More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PsycPRwf_2019 on replicon NC_009524
Organism: Psychrobacter sp. PRwf-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009524  PsycPRwf_2019  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  100 
 
 		 130 aa  270  6e-72  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03468  Tfp pilus assembly protein major pilin PilA  54.39 
 
 		 141 aa  64.7  0.0000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2629  type IV pilus subunit PilA  52.46 
 
 		 138 aa  62.8  0.000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0927  type IV pilus biogenesis protein  40.28 
 
 		 142 aa  61.6  0.000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2200  pilus assembly protein PilA  50.94 
 
 		 111 aa  61.2  0.000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.360457  hitchhiker  0.000654211 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0475  fimbrial protein pilin  50 
 
 		 139 aa  60.1  0.00000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.665132  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4536  fimbrial protein pilin  46.15 
 
 		 136 aa  58.9  0.00000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5161  type IV pilin structural subunit  45.71 
 
 		 179 aa  58.9  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3918  methylation site containing protein  36.63 
 
 		 143 aa  59.3  0.00000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000265425  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0634  fimbrial protein pilin  44.62 
 
 		 136 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0675  fimbrial protein pilin  44.62 
 
 		 136 aa  58.2  0.00000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0357739 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2540  general secretion pathway protein H  67.44 
 
 		 147 aa  58.5  0.00000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.13206  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1999  fimbrial protein  56 
 
 		 153 aa  58.5  0.00000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3575  putative major pilin subunit  63.16 
 
 		 148 aa  57.8  0.00000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.270372  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0680  fimbrial protein pilin  38.64 
 
 		 136 aa  57.4  0.00000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2680  fimbrial protein pilin  67.44 
 
 		 169 aa  57.4  0.00000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0726827  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002546  type IV pilin PilA  71.43 
 
 		 157 aa  57.4  0.00000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.790868  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3356  fimbrial protein pilin: general secretion pathway protein H  57.78 
 
 		 137 aa  57  0.00000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.669833  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3344  prepilin-type cleavage/methylation  47.83 
 
 		 148 aa  57.4  0.00000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.62769  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3387  fgenesh4_pg.C_scaffold_2883000002  57.78 
 
 		 196 aa  57.4  0.00000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.437334  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3896  Fimbrial protein pilin  50 
 
 		 133 aa  56.2  0.0000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2126  methylation  73.53 
 
 		 146 aa  57  0.0000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.196428  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4782  Tfp pilus assembly protein  70.59 
 
 		 179 aa  56.6  0.0000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.26372 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4679  Tfp pilus assembly protein major pilin PilA  72.73 
 
 		 168 aa  56.6  0.0000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3945  fimbrial protein pilin  68.57 
 
 		 166 aa  56.2  0.0000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.373423  hitchhiker  0.00130999 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4444  type IV pilin  68.57 
 
 		 160 aa  55.8  0.0000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2523  methylation  50 
 
 		 141 aa  55.8  0.0000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2540  fimbrial protein pilin  51.85 
 
 		 140 aa  55.5  0.0000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58730  type IV pilin structural subunit  69.7 
 
 		 179 aa  56.2  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.279942  normal  0.457351 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3946  fimbrial protein pilin  69.7 
 
 		 169 aa  55.5  0.0000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00129399 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0558  type 4 fimbrial pilin signal peptide protein  53.85 
 
 		 168 aa  55.5  0.0000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.791178  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4819  general secretion pathway protein H  44.62 
 
 		 138 aa  55.5  0.0000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.80083  normal  0.111143 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4674  methylation  65.71 
 
 		 169 aa  55.1  0.0000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.953976  normal  0.930835 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0480  pilin subfamily protein  41.49 
 
 		 174 aa  55.5  0.0000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4040  fimbrial protein pilin  76.67 
 
 		 178 aa  55.1  0.0000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.736529  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0799  fimbrial protein pilin  41.1 
 
 		 139 aa  54.7  0.0000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0744296  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0864  pilin  60.47 
 
 		 163 aa  54.7  0.0000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.484071 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0476  methylation site containing protein  69.7 
 
 		 141 aa  55.1  0.0000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.991113  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0478  type 4 fimbrial pilin signal peptide protein  76.67 
 
 		 169 aa  54.7  0.0000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.322644  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1828  fimbrial protein pilin  41.79 
 
 		 170 aa  54.3  0.0000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.10224  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0250  fimbrial subunit  45.31 
 
 		 152 aa  54.3  0.0000005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0333044  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0478  prepilin peptidase dependent protein D  48 
 
 		 134 aa  54.3  0.0000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.183909  normal  0.878303 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0557  type 4 fimbrial pilin signal peptide protein  76.67 
 
 		 173 aa  53.9  0.0000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0414  methylation site containing protein  43.4 
 
 		 148 aa  53.9  0.0000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0126  Tfp pilus assembly protein PilE-like  62.16 
 
 		 151 aa  53.9  0.0000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0148502  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3944  fimbrial protein pilin  58.14 
 
 		 166 aa  53.9  0.0000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.736158  hitchhiker  0.00123211 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4155  fimbiral protein PilA  47.69 
 
 		 188 aa  53.9  0.0000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.614605  normal  0.158719 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5185  protein involved in methylation  69.7 
 
 		 174 aa  53.5  0.0000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.101493  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2449  Fimbrial protein pilin  67.65 
 
 		 162 aa  53.9  0.0000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.000426279  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1265  methylation  71.88 
 
 		 160 aa  53.5  0.0000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00964428  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00107  predicted major pilin subunit  57.89 
 
 		 146 aa  53.1  0.000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.686894  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3494  putative major pilin subunit  57.89 
 
 		 146 aa  53.1  0.000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0110  putative major pilin subunit  57.89 
 
 		 146 aa  53.1  0.000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000976692  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1510  fimbrial protein  76.67 
 
 		 138 aa  53.1  0.000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  unclonable  0.0000000690325  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3551  putative major pilin subunit  57.89 
 
 		 146 aa  53.1  0.000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000125636 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00106  hypothetical protein  57.89 
 
 		 146 aa  53.1  0.000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0652  putative major pilin subunit  55.26 
 
 		 145 aa  52.8  0.000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1383  type IV pilin PilE  34.38 
 
 		 135 aa  53.1  0.000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.140998  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1280  hypothetical protein  44.26 
 
 		 152 aa  52.8  0.000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3388  methylation  44.23 
 
 		 138 aa  53.1  0.000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0114  putative major pilin subunit  57.89 
 
 		 146 aa  53.1  0.000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00878541  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0111  putative major pilin subunit  57.89 
 
 		 146 aa  53.1  0.000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.273778  normal  0.482641 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0627  putative major pilin subunit  45.28 
 
 		 147 aa  52.8  0.000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3189  fimbrial protein pilin  48.15 
 
 		 162 aa  53.1  0.000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.208  normal  0.535395 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0314  general secretion pathway protein  47.92 
 
 		 147 aa  53.5  0.000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5180  fimbrial protein pilin  57.89 
 
 		 169 aa  52.4  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.0088813  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1041  putative major pilin subunit  63.16 
 
 		 154 aa  52.4  0.000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.131052 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0816  type IV pilus biogenesis protein  53.49 
 
 		 133 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0164  putative major pilin subunit  57.89 
 
 		 145 aa  52.8  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.268979  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0720  fimbrial protein pilin  50 
 
 		 133 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3498  putative major pilin subunit  63.16 
 
 		 154 aa  52.4  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1865  pilus assembly protein  73.33 
 
 		 134 aa  52.4  0.000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0158  putative major pilin subunit  57.89 
 
 		 145 aa  52.8  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.320147 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0485  fimbrial protein pilin  62.86 
 
 		 136 aa  52.4  0.000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0156  putative major pilin subunit  57.89 
 
 		 145 aa  52.8  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0065  pilin  55.56 
 
 		 170 aa  52.4  0.000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.154072 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0463  type 4 fimbrial pilin signal peptide protein  49.12 
 
 		 167 aa  52.4  0.000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.961425  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3370  putative major pilin subunit  63.16 
 
 		 154 aa  52.4  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.981789  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0161  putative major pilin subunit  57.89 
 
 		 145 aa  52.8  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60320  type 4 fimbrial biogenesis protein PilE  45.9 
 
 		 141 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000362369 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0157  putative major pilin subunit  57.89 
 
 		 145 aa  52.8  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1442  Tfp pilus assembly protein major pilin PilA-like protein  44.44 
 
 		 155 aa  52  0.000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.102563  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12104  fimbrial protein  61.76 
 
 		 165 aa  51.6  0.000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.246946  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5198  fimbrial protein pilin  61.11 
 
 		 148 aa  52  0.000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0472  fimbrial protein pilin  58.54 
 
 		 182 aa  52  0.000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.877435  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1371  hypothetical protein  43.08 
 
 		 174 aa  52  0.000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0872  general secretion pathway protein H  51.16 
 
 		 152 aa  52  0.000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.854476  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0417  pilin, putative  72.41 
 
 		 138 aa  51.6  0.000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0421  methylation site containing protein  72.41 
 
 		 142 aa  51.6  0.000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000175547  normal  0.0256712 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1495  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  35.16 
 
 		 167 aa  51.6  0.000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.70798  normal  0.112729 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0613  Type II secretory pathway pseudopilin PulG-like protein  38.78 
 
 		 165 aa  51.2  0.000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0934015 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3175  Fimbrial protein pilin  44.83 
 
 		 134 aa  51.2  0.000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0666  putative major pilin subunit  60 
 
 		 147 aa  50.8  0.000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0788  putative pilus assembly protein major pilin PilA  40 
 
 		 79 aa  50.8  0.000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0173637  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0467  type 4 fimbrial pilin signal peptide protein  61.76 
 
 		 171 aa  50.8  0.000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.568157  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0477  prepilin-type cleavage/methylation  60.61 
 
 		 148 aa  50.4  0.000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.695821  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0461  fimbrial protein precursor PilE (MS11 antigen)  34.26 
 
 		 167 aa  50.1  0.000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.653734  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2663  type IV pilus biogenesis protein PilE  61.11 
 
 		 142 aa  50.4  0.000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.839094  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1088  hypothetical protein  44.44 
 
 		 338 aa  50.1  0.000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0477  putative type 4 fimbrial pilin signal peptide protein  75 
 
 		 173 aa  50.1  0.000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0748911  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>