55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_B1074 on replicon NC_007511
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007511  Bcep18194_B1074  general secretion pathway protein H  100 
 
 
177 aa  344  3e-94  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.822718  normal  0.19806 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4496  general secretion pathway protein H  62.25 
 
 
193 aa  174  7e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.818073  normal  0.141626 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3941  general secretion pathway protein H  59.01 
 
 
193 aa  170  1e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.1806 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0012  general secretion pathway protein H  55.26 
 
 
196 aa  154  7e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0013  general secretion pathway protein H  54.25 
 
 
199 aa  151  4e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.036848  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3513  general secretion pathway protein H  54.25 
 
 
199 aa  151  4e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2667  general secretion pathway protein H  54.25 
 
 
199 aa  151  4e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.668264  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0225  general secretion pathway protein H  54.25 
 
 
199 aa  151  4e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0013  general secretion pathway protein H  54.25 
 
 
199 aa  151  4e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1885  general secretion pathway protein H  54.25 
 
 
199 aa  151  4e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.096237  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2780  general secretion pathway protein H  54.25 
 
 
196 aa  151  4e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3075  general secretion pathway protein H  56 
 
 
191 aa  144  5e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000021149 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0058  general secretion pathway protein H  54.61 
 
 
210 aa  137  7e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3239  general secretion pathway protein H  52.32 
 
 
189 aa  136  2e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.707083 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0076  general secretion pathway protein H  52.29 
 
 
189 aa  135  3.0000000000000003e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.692629  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0013  general secretion pathway protein H  50.98 
 
 
189 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0057  general secretion pathway protein H  50.98 
 
 
189 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.128144  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0057  general secretion pathway protein H  50.98 
 
 
182 aa  130  7.999999999999999e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.12302  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0047  general secretion pathway protein H  51.7 
 
 
182 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.909533  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3385  general secretion pathway protein H  40.13 
 
 
174 aa  107  8.000000000000001e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3222  general secretion pathway protein H  39.47 
 
 
166 aa  103  2e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55520  type II secretion system protein  39.24 
 
 
149 aa  82  0.000000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0464256 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4832  general secretion pathway protein H  38.46 
 
 
149 aa  80.1  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3195  general secretion pathway protein H  34.21 
 
 
150 aa  78.6  0.00000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.255687  hitchhiker  0.00307792 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1897  general secretion pathway protein H  31.33 
 
 
172 aa  67.4  0.0000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3107  general secretory pathway H transmembrane protein  38.85 
 
 
165 aa  63.9  0.000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.62689  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2203  general secretion pathway protein H  38.26 
 
 
148 aa  63.5  0.000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0134021  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3045  general secretion pathway protein H  38 
 
 
164 aa  62.4  0.000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.521563  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3392  general secretion pathway protein H  38.73 
 
 
164 aa  60.5  0.00000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5690  general secretion pathway protein H  43.48 
 
 
187 aa  57  0.0000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.138037  normal  0.133551 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0653  general secretion pathway protein H  34.13 
 
 
182 aa  57  0.0000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0219082  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0924  general secretion pathway protein H  38.14 
 
 
151 aa  56.6  0.0000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0280079  normal  0.859469 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0674  general secretion pathway protein H  33.73 
 
 
182 aa  54.7  0.0000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0856392  normal  0.35732 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3522  general secretion pathway protein H  40.96 
 
 
162 aa  53.5  0.000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0510608  normal  0.632823 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3420  general secretion pathway protein H  43.06 
 
 
176 aa  53.9  0.000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000465918 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0763  general secretion pathway protein H  40.58 
 
 
188 aa  51.2  0.000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.612491  normal  0.122141 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1352  general secretion pathway protein H  29.76 
 
 
177 aa  51.2  0.000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2033  general secretion pathway protein H  29.17 
 
 
172 aa  49.7  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2390  general secretion pathway protein H  27.92 
 
 
180 aa  48.9  0.00003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000294923 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0109  general secretion pathway protein H  34.95 
 
 
190 aa  48.9  0.00004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24040  general secretion pathway outer membrane protein H precursor  28.57 
 
 
172 aa  46.6  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4587  general secretion pathway protein H  28.12 
 
 
206 aa  45.8  0.0003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.248042  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3040  general secretion pathway protein H  37.66 
 
 
177 aa  46.2  0.0003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.504644  normal  0.141498 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2922  general secretion pathway protein H  30.47 
 
 
193 aa  45.4  0.0004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.252681  normal  0.157804 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4730  general secretion pathway protein H  30.68 
 
 
193 aa  43.5  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.129836  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1351  general secretion pathway protein G  40.98 
 
 
150 aa  42.4  0.003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.346821  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1322  general secretion pathway protein H  40.98 
 
 
129 aa  42.4  0.003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0898  hypothetical protein  32.48 
 
 
115 aa  42.7  0.003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.725433  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1383  type IV pilin PilE  41.51 
 
 
135 aa  42.4  0.004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.140998  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2588  general secretion pathway protein H  34.27 
 
 
153 aa  42.4  0.004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0722  putative type 4 fimbrial pilin related transmembrane protein  31.45 
 
 
203 aa  42  0.005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.905296 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1302  general secretion pathway protein H  35.38 
 
 
148 aa  41.6  0.006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0108223 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1080  general secretion pathway protein H  43.66 
 
 
154 aa  41.6  0.007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.28383  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0155  general secretion pathway protein H  31.82 
 
 
190 aa  41.2  0.008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4177  general secretion pathway protein G  47.27 
 
 
144 aa  40.8  0.009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.250819  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>