52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A4496 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007951  Bxe_A4496  general secretion pathway protein H  100 
 
 		 193 aa  389  1e-107  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.818073  normal  0.141626 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3941  general secretion pathway protein H  88.6 
 
 		 193 aa  338  2.9999999999999998e-92  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.1806 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3075  general secretion pathway protein H  83.12 
 
 		 191 aa  244  6e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000021149 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0013  general secretion pathway protein H  76.51 
 
 		 199 aa  237  1e-61  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.036848  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3513  general secretion pathway protein H  76.51 
 
 		 199 aa  237  1e-61  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1885  general secretion pathway protein H  76.51 
 
 		 199 aa  237  1e-61  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.096237  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0013  general secretion pathway protein H  76.51 
 
 		 199 aa  237  1e-61  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0012  general secretion pathway protein H  75.84 
 
 		 196 aa  236  1e-61  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2667  general secretion pathway protein H  76.51 
 
 		 199 aa  237  1e-61  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.668264  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0225  general secretion pathway protein H  76.51 
 
 		 199 aa  237  1e-61  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2780  general secretion pathway protein H  76.51 
 
 		 196 aa  237  1e-61  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3239  general secretion pathway protein H  77.48 
 
 		 189 aa  228  4e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.707083 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0058  general secretion pathway protein H  78.29 
 
 		 210 aa  227  8e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0076  general secretion pathway protein H  76.13 
 
 		 189 aa  225  3e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.692629  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0057  general secretion pathway protein H  76.16 
 
 		 182 aa  223  2e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.12302  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0013  general secretion pathway protein H  74.84 
 
 		 189 aa  222  2e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0057  general secretion pathway protein H  74.84 
 
 		 189 aa  222  2e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.128144  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0047  general secretion pathway protein H  77.4 
 
 		 182 aa  219  1.9999999999999999e-56  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.909533  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1074  general secretion pathway protein H  62.25 
 
 		 177 aa  152  2.9999999999999998e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.822718  normal  0.19806 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3385  general secretion pathway protein H  44.3 
 
 		 174 aa  119  3.9999999999999996e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3222  general secretion pathway protein H  45.21 
 
 		 166 aa  114  7.999999999999999e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3045  general secretion pathway protein H  41.61 
 
 		 164 aa  83.6  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.521563  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55520  type II secretion system protein  35.95 
 
 		 149 aa  83.2  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0464256 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3392  general secretion pathway protein H  42.36 
 
 		 164 aa  81.6  0.000000000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3195  general secretion pathway protein H  33.55 
 
 		 150 aa  80.1  0.00000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.255687  hitchhiker  0.00307792 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3107  general secretory pathway H transmembrane protein  41.67 
 
 		 165 aa  77.8  0.00000000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.62689  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4832  general secretion pathway protein H  34.44 
 
 		 149 aa  71.2  0.000000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2203  general secretion pathway protein H  40.59 
 
 		 148 aa  68.2  0.00000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0134021  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1897  general secretion pathway protein H  33.33 
 
 		 172 aa  63.2  0.000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5690  general secretion pathway protein H  33.07 
 
 		 187 aa  59.7  0.00000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.138037  normal  0.133551 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0763  general secretion pathway protein H  33.59 
 
 		 188 aa  56.2  0.0000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.612491  normal  0.122141 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0674  general secretion pathway protein H  31.87 
 
 		 182 aa  54.3  0.000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0856392  normal  0.35732 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0653  general secretion pathway protein H  30 
 
 		 182 aa  53.9  0.000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0219082  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0109  general secretion pathway protein H  32.35 
 
 		 190 aa  52  0.000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3420  general secretion pathway protein H  30.49 
 
 		 176 aa  51.6  0.000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000465918 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0924  general secretion pathway protein H  34.67 
 
 		 151 aa  51.2  0.000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0280079  normal  0.859469 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2390  general secretion pathway protein H  31.58 
 
 		 180 aa  49.7  0.00002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000294923 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3522  general secretion pathway protein H  36.84 
 
 		 162 aa  47.8  0.0001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0510608  normal  0.632823 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2922  general secretion pathway protein H  40 
 
 		 193 aa  45.8  0.0004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.252681  normal  0.157804 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1352  general secretion pathway protein H  33.77 
 
 		 177 aa  45.1  0.0006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4587  general secretion pathway protein H  25.55 
 
 		 206 aa  45.1  0.0007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.248042  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4730  general secretion pathway protein H  29.17 
 
 		 193 aa  44.7  0.0009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.129836  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3563  general secretion pathway protein H  28.04 
 
 		 190 aa  43.9  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0157  general secretion pathway protein H  27.72 
 
 		 204 aa  43.1  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0543101 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0153  general secretion pathway protein H  27.45 
 
 		 191 aa  42.4  0.004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4202  general secretion pathway protein H  27.45 
 
 		 191 aa  42.4  0.004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0157  general secretion pathway protein H  27.45 
 
 		 191 aa  42.4  0.004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0170  general secretion pathway protein H  28 
 
 		 190 aa  42.4  0.004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3576  hypothetical protein  26.97 
 
 		 187 aa  42  0.005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.625561 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2532  general secretion pathway protein G  41.38 
 
 		 156 aa  41.6  0.007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.211317  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1383  type IV pilin PilE  33.33 
 
 		 135 aa  41.2  0.009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.140998  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0319  general secretion pathway protein H  36 
 
 		 162 aa  41.2  0.01  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>