50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A3222 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007347  Reut_A3222  general secretion pathway protein H  100 
 
 		 166 aa  325  1.0000000000000001e-88  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3385  general secretion pathway protein H  77.16 
 
 		 174 aa  237  5e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3107  general secretory pathway H transmembrane protein  58.18 
 
 		 165 aa  135  3.0000000000000003e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.62689  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3392  general secretion pathway protein H  58.94 
 
 		 164 aa  134  6.0000000000000005e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3045  general secretion pathway protein H  57.5 
 
 		 164 aa  131  3e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.521563  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3941  general secretion pathway protein H  44.52 
 
 		 193 aa  117  6e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.1806 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4496  general secretion pathway protein H  44.87 
 
 		 193 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.818073  normal  0.141626 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0225  general secretion pathway protein H  45.1 
 
 		 199 aa  112  3e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2667  general secretion pathway protein H  45.1 
 
 		 199 aa  112  3e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.668264  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0013  general secretion pathway protein H  45.1 
 
 		 199 aa  112  3e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.036848  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0013  general secretion pathway protein H  45.1 
 
 		 199 aa  112  3e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1885  general secretion pathway protein H  45.1 
 
 		 199 aa  112  3e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.096237  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3513  general secretion pathway protein H  45.1 
 
 		 199 aa  112  3e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2780  general secretion pathway protein H  45.1 
 
 		 196 aa  111  4.0000000000000004e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0012  general secretion pathway protein H  42.86 
 
 		 196 aa  110  6e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3075  general secretion pathway protein H  45 
 
 		 191 aa  106  1e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000021149 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0013  general secretion pathway protein H  45.75 
 
 		 189 aa  105  2e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0057  general secretion pathway protein H  45.75 
 
 		 189 aa  105  2e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.128144  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0057  general secretion pathway protein H  45.1 
 
 		 182 aa  105  3e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.12302  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0076  general secretion pathway protein H  45.1 
 
 		 189 aa  104  5e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.692629  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3239  general secretion pathway protein H  44.3 
 
 		 189 aa  103  8e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.707083 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0058  general secretion pathway protein H  44.23 
 
 		 210 aa  100  7e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0047  general secretion pathway protein H  44.52 
 
 		 182 aa  99.4  2e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.909533  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1074  general secretion pathway protein H  39.51 
 
 		 177 aa  87.4  8e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.822718  normal  0.19806 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55520  type II secretion system protein  35.67 
 
 		 149 aa  76.3  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0464256 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4832  general secretion pathway protein H  32.28 
 
 		 149 aa  69.3  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3195  general secretion pathway protein H  41.25 
 
 		 150 aa  68.9  0.00000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.255687  hitchhiker  0.00307792 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2203  general secretion pathway protein H  35.42 
 
 		 148 aa  59.7  0.00000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0134021  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1897  general secretion pathway protein H  37.93 
 
 		 172 aa  58.9  0.00000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0674  general secretion pathway protein H  29.56 
 
 		 182 aa  55.5  0.0000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0856392  normal  0.35732 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0653  general secretion pathway protein H  29.56 
 
 		 182 aa  55.5  0.0000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0219082  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5690  general secretion pathway protein H  32.88 
 
 		 187 aa  53.1  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.138037  normal  0.133551 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0924  general secretion pathway protein H  31.17 
 
 		 151 aa  52  0.000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0280079  normal  0.859469 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0384  general secretion pathway protein H  30.82 
 
 		 169 aa  48.1  0.00006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.105042 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3523  general secretion pathway protein H  30.82 
 
 		 169 aa  48.1  0.00006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4587  general secretion pathway protein H  32.56 
 
 		 206 aa  47.8  0.00007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.248042  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0384  general secretion pathway protein H  29.86 
 
 		 169 aa  47  0.0001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0763  general secretion pathway protein H  30.28 
 
 		 188 aa  47  0.0001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.612491  normal  0.122141 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3420  general secretion pathway protein H  29.82 
 
 		 176 aa  45.4  0.0003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000465918 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03131  hypothetical protein  30.14 
 
 		 169 aa  45.4  0.0003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03180  predicted general secretory pathway component, cryptic  30.14 
 
 		 169 aa  45.4  0.0003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2390  general secretion pathway protein H  31.73 
 
 		 180 aa  45.8  0.0003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000294923 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1352  general secretion pathway protein H  28.35 
 
 		 177 aa  45.1  0.0004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2922  general secretion pathway protein H  37.21 
 
 		 193 aa  43.1  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.252681  normal  0.157804 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2033  general secretion pathway protein H  28.17 
 
 		 172 aa  42.4  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24040  general secretion pathway outer membrane protein H precursor  30.85 
 
 		 172 aa  42  0.004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1474  general secretion pathway protein H  32.89 
 
 		 179 aa  41.6  0.005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1303  general secretion pathway protein H  26.82 
 
 		 179 aa  41.2  0.006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2373  general secretion pathway protein H  43.94 
 
 		 187 aa  41.2  0.006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.495108  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3522  general secretion pathway protein H  33.33 
 
 		 162 aa  40.8  0.009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0510608  normal  0.632823 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>