61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_0076 on replicon NC_010508
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008542  Bcen2424_0057  general secretion pathway protein H  98.94 
 
 		 189 aa  374  1e-103  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.128144  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0013  general secretion pathway protein H  98.94 
 
 		 189 aa  374  1e-103  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0076  general secretion pathway protein H  100 
 
 		 189 aa  376  1e-103  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.692629  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3239  general secretion pathway protein H  90.48 
 
 		 189 aa  293  1e-78  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.707083 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0058  general secretion pathway protein H  75.36 
 
 		 210 aa  270  1e-71  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0057  general secretion pathway protein H  94.12 
 
 		 182 aa  267  5e-71  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.12302  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0047  general secretion pathway protein H  95.21 
 
 		 182 aa  259  1e-68  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.909533  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0013  general secretion pathway protein H  82.35 
 
 		 199 aa  251  4.0000000000000004e-66  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.036848  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3513  general secretion pathway protein H  82.35 
 
 		 199 aa  251  5.000000000000001e-66  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1885  general secretion pathway protein H  82.35 
 
 		 199 aa  251  5.000000000000001e-66  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.096237  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0013  general secretion pathway protein H  82.35 
 
 		 199 aa  251  5.000000000000001e-66  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2667  general secretion pathway protein H  82.35 
 
 		 199 aa  251  5.000000000000001e-66  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.668264  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0225  general secretion pathway protein H  82.35 
 
 		 199 aa  251  5.000000000000001e-66  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2780  general secretion pathway protein H  82.35 
 
 		 196 aa  251  6e-66  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0012  general secretion pathway protein H  81.94 
 
 		 196 aa  249  1e-65  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4496  general secretion pathway protein H  76.13 
 
 		 193 aa  240  1e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.818073  normal  0.141626 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3941  general secretion pathway protein H  76.97 
 
 		 193 aa  238  4e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.1806 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3075  general secretion pathway protein H  78.57 
 
 		 191 aa  218  5e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000021149 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1074  general secretion pathway protein H  52.29 
 
 		 177 aa  123  2e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.822718  normal  0.19806 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3385  general secretion pathway protein H  45.64 
 
 		 174 aa  119  3e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3222  general secretion pathway protein H  44.52 
 
 		 166 aa  109  3e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3045  general secretion pathway protein H  41.61 
 
 		 164 aa  91.3  8e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.521563  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55520  type II secretion system protein  37.82 
 
 		 149 aa  90.9  1e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0464256 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3392  general secretion pathway protein H  40.91 
 
 		 164 aa  87.4  1e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3107  general secretory pathway H transmembrane protein  41.83 
 
 		 165 aa  85.5  4e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.62689  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3195  general secretion pathway protein H  35.06 
 
 		 150 aa  85.5  5e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.255687  hitchhiker  0.00307792 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4832  general secretion pathway protein H  35.48 
 
 		 149 aa  77  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2203  general secretion pathway protein H  43.62 
 
 		 148 aa  70.1  0.00000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0134021  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5690  general secretion pathway protein H  32.16 
 
 		 187 aa  62.4  0.000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.138037  normal  0.133551 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1897  general secretion pathway protein H  34.59 
 
 		 172 aa  59.3  0.00000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0763  general secretion pathway protein H  39.44 
 
 		 188 aa  57.8  0.00000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.612491  normal  0.122141 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2922  general secretion pathway protein H  33.12 
 
 		 193 aa  55.1  0.0000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.252681  normal  0.157804 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4587  general secretion pathway protein H  30.3 
 
 		 206 aa  53.1  0.000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.248042  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0653  general secretion pathway protein H  36.84 
 
 		 182 aa  52.8  0.000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0219082  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0674  general secretion pathway protein H  36.84 
 
 		 182 aa  52.8  0.000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0856392  normal  0.35732 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2390  general secretion pathway protein H  39.8 
 
 		 180 aa  51.2  0.000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000294923 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3420  general secretion pathway protein H  41.27 
 
 		 176 aa  49.3  0.00004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000465918 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0924  general secretion pathway protein H  32 
 
 		 151 aa  48.5  0.00006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0280079  normal  0.859469 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3522  general secretion pathway protein H  36.78 
 
 		 162 aa  47.4  0.0001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0510608  normal  0.632823 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0109  general secretion pathway protein H  30.39 
 
 		 190 aa  46.2  0.0003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3129  general secretion pathway protein H  28.85 
 
 		 167 aa  45.8  0.0003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0375089 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0956  general secretion pathway protein G  48.21 
 
 		 145 aa  43.9  0.001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.194745  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3266  general secretion pathway protein G  48.21 
 
 		 145 aa  43.9  0.001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000062887  hitchhiker  0.00000000000000294917 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1007  general secretion pathway protein G  48.21 
 
 		 145 aa  43.9  0.001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1322  general secretion pathway protein H  35.48 
 
 		 129 aa  43.1  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1352  general secretion pathway protein H  32 
 
 		 177 aa  43.1  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2373  general secretion pathway protein H  35.35 
 
 		 187 aa  42.7  0.003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.495108  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0384  general secretion pathway protein H  26.24 
 
 		 169 aa  42.4  0.004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.105042 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0235  general secretion pathway protein H  36.51 
 
 		 202 aa  42.4  0.004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3040  general secretion pathway protein H  39.71 
 
 		 177 aa  42.4  0.004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.504644  normal  0.141498 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3523  general secretion pathway protein H  26.24 
 
 		 169 aa  42.4  0.004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3074  general secretion pathway protein G  39.66 
 
 		 158 aa  42  0.005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000016497 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0384  general secretion pathway protein H  26.24 
 
 		 169 aa  42.4  0.005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1473  general secretion pathway protein G  42.59 
 
 		 150 aa  42  0.005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.660645  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1302  general secretion pathway protein G  42.59 
 
 		 153 aa  42  0.005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2522  pilin  48.48 
 
 		 176 aa  41.6  0.006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3584  fimbrial protein PilA  48.48 
 
 		 176 aa  41.6  0.006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.194411  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4154  hypothetical protein  42 
 
 		 183 aa  41.6  0.006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.833679  normal  0.161997 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2904  putative type 4 fimbrial biogenesis transmembrane protein  43.48 
 
 		 168 aa  41.2  0.009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.3004 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0422  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  32.38 
 
 		 163 aa  41.2  0.009  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.253002  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2921  general secretion pathway protein G  31.76 
 
 		 149 aa  41.2  0.009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>