20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpsIP31758_B0019 on replicon NC_009705
Organism: Yersinia pseudotuberculosis IP 31758



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009705  YpsIP31758_B0019  type IV prepilin domain-containing protein PilS  100 
 
 		 175 aa  347  4e-95  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1512  prepilin  37.34 
 
 		 174 aa  86.7  2e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59320  type IV B pilus protein  35.48 
 
 		 176 aa  79  0.00000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00129697  hitchhiker  0.00000000000539359 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4476  type IV B pilus protein  35.48 
 
 		 176 aa  77  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1605  putative type IV pilus biogenesis protein  31.03 
 
 		 184 aa  64.3  0.0000000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0158393  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0651  putative major pilin subunit  31.03 
 
 		 184 aa  64.3  0.0000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0663  putative type IV pilus biogenesis protein  31.03 
 
 		 196 aa  64.3  0.0000000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.655002  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1984  putative type IV pilus biogenesis protein  31.03 
 
 		 196 aa  64.3  0.0000000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2168  putative type IV pilus protein  31.03 
 
 		 196 aa  63.9  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  decreased coverage  0.00445151  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2252  putative type IV pilus protein  30.46 
 
 		 196 aa  61.6  0.000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009704  YpsIP31758_A0065  putative type IV secretion system protein PilS2  32.08 
 
 		 168 aa  59.7  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0112  typeIV prepilin  31.49 
 
 		 204 aa  60.1  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0774  type IV pilus biogenesis protein, putative  31.78 
 
 		 183 aa  53.5  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.406536  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3729  type IV pilus biogenesis protein  32.22 
 
 		 195 aa  52.4  0.000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5446  putative type IV pilus biogenesis protein  31.88 
 
 		 187 aa  47  0.0001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0279047  normal  0.0743907 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1760  PilS domain protein  31.72 
 
 		 184 aa  45.1  0.0005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5875  putative type IV pilus biogenesis protein  32.23 
 
 		 164 aa  43.5  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5245  type IV pilus biogenesis protein, putative  28.68 
 
 		 179 aa  42.4  0.003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.718378  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5690  general secretion pathway protein H  29.11 
 
 		 187 aa  42.4  0.003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.138037  normal  0.133551 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0763  general secretion pathway protein H  28.42 
 
 		 188 aa  41.2  0.008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.612491  normal  0.122141 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>