.2  0.0001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.110537  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5198  fimbrial protein pilin  50 
 
 		 148 aa  46.6  0.0001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4679  Tfp pilus assembly protein major pilin PilA  61.11 
 
 		 168 aa  47  0.0001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3189  fimbrial protein pilin  63.64 
 
 		 162 aa  46.6  0.0001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.208  normal  0.535395 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3918  methylation site containing protein  39.68 
 
 		 143 aa  46.2  0.0001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000265425  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0422  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  30.08 
 
 		 163 aa  46.6  0.0001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.253002  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0557  type 4 fimbrial pilin signal peptide protein  50 
 
 		 173 aa  45.8  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0558  type 4 fimbrial pilin signal peptide protein  68.57 
 
 		 168 aa  46.2  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.791178  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0816  type IV pilus biogenesis protein  61.11 
 
 		 133 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0467  type 4 fimbrial pilin signal peptide protein  55.56 
 
 		 171 aa  45.8  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.568157  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0720  fimbrial protein pilin  61.11 
 
 		 133 aa  45.4  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0461  fimbrial protein precursor PilE (MS11 antigen)  39.06 
 
 		 167 aa  46.2  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.653734  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0567  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  30.58 
 
 		 147 aa  45.4  0.0002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2033  fimbrial protein pilin  30.61 
 
 		 146 aa  45.8  0.0002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.244331  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0472  fimbrial protein pilin  27.95 
 
 		 182 aa  45.8  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.877435  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002546  type IV pilin PilA  55 
 
 		 157 aa  45.8  0.0002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.790868  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0852  methylation site containing protein  57.14 
 
 		 131 aa  45.8  0.0002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3170  methylation site containing protein  57.14 
 
 		 131 aa  45.8  0.0002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2693  general secretion pathway protein H  38.46 
 
 		 198 aa  45.4  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.289926  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2567  general secretion pathway protein H  38.46 
 
 		 198 aa  45.4  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2413  type II secretion system protein G  34.62 
 
 		 149 aa  46.2  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.330838  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0478  prepilin peptidase dependent protein D  43.84 
 
 		 134 aa  46.2  0.0002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.183909  normal  0.878303 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3824  fimbrial protein pilin  50 
 
 		 164 aa  45.8  0.0002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0456668 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00107  predicted major pilin subunit  31.52 
 
 		 146 aa  45.4  0.0003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.686894  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3494  putative major pilin subunit  31.52 
 
 		 146 aa  45.4  0.0003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0110  putative major pilin subunit  31.52 
 
 		 146 aa  45.4  0.0003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000976692  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03468  Tfp pilus assembly protein major pilin PilA  54.29 
 
 		 141 aa  45.4  0.0003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0114  putative major pilin subunit  31.52 
 
 		 146 aa  45.4  0.0003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00878541  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3551  putative major pilin subunit  31.52 
 
 		 146 aa  45.4  0.0003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000125636 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0651  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  37.18 
 
 		 165 aa  45.4  0.0003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3584  fimbrial protein PilA  37.23 
 
 		 176 aa  45.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.194411  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0096  hypothetical protein  40.23 
 
 		 163 aa  45.4  0.0003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.062594 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00106  hypothetical protein  31.52 
 
 		 146 aa  45.4  0.0003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0111  putative major pilin subunit  31.52 
 
 		 146 aa  45.4  0.0003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.273778  normal  0.482641 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0926  Tfp pilus assembly protein major pilin PilA-like protein  34.29 
 
 		 171 aa  45.4  0.0003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000619994  hitchhiker  8.71814e-18 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0065  pilin  29.14 
 
 		 170 aa  45.1  0.0003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.154072 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2522  pilin  37.23 
 
 		 176 aa  45.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1931  type II secretion system protein G  37.18 
 
 		 138 aa  45.4  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000053439  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1548  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  38.82 
 
 		 167 aa  44.7  0.0004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00345057  hitchhiker  0.00000000000000294624 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0505  fimbrial protein pilin  48.72 
 
 		 159 aa  45.1  0.0004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>