23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeD_A2312 on replicon NC_011205
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011205  SeD_A2312  putative type IV pilin protein  100 
 
 		 185 aa  360  8e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.645033  hitchhiker  0.0000000000000870948 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2072  putative type IV pilin protein  98.38 
 
 		 185 aa  353  7.999999999999999e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00908282  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1760  PilS domain protein  51.1 
 
 		 184 aa  180  1e-44  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3700  hypothetical protein  30.29 
 
 		 187 aa  73.9  0.000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.875066 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4208  hypothetical protein  28.49 
 
 		 200 aa  73.2  0.000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5914  PilS domain-containing protein  34.29 
 
 		 202 aa  72.8  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.353424  hitchhiker  0.00844308 
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2835  hypothetical protein  28.99 
 
 		 195 aa  71.6  0.000000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.486076 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0774  type IV pilus biogenesis protein, putative  32.22 
 
 		 183 aa  71.2  0.000000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.406536  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0651  putative major pilin subunit  30.56 
 
 		 184 aa  67.8  0.00000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2168  putative type IV pilus protein  30.56 
 
 		 196 aa  67.8  0.00000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  decreased coverage  0.00445151  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1984  putative type IV pilus biogenesis protein  30.56 
 
 		 196 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0663  putative type IV pilus biogenesis protein  30.56 
 
 		 196 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.655002  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1605  putative type IV pilus biogenesis protein  30.56 
 
 		 184 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0158393  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5875  putative type IV pilus biogenesis protein  35.14 
 
 		 164 aa  66.6  0.0000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2252  putative type IV pilus protein  30 
 
 		 196 aa  65.9  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5446  putative type IV pilus biogenesis protein  29.12 
 
 		 187 aa  57  0.0000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0279047  normal  0.0743907 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5658  PilS domain-containing protein  31.94 
 
 		 184 aa  51.6  0.000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00702859 
 
 
-
 
NC_009705  YpsIP31758_B0019  type IV prepilin domain-containing protein PilS  28.26 
 
 		 175 aa  50.1  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5245  type IV pilus biogenesis protein, putative  29.12 
 
 		 179 aa  48.1  0.00007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.718378  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1528  general secretion pathway protein J  44 
 
 		 291 aa  45.8  0.0003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.81636  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1892  protein of unknown function DUF1559  32.74 
 
 		 325 aa  44.7  0.0008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0112  typeIV prepilin  29.65 
 
 		 204 aa  43.5  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5180  fimbrial protein pilin  32.89 
 
 		 169 aa  41.2  0.008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.0088813  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>