21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_5658 on replicon NC_010557
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010557  BamMC406_5658  PilS domain-containing protein  100 
 
 		 184 aa  353  6.999999999999999e-97  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00702859 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5875  putative type IV pilus biogenesis protein  96.95 
 
 		 164 aa  283  7e-76  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2252  putative type IV pilus protein  55.56 
 
 		 196 aa  168  3e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0663  putative type IV pilus biogenesis protein  55.56 
 
 		 196 aa  168  4e-41  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.655002  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2168  putative type IV pilus protein  55.56 
 
 		 196 aa  168  4e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  decreased coverage  0.00445151  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1984  putative type IV pilus biogenesis protein  55.56 
 
 		 196 aa  168  4e-41  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1605  putative type IV pilus biogenesis protein  55.56 
 
 		 184 aa  167  5e-41  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0158393  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0651  putative major pilin subunit  55.56 
 
 		 184 aa  167  6e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5914  PilS domain-containing protein  50.6 
 
 		 202 aa  166  1e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.353424  hitchhiker  0.00844308 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0774  type IV pilus biogenesis protein, putative  51.79 
 
 		 183 aa  161  5.0000000000000005e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.406536  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5446  putative type IV pilus biogenesis protein  33.7 
 
 		 187 aa  86.3  2e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0279047  normal  0.0743907 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5245  type IV pilus biogenesis protein, putative  35.36 
 
 		 179 aa  83.6  0.000000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.718378  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1760  PilS domain protein  26.14 
 
 		 184 aa  67.4  0.0000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2072  putative type IV pilin protein  34.69 
 
 		 185 aa  59.3  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00908282  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2312  putative type IV pilin protein  34.72 
 
 		 185 aa  58.5  0.00000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.645033  hitchhiker  0.0000000000000870948 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3700  hypothetical protein  30.95 
 
 		 187 aa  51.2  0.000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.875066 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59320  type IV B pilus protein  29.37 
 
 		 176 aa  50.1  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00129697  hitchhiker  0.00000000000539359 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4208  hypothetical protein  27.03 
 
 		 200 aa  48.5  0.00006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4476  type IV B pilus protein  29.37 
 
 		 176 aa  48.1  0.00006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009705  YpsIP31758_B0019  type IV prepilin domain-containing protein PilS  29.37 
 
 		 175 aa  44.3  0.001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4764  hypothetical protein  27.27 
 
 		 200 aa  42.4  0.004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.974143  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>