40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_2588 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_2588  general secretion pathway protein H  100 
 
 		 153 aa  296  9e-80  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1352  general secretion pathway protein H  24.24 
 
 		 177 aa  52.8  0.000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24040  general secretion pathway outer membrane protein H precursor  31.9 
 
 		 172 aa  51.6  0.000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2033  general secretion pathway protein H  31.9 
 
 		 172 aa  51.6  0.000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0385  general secretion pathway protein H  35.24 
 
 		 178 aa  50.1  0.00001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.558867 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2922  general secretion pathway protein H  35.42 
 
 		 193 aa  49.7  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.252681  normal  0.157804 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4496  general secretion pathway protein H  34.09 
 
 		 193 aa  49.3  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.818073  normal  0.141626 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0109  general secretion pathway protein H  26.47 
 
 		 190 aa  46.6  0.0001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0013  general secretion pathway protein H  34.52 
 
 		 199 aa  45.8  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1885  general secretion pathway protein H  34.52 
 
 		 199 aa  45.8  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.096237  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3513  general secretion pathway protein H  34.52 
 
 		 199 aa  45.8  0.0002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0013  general secretion pathway protein H  34.52 
 
 		 199 aa  45.8  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.036848  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2667  general secretion pathway protein H  34.52 
 
 		 199 aa  45.8  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.668264  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3941  general secretion pathway protein H  34.69 
 
 		 193 aa  45.8  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.1806 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2203  general secretion pathway protein H  36.25 
 
 		 148 aa  46.2  0.0002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0134021  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0225  general secretion pathway protein H  34.52 
 
 		 199 aa  45.8  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2780  general secretion pathway protein H  34.52 
 
 		 196 aa  45.8  0.0002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3195  general secretion pathway protein H  28.47 
 
 		 150 aa  45.1  0.0004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.255687  hitchhiker  0.00307792 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4730  general secretion pathway protein H  22.73 
 
 		 193 aa  44.3  0.0006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.129836  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4832  general secretion pathway protein H  31.06 
 
 		 149 aa  44.3  0.0007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4587  general secretion pathway protein H  23.36 
 
 		 206 aa  43.9  0.0008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.248042  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3075  general secretion pathway protein H  33.66 
 
 		 191 aa  42.7  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000021149 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2373  general secretion pathway protein H  33.8 
 
 		 187 aa  42.4  0.002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.495108  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0012  general secretion pathway protein H  32.14 
 
 		 196 aa  42.4  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1383  general secretion pathway protein H  36.78 
 
 		 134 aa  42.7  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.364333  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1074  general secretion pathway protein H  34.27 
 
 		 177 aa  42  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.822718  normal  0.19806 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1047  general secretion pathway protein H  30.14 
 
 		 143 aa  42  0.003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2390  general secretion pathway protein H  32.39 
 
 		 180 aa  41.6  0.004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000294923 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0319  general secretion pathway protein H  34.29 
 
 		 162 aa  41.6  0.004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0058  general secretion pathway protein H  36.05 
 
 		 210 aa  41.6  0.004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55520  type II secretion system protein  32.35 
 
 		 149 aa  41.2  0.005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0464256 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0057  general secretion pathway protein H  34.78 
 
 		 189 aa  41.2  0.006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.128144  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0076  general secretion pathway protein H  34.78 
 
 		 189 aa  40.8  0.006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.692629  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0013  general secretion pathway protein H  34.78 
 
 		 189 aa  41.2  0.006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3563  general secretion pathway protein H  20.59 
 
 		 190 aa  40.8  0.007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0057  general secretion pathway protein H  34.78 
 
 		 182 aa  40.4  0.008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.12302  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3239  general secretion pathway protein H  34.88 
 
 		 189 aa  40.4  0.008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.707083 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0215  hypothetical protein  30.84 
 
 		 174 aa  40.4  0.009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0562308 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0155  general secretion pathway protein H  20.79 
 
 		 190 aa  40.4  0.01  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2344  hypothetical protein  24.37 
 
 		 164 aa  40.4  0.01  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>