56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_0994 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010424  Daud_0994  N-terminal methylation protein  100 
 
 
159 aa  319  9.000000000000001e-87  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1025  hypothetical protein  32.67 
 
 
165 aa  72.4  0.000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2705  hypothetical protein  38.78 
 
 
157 aa  69.7  0.00000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.349315 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0486  pilin assembly protein  31.71 
 
 
167 aa  61.2  0.000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00295768  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0971  general secretion pathway protein H  31.79 
 
 
173 aa  60.8  0.000000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1549  N-terminal methylation  32.05 
 
 
168 aa  60.5  0.000000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.143316 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1122  hypothetical protein  29.33 
 
 
156 aa  54.7  0.0000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.711782  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0525  pilin assembly protein  31.3 
 
 
132 aa  53.9  0.0000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0877  N-terminal methylation motif domain protein  40.3 
 
 
142 aa  52.4  0.000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0878  N-terminal methylation motif domain protein  38.81 
 
 
142 aa  51.2  0.000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3286  hypothetical protein  35.37 
 
 
187 aa  49.7  0.00002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.558996  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0810  type IV pilus biogenesis protein  28.12 
 
 
166 aa  48.9  0.00003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5190  type 4 fimbrial biogenesis protein FimU  32.31 
 
 
168 aa  48.1  0.00005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.875037  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1723  N-terminal methylation  26.8 
 
 
156 aa  47  0.0001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.370416  normal  0.0331224 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3549  Tfp pilus assembly protein FimT  38.46 
 
 
201 aa  45.8  0.0002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.631889  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1027  prepilin-type N-terminal cleavage/methylation domain protein  27.15 
 
 
159 aa  45.4  0.0003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.846446  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2827  Tfp pilus assembly protein  26.51 
 
 
192 aa  45.4  0.0003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0658085 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0654  general secretion pathway protein G  44.78 
 
 
159 aa  44.7  0.0005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0121173  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0675  general secretion pathway protein G  44.78 
 
 
159 aa  44.7  0.0005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.186648  normal  0.343045 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2876  methylation  27.75 
 
 
200 aa  44.7  0.0006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.323846  normal  0.549514 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1509  hypothetical protein  26.67 
 
 
152 aa  44.3  0.0007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000890292  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0534  hypothetical protein  40.62 
 
 
140 aa  43.9  0.0009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0015  Tfp pilus assembly protein FimT-like protein  29.31 
 
 
192 aa  43.9  0.0009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1863  hypothetical protein  34.92 
 
 
176 aa  43.5  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2678  hypothetical protein  34.85 
 
 
167 aa  43.5  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000820261 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08271  hypothetical protein  35.42 
 
 
168 aa  43.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.125475  hitchhiker  0.0000413407 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1094  type IV pilus biogenesis protein, putative  26.63 
 
 
170 aa  43.5  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3218  general secretion pathway protein G  30.38 
 
 
126 aa  43.5  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.427151 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1205  type IV pilus biogenesis protein, putative  26.71 
 
 
169 aa  42.7  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3074  general secretion pathway protein G  37.33 
 
 
158 aa  43.1  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000016497 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1070  methylation site containing protein  26.19 
 
 
170 aa  42.7  0.002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24040  general secretion pathway outer membrane protein H precursor  33.33 
 
 
172 aa  42.4  0.003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03018  hypothetical protein  25.62 
 
 
184 aa  42  0.003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1440  type II secretion system protein G  31.91 
 
 
131 aa  42  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0197781  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3616  general secretion pathway protein G  29.41 
 
 
144 aa  42.4  0.003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1999  general secretion pathway protein G  57.14 
 
 
131 aa  42.4  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.607295  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2033  general secretion pathway protein H  33.33 
 
 
172 aa  42.4  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29080  general secretion pathway protein G  30.77 
 
 
124 aa  41.6  0.004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0685  general secretion pathway protein H  31.82 
 
 
148 aa  41.6  0.004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0277162 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5689  general secretion pathway protein G  41.67 
 
 
158 aa  41.6  0.005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.128164  normal  0.128064 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1081  general secretion pathway protein G  38.57 
 
 
146 aa  41.2  0.005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.464773  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3553  hypothetical protein  26.92 
 
 
171 aa  41.2  0.006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3536  hypothetical protein  30.63 
 
 
158 aa  41.2  0.006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0864  methylation site containing protein  38.46 
 
 
145 aa  40.8  0.007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0925  general secretion pathway protein G  42.37 
 
 
162 aa  40.8  0.007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0172546  normal  0.856291 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0714  type IV pilus biogenesis protein  26.25 
 
 
166 aa  40.8  0.008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3128  general secretion pathway protein G  41.67 
 
 
165 aa  40.8  0.008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0729977 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1351  general secretion pathway protein G  32.26 
 
 
150 aa  40.8  0.009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.346821  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1473  general secretion pathway protein G  27.94 
 
 
150 aa  40.4  0.009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.660645  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0907  hypothetical protein  32.81 
 
 
172 aa  40.4  0.009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0872  hypothetical protein  32.81 
 
 
172 aa  40.4  0.009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0898  hypothetical protein  32.81 
 
 
172 aa  40.4  0.01  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1460  type II secretion system protein G  44.44 
 
 
153 aa  40.4  0.01  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.52288  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3464  hypothetical protein  32.81 
 
 
172 aa  40.4  0.01  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0534  general secretion pathway protein G  38.71 
 
 
147 aa  40.4  0.01  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1805  hypothetical protein  24.79 
 
 
159 aa  40.4  0.01  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>