30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_1383 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_1383  general secretion pathway protein H  100 
 
 		 134 aa  261  2e-69  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.364333  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0319  general secretion pathway protein H  42.54 
 
 		 162 aa  82.4  0.000000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2780  general secretion pathway protein H  40.86 
 
 		 196 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2667  general secretion pathway protein H  40.86 
 
 		 199 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.668264  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0013  general secretion pathway protein H  40.86 
 
 		 199 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.036848  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0013  general secretion pathway protein H  40.86 
 
 		 199 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1885  general secretion pathway protein H  40.86 
 
 		 199 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.096237  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3513  general secretion pathway protein H  40.86 
 
 		 199 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0225  general secretion pathway protein H  40.86 
 
 		 199 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0012  general secretion pathway protein H  39.78 
 
 		 196 aa  57  0.00000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4496  general secretion pathway protein H  44.59 
 
 		 193 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.818073  normal  0.141626 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0109  general secretion pathway protein H  32 
 
 		 190 aa  50.4  0.000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3941  general secretion pathway protein H  43.24 
 
 		 193 aa  50.4  0.000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.1806 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4730  general secretion pathway protein H  31.08 
 
 		 193 aa  47  0.0001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.129836  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0155  general secretion pathway protein H  29.33 
 
 		 190 aa  45.8  0.0002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2203  general secretion pathway protein H  38.67 
 
 		 148 aa  46.2  0.0002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0134021  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0125  general secretion pathway protein H  35.29 
 
 		 195 aa  43.9  0.0007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3563  general secretion pathway protein H  28.38 
 
 		 190 aa  43.9  0.0008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0170  general secretion pathway protein H  29.33 
 
 		 190 aa  43.1  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2922  general secretion pathway protein H  34.83 
 
 		 193 aa  43.1  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.252681  normal  0.157804 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2588  general secretion pathway protein H  36.78 
 
 		 153 aa  43.5  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0157  general secretion pathway protein H  28 
 
 		 191 aa  42.4  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0157  general secretion pathway protein H  28 
 
 		 204 aa  42.7  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0543101 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0153  general secretion pathway protein H  28 
 
 		 191 aa  42.4  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4202  general secretion pathway protein H  28 
 
 		 191 aa  42.4  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3195  general secretion pathway protein H  32.5 
 
 		 150 aa  42.4  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.255687  hitchhiker  0.00307792 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0101  general secretion pathway protein H  38.46 
 
 		 181 aa  42.4  0.002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2390  general secretion pathway protein H  34.78 
 
 		 180 aa  42.7  0.002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000294923 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3222  general secretion pathway protein H  33.78 
 
 		 166 aa  42  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1352  general secretion pathway protein H  29.91 
 
 		 177 aa  41.2  0.005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>