20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BTH_II0774 on replicon NC_007650
Organism: Burkholderia thailandensis E264



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007650  BTH_II0774  type IV pilus biogenesis protein, putative  100 
 
 		 183 aa  372  1e-102  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.406536  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2168  putative type IV pilus protein  84.78 
 
 		 196 aa  318  3e-86  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  decreased coverage  0.00445151  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1984  putative type IV pilus biogenesis protein  84.78 
 
 		 196 aa  318  3.9999999999999996e-86  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0663  putative type IV pilus biogenesis protein  84.78 
 
 		 196 aa  318  3.9999999999999996e-86  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.655002  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1605  putative type IV pilus biogenesis protein  84.78 
 
 		 184 aa  317  7e-86  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0158393  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0651  putative major pilin subunit  84.78 
 
 		 184 aa  317  7e-86  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2252  putative type IV pilus protein  83.7 
 
 		 196 aa  313  6e-85  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5914  PilS domain-containing protein  51.6 
 
 		 202 aa  173  9.999999999999999e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.353424  hitchhiker  0.00844308 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5875  putative type IV pilus biogenesis protein  53.37 
 
 		 164 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5658  PilS domain-containing protein  48.81 
 
 		 184 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00702859 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5446  putative type IV pilus biogenesis protein  39.18 
 
 		 187 aa  114  1.0000000000000001e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0279047  normal  0.0743907 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5245  type IV pilus biogenesis protein, putative  39.41 
 
 		 179 aa  104  7e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.718378  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2072  putative type IV pilin protein  32.24 
 
 		 185 aa  59.7  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00908282  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2312  putative type IV pilin protein  32.24 
 
 		 185 aa  59.3  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.645033  hitchhiker  0.0000000000000870948 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1760  PilS domain protein  30.18 
 
 		 184 aa  53.9  0.000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009705  YpsIP31758_B0019  type IV prepilin domain-containing protein PilS  31.78 
 
 		 175 aa  53.5  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59320  type IV B pilus protein  29.41 
 
 		 176 aa  45.8  0.0003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00129697  hitchhiker  0.00000000000539359 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4476  type IV B pilus protein  28.68 
 
 		 176 aa  44.3  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1512  prepilin  29.81 
 
 		 174 aa  43.1  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0353  toxin co-regulated pilin  30.69 
 
 		 224 aa  41.6  0.006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>