59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcryo_0371 on replicon NC_007969
Organism: Psychrobacter cryohalolentis K5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007969  Pcryo_0371  pilus assembly protein FimT-like  100 
 
 		 195 aa  407  1e-113  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0210439  normal  0.0271791 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0337  hypothetical protein  87.69 
 
 		 195 aa  346  1e-94  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0256489  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0378  hypothetical protein  46.55 
 
 		 217 aa  160  1e-38  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000913387  hitchhiker  0.000267093 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0262  putative pilin protein FimT  34.56 
 
 		 155 aa  67.4  0.0000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.691948 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0233  type IV pilin protein  48.53 
 
 		 152 aa  64.7  0.0000000008  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3028  methylation site containing protein  31.25 
 
 		 170 aa  61.2  0.00000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.811666 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2946  methylation site containing protein  31.25 
 
 		 170 aa  61.2  0.00000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.105075  normal  0.412318 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3125  methylation site containing protein  31.25 
 
 		 170 aa  58.5  0.00000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.287343  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0670  Tfp pilus assembly protein FimT-like protein  29.56 
 
 		 214 aa  57.4  0.0000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.648692  normal  0.521585 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1070  methylation site containing protein  27.33 
 
 		 170 aa  57.8  0.0000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0873  Tfp pilus assembly protein FimT  25.95 
 
 		 190 aa  57.8  0.0000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.160532  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2876  methylation  29.65 
 
 		 200 aa  55.8  0.0000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.323846  normal  0.549514 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0934  type IV pilus biogenesis protein, putative  27.38 
 
 		 170 aa  55.8  0.0000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.153774  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0713  Tfp pilus assembly protein FimT-like protein  28.93 
 
 		 214 aa  54.7  0.000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.687986 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0670  hypothetical protein  38.46 
 
 		 171 aa  53.5  0.000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.177225  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1109  type IV pilus biogenesis protein, putative  27.38 
 
 		 170 aa  53.9  0.000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.014946  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1205  type IV pilus biogenesis protein, putative  25.73 
 
 		 169 aa  53.9  0.000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1094  type IV pilus biogenesis protein, putative  27.16 
 
 		 170 aa  52.4  0.000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2881  methylation site containing protein  28.04 
 
 		 170 aa  51.6  0.000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0007  putative type-4 fimbrial pilin related signal peptide protein  31.3 
 
 		 173 aa  51.6  0.000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.24859  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1132  type IV pilus biogenesis protein, putative  28.24 
 
 		 170 aa  51.2  0.00001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3224  type IV pilus biogenesis protein, putative  28.24 
 
 		 170 aa  50.1  0.00002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1167  type IV pilus biogenesis protein, putative  27.65 
 
 		 170 aa  50.1  0.00002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.350797 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0866  putative type-4 fimbrial pilin related signal peptide protein  26.4 
 
 		 194 aa  50.1  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.197322  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3919  putative type IV pilus biogenesis protein  26.71 
 
 		 208 aa  49.7  0.00003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.159309  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2159  Tfp pilus assembly protein FimT  35.87 
 
 		 206 aa  48.1  0.00007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000106195  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05337  putative type-4 fimbrial pilin related signal peptide protein  26.67 
 
 		 181 aa  48.5  0.00007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.693608 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5187  putative type-4 fimbrial pilin related signal peptide protein  28.43 
 
 		 187 aa  48.1  0.00008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2877  methylation  31.15 
 
 		 192 aa  47.8  0.00009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.169243  normal  0.567354 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2522  methylation  37.88 
 
 		 179 aa  48.1  0.00009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0971  general secretion pathway protein H  37.88 
 
 		 173 aa  47.4  0.0001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3230  fimbrial pilin related signal peptide protein  34.72 
 
 		 171 aa  47.8  0.0001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.591415  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0214  pre-pilin like leader sequence  33.82 
 
 		 172 aa  47.4  0.0001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0250023 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2712  type IV pilus biogenesis protein, putative  27.38 
 
 		 170 aa  46.6  0.0002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000750453  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3181  N-terminal methylation site  30.88 
 
 		 175 aa  47  0.0002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0019  pre-pilin like leader sequence  30.69 
 
 		 191 aa  47  0.0002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.808404  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2915  putative type 4 fimbrial pilin related transmembrane protein  34.85 
 
 		 157 aa  46.2  0.0003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1864  pilus assembly protein  33.82 
 
 		 172 aa  45.4  0.0004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01320  pre-pilin like leader sequence  30.48 
 
 		 157 aa  44.7  0.0008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.401301  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1302  type IV pilus biogenesis protein, putative  23.81 
 
 		 169 aa  44.3  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.391633 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2664  fimbrial biogenesis protein  37.7 
 
 		 178 aa  44.7  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.470161  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3126  methylation site containing protein  34.85 
 
 		 160 aa  44.7  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2947  methylation site containing protein  34.85 
 
 		 160 aa  44.3  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0992621  normal  0.405183 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004287  type 4 fimbrial biogenesis protein FimT  35.48 
 
 		 168 aa  43.9  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0215  hypothetical protein  36.25 
 
 		 174 aa  43.9  0.002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0562308 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2905  Tfp pilus assembly protein FimT  38.1 
 
 		 212 aa  43.5  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.538943 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1301  type IV pilus biogenesis protein, putative  24.12 
 
 		 177 aa  43.9  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.397112 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1507  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  54.05 
 
 		 121 aa  43.9  0.002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000010883  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2827  Tfp pilus assembly protein  35.19 
 
 		 192 aa  43.5  0.002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0658085 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2270  putative type-4 fimbrial pilin related signal peptide protein  36.92 
 
 		 187 aa  43.5  0.002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0783  general secretion pathway protein H  28.42 
 
 		 182 aa  43.9  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3828  methylation site containing protein  22.03 
 
 		 172 aa  42.7  0.003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000000112537  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4158  general secretion pathway protein G  33.33 
 
 		 151 aa  42.4  0.004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000753103 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1108  methylation site containing protein  32.31 
 
 		 163 aa  42.4  0.005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.105316  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3520  type IV pilus biogenesis protein, putative  23.53 
 
 		 170 aa  42.4  0.005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2613  putative general secretion pathway protein G precursor (PilD-dependent protein pddA)  36 
 
 		 163 aa  41.6  0.007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1093  type IV pilus biogenesis protein, putative  27.71 
 
 		 178 aa  41.6  0.008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1378  putative type IV pilus assembly protein FimT  25.89 
 
 		 171 aa  41.2  0.009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.142156  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1073  general secretion pathway protein G  33.33 
 
 		 155 aa  41.2  0.01  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.56277  normal  0.328419 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>