13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_3700 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_3700  hypothetical protein  100 
 
 		 187 aa  379  1e-104  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.875066 
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2835  hypothetical protein  26.4 
 
 		 195 aa  64.3  0.0000000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.486076 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6289  hypothetical protein  28.4 
 
 		 210 aa  61.6  0.000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0281067  normal  1 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4764  hypothetical protein  31.13 
 
 		 200 aa  59.3  0.00000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.974143  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2312  putative type IV pilin protein  30.38 
 
 		 185 aa  55.5  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.645033  hitchhiker  0.0000000000000870948 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1760  PilS domain protein  27.43 
 
 		 184 aa  55.5  0.0000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2072  putative type IV pilin protein  30.38 
 
 		 185 aa  55.1  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00908282  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5875  putative type IV pilus biogenesis protein  32.64 
 
 		 164 aa  52.8  0.000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0112  typeIV prepilin  30.4 
 
 		 204 aa  48.9  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7248  hypothetical protein  28.77 
 
 		 214 aa  47.8  0.00009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4333  putative fimbrial protein  31.4 
 
 		 197 aa  47.4  0.0001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.306906  normal  0.754406 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3729  type IV pilus biogenesis protein  28.46 
 
 		 195 aa  45.8  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5914  PilS domain-containing protein  27.54 
 
 		 202 aa  42  0.005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.353424  hitchhiker  0.00844308 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>