55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_1412 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_1412  outer membrane secretion protein U  100 
 
 		 168 aa  319  9.999999999999999e-87  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0334434  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2922  general secretion pathway protein H  44.44 
 
 		 193 aa  97.4  7e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.252681  normal  0.157804 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24040  general secretion pathway outer membrane protein H precursor  38.92 
 
 		 172 aa  85.5  4e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2033  general secretion pathway protein H  39.16 
 
 		 172 aa  84  9e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1352  general secretion pathway protein H  32.72 
 
 		 177 aa  77  0.0000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0235  general secretion pathway protein H  29.17 
 
 		 202 aa  67.4  0.0000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4587  general secretion pathway protein H  28.33 
 
 		 206 aa  59.3  0.00000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.248042  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1303  general secretion pathway protein H  33.76 
 
 		 179 aa  58.5  0.00000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3563  general secretion pathway protein H  28.03 
 
 		 190 aa  54.7  0.0000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2390  general secretion pathway protein H  33.78 
 
 		 180 aa  54.7  0.0000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000294923 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2920  general secretion pathway protein H precursor  29.49 
 
 		 198 aa  54.3  0.0000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0155  general secretion pathway protein H  26.92 
 
 		 190 aa  53.5  0.000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0170  general secretion pathway protein H  28.4 
 
 		 190 aa  52.8  0.000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0109  general secretion pathway protein H  26.45 
 
 		 190 aa  51.6  0.000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0384  general secretion pathway protein H  28.3 
 
 		 169 aa  51.2  0.000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.105042 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3523  general secretion pathway protein H  28.3 
 
 		 169 aa  51.2  0.000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0384  general secretion pathway protein H  28.3 
 
 		 169 aa  50.8  0.000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0157  general secretion pathway protein H  26.92 
 
 		 204 aa  50.8  0.000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0543101 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4202  general secretion pathway protein H  26.92 
 
 		 191 aa  50.8  0.000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0153  general secretion pathway protein H  26.92 
 
 		 191 aa  50.8  0.000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0157  general secretion pathway protein H  26.92 
 
 		 191 aa  50.8  0.000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4730  general secretion pathway protein H  26.83 
 
 		 193 aa  50.4  0.00001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.129836  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2373  general secretion pathway protein H  32.39 
 
 		 187 aa  49.7  0.00002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.495108  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03960  putative general secretion pathway protein H precursor  27.07 
 
 		 208 aa  49.7  0.00002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2302  general secretion pathway protein H  31.29 
 
 		 194 aa  49.7  0.00002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03131  hypothetical protein  27.67 
 
 		 169 aa  48.9  0.00003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03180  predicted general secretory pathway component, cryptic  27.67 
 
 		 169 aa  48.9  0.00003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3243  general secretion pathway protein GspH  23.17 
 
 		 187 aa  48.5  0.00004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.793793 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5690  general secretion pathway protein H  31.29 
 
 		 187 aa  48.9  0.00004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.138037  normal  0.133551 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0653  general secretion pathway protein H  35.11 
 
 		 182 aa  47.8  0.00007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0219082  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0674  general secretion pathway protein H  35.11 
 
 		 182 aa  47.8  0.00007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0856392  normal  0.35732 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1474  general secretion pathway protein H  29.49 
 
 		 179 aa  47.4  0.00008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0651  hypothetical protein  30.67 
 
 		 156 aa  45.4  0.0003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3134  general secretion pathway protein H  23.17 
 
 		 187 aa  45.4  0.0003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02834  GspH, hypothetical type II secretion protein  23.17 
 
 		 187 aa  45.4  0.0004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000472105  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0178  prepilin-type cleavage/methylation  31.01 
 
 		 188 aa  44.7  0.0005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3423  general secretion pathway protein H  22.56 
 
 		 187 aa  44.7  0.0006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3408  general secretion pathway protein GspH  23.17 
 
 		 187 aa  44.7  0.0006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0012  general secretion pathway protein H  33.71 
 
 		 196 aa  44.7  0.0007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0013  general secretion pathway protein H  34.57 
 
 		 199 aa  43.1  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.036848  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0013  general secretion pathway protein H  34.57 
 
 		 199 aa  43.1  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4176  general secretion pathway protein H  35.45 
 
 		 145 aa  43.1  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.969012  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2667  general secretion pathway protein H  34.57 
 
 		 199 aa  43.1  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.668264  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2780  general secretion pathway protein H  34.57 
 
 		 196 aa  43.1  0.002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1885  general secretion pathway protein H  34.57 
 
 		 199 aa  43.1  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.096237  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0225  general secretion pathway protein H  34.57 
 
 		 199 aa  43.1  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3513  general secretion pathway protein H  34.57 
 
 		 199 aa  43.1  0.002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0763  general secretion pathway protein H  27.41 
 
 		 188 aa  42  0.004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.612491  normal  0.122141 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0475  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  40 
 
 		 171 aa  41.6  0.006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1422  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  30.43 
 
 		 169 aa  41.2  0.007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4247  general secretion pathway protein H  30 
 
 		 177 aa  41.2  0.008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0707676 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0340  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  39.47 
 
 		 165 aa  40.8  0.009  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0173  general secretion pathway protein H  29.49 
 
 		 189 aa  40.8  0.009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1312  type II secretory pathway protein LspH  27.59 
 
 		 161 aa  40.8  0.01  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0548  hypothetical protein  28.21 
 
 		 169 aa  40.8  0.01  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>