20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_1760 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013421  Pecwa_1760  PilS domain protein  100 
 
 		 184 aa  370  1e-102  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2072  putative type IV pilin protein  56.85 
 
 		 185 aa  156  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00908282  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2312  putative type IV pilin protein  56.85 
 
 		 185 aa  155  3e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.645033  hitchhiker  0.0000000000000870948 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5914  PilS domain-containing protein  32 
 
 		 202 aa  68.9  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.353424  hitchhiker  0.00844308 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5875  putative type IV pilus biogenesis protein  28.03 
 
 		 164 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1605  putative type IV pilus biogenesis protein  31.65 
 
 		 184 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0158393  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1984  putative type IV pilus biogenesis protein  31.65 
 
 		 196 aa  57  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2252  putative type IV pilus protein  31.65 
 
 		 196 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0663  putative type IV pilus biogenesis protein  31.65 
 
 		 196 aa  57  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.655002  n/a   
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2835  hypothetical protein  24.02 
 
 		 195 aa  56.6  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.486076 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2168  putative type IV pilus protein  31.16 
 
 		 196 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  decreased coverage  0.00445151  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4208  hypothetical protein  25.57 
 
 		 200 aa  56.6  0.0000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0651  putative major pilin subunit  31.16 
 
 		 184 aa  57  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3700  hypothetical protein  27.43 
 
 		 187 aa  55.5  0.0000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.875066 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0774  type IV pilus biogenesis protein, putative  30.18 
 
 		 183 aa  53.9  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.406536  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5658  PilS domain-containing protein  28.74 
 
 		 184 aa  51.2  0.000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00702859 
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0112  typeIV prepilin  28.65 
 
 		 204 aa  51.2  0.000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3729  type IV pilus biogenesis protein  28.36 
 
 		 195 aa  46.2  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009705  YpsIP31758_B0019  type IV prepilin domain-containing protein PilS  31.72 
 
 		 175 aa  45.1  0.0006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1440  type II secretion system protein G  29.91 
 
 		 131 aa  42.7  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0197781  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>