187 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_3254 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008709  Ping_3254  pilin, putative  100 
 
 		 152 aa  308  2e-83  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0864  methylation site containing protein  40.28 
 
 		 145 aa  98.2  4e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0852  methylation site containing protein  40.28 
 
 		 145 aa  97.4  6e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.992733 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0829  methylation site containing protein  40.28 
 
 		 145 aa  97.4  6e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0853  pilin, putative  36.36 
 
 		 144 aa  80.9  0.000000000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3313  methylation site containing protein  35.1 
 
 		 144 aa  80.5  0.000000000000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.936741  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0709  methylation site containing protein  35.1 
 
 		 144 aa  80.1  0.000000000000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3425  methylation site containing protein  37.24 
 
 		 144 aa  80.1  0.000000000000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2679  putative type 4 fimbrial pilin related transmembrane protein  31.61 
 
 		 157 aa  67.8  0.00000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.171677 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2915  putative type 4 fimbrial pilin related transmembrane protein  31.58 
 
 		 157 aa  66.2  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0722  putative type 4 fimbrial pilin related transmembrane protein  37.18 
 
 		 203 aa  64.3  0.0000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.905296 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5193  N-terminal methylation site-containing protein  31.06 
 
 		 188 aa  62.4  0.000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.17462  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0214  pre-pilin like leader sequence  28.75 
 
 		 172 aa  62.4  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0250023 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3229  Tfp pilus assembly protein  27.89 
 
 		 147 aa  61.2  0.000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2877  methylation  37.23 
 
 		 192 aa  60.5  0.000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.169243  normal  0.567354 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60280  type 4 fimbrial biogenesis protein FimU  32.14 
 
 		 162 aa  60.5  0.000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000431898 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1378  putative type IV pilus assembly protein FimT  31.95 
 
 		 171 aa  60.1  0.00000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.142156  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0810  type IV pilus biogenesis protein  36.49 
 
 		 166 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2827  Tfp pilus assembly protein  33.33 
 
 		 192 aa  58.5  0.00000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0658085 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2270  putative type-4 fimbrial pilin related signal peptide protein  29.11 
 
 		 187 aa  58.2  0.00000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3549  Tfp pilus assembly protein FimT  33.66 
 
 		 201 aa  58.2  0.00000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.631889  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0253  putative type-4 fimbrial pilin related signal peptide protein  38.36 
 
 		 168 aa  57.8  0.00000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3230  fimbrial pilin related signal peptide protein  26.24 
 
 		 171 aa  57.8  0.00000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.591415  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0714  type IV pilus biogenesis protein  35 
 
 		 166 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3181  N-terminal methylation site  28.85 
 
 		 175 aa  57  0.0000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0091  hypothetical protein  30 
 
 		 182 aa  55.8  0.0000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.152728  n/a   
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0007  putative type-4 fimbrial pilin related signal peptide protein  35.71 
 
 		 173 aa  55.8  0.0000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.24859  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4847  hypothetical protein  33.72 
 
 		 157 aa  54.7  0.0000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.603969 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2159  Tfp pilus assembly protein FimT  34.15 
 
 		 206 aa  53.9  0.0000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000106195  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0933  methylation site containing protein  29.33 
 
 		 163 aa  54.3  0.0000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.133709  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0400  N-terminal methylation site  27.7 
 
 		 162 aa  53.1  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1093  type IV pilus biogenesis protein, putative  33.73 
 
 		 178 aa  53.1  0.000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0215  hypothetical protein  32.14 
 
 		 174 aa  53.1  0.000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0562308 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0021  putative type-4 fimbrial pilin related signal peptide protein  33.6 
 
 		 194 aa  53.5  0.000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1064  type IV pilus biogenesis protein, putative  31.82 
 
 		 164 aa  52  0.000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1094  type IV pilus biogenesis protein, putative  29.84 
 
 		 170 aa  52  0.000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1131  type IV pilus biogenesis protein, putative  31.82 
 
 		 164 aa  52  0.000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0019  pre-pilin like leader sequence  35.71 
 
 		 191 aa  52  0.000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.808404  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3225  type IV pilus biogenesis protein, putative  31.82 
 
 		 164 aa  52  0.000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05337  putative type-4 fimbrial pilin related signal peptide protein  31.46 
 
 		 181 aa  51.2  0.000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.693608 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2876  methylation  36.05 
 
 		 200 aa  51.6  0.000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.323846  normal  0.549514 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3521  type IV pilus biogenesis protein, putative  32.1 
 
 		 164 aa  51.2  0.000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1166  type IV pilus biogenesis protein, putative  31.48 
 
 		 164 aa  51.2  0.000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.334361 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0852  methylation site containing protein  40.3 
 
 		 131 aa  50.8  0.000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3170  methylation site containing protein  40.3 
 
 		 131 aa  50.8  0.000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0771  hypothetical protein  43.94 
 
 		 142 aa  49.7  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.25436 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1108  methylation site containing protein  28 
 
 		 163 aa  50.1  0.00001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.105316  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2881  methylation site containing protein  30.86 
 
 		 170 aa  49.7  0.00001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2534  N-terminal methylation site-containing protein  33.7 
 
 		 185 aa  49.3  0.00002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0962  Tfp pilus assembly protein FimT-like protein  38.1 
 
 		 162 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.582094  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4782  Tfp pilus assembly protein  34.44 
 
 		 179 aa  48.9  0.00002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.26372 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0866  putative type-4 fimbrial pilin related signal peptide protein  35.82 
 
 		 194 aa  48.9  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.197322  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0777  putative type 4 fimbrial pilin related transmembrane protein  29.67 
 
 		 185 aa  48.5  0.00003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5190  type 4 fimbrial biogenesis protein FimU  28.32 
 
 		 168 aa  48.9  0.00003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.875037  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0421  methylation site containing protein  51.35 
 
 		 142 aa  48.5  0.00003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000175547  normal  0.0256712 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0811  pillin, putative  31.33 
 
 		 157 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4848  general secretion pathway protein H  28.3 
 
 		 184 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.966259 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0472  fimbrial protein pilin  48.72 
 
 		 182 aa  48.1  0.00004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.877435  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0233  type IV pilin protein  43.64 
 
 		 152 aa  47.8  0.00005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2126  methylation  28.79 
 
 		 146 aa  47.4  0.00006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.196428  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2713  type IV pilus biogenesis protein, putative  27.91 
 
 		 172 aa  47.8  0.00006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000625919  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2909  pilus assembly protein  33.71 
 
 		 188 aa  47.4  0.00007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.256003  normal  0.0433853 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0485  methylation  38.64 
 
 		 178 aa  47  0.00008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1834  fimbrial biogenesis protein  28.99 
 
 		 195 aa  47  0.00008  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.723988  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3182  putative type-4 fimbrial pilin related signal peptide protein  26.71 
 
 		 194 aa  47  0.00009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0715  pillin, putative  29.87 
 
 		 157 aa  47  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0271  hypothetical protein  37.1 
 
 		 185 aa  46.2  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2522  methylation  34.67 
 
 		 179 aa  46.2  0.0001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0250  fimbrial subunit  35.65 
 
 		 152 aa  46.6  0.0001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0333044  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1109  type IV pilus biogenesis protein, putative  34.18 
 
 		 170 aa  46.2  0.0001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.014946  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3029  methylation site containing protein  30.23 
 
 		 155 aa  46.6  0.0001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.305905 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0685  Tfp pilus assembly protein FimT-like protein  27.12 
 
 		 186 aa  46.2  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002546  type IV pilin PilA  55.26 
 
 		 157 aa  46.6  0.0001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.790868  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0873  Tfp pilus assembly protein FimT  36.92 
 
 		 190 aa  46.6  0.0001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.160532  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2914  type IV pilin PilE  33 
 
 		 144 aa  46.6  0.0001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0462503 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0500  Tfp pilus assembly protein FimT-like protein  38.1 
 
 		 218 aa  46.2  0.0001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0417  pilin, putative  48.65 
 
 		 138 aa  46.2  0.0002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3918  methylation site containing protein  48.65 
 
 		 143 aa  46.2  0.0002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000265425  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1205  type IV pilus biogenesis protein, putative  30.23 
 
 		 169 aa  45.4  0.0002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0670  Tfp pilus assembly protein FimT-like protein  30.53 
 
 		 214 aa  45.8  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.648692  normal  0.521585 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0297  hypothetical protein  32.05 
 
 		 166 aa  45.8  0.0002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1895  type 4 fimbrial biogenesis protein  28.57 
 
 		 195 aa  46.2  0.0002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2929  general secretion pathway protein H  29.29 
 
 		 188 aa  46.2  0.0002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03468  Tfp pilus assembly protein major pilin PilA  46.15 
 
 		 141 aa  45.8  0.0002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3829  Tfp pilus assembly protein FimT-like protein  36.51 
 
 		 222 aa  46.2  0.0002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.198337 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0461  fimbrial protein precursor PilE (MS11 antigen)  41.38 
 
 		 167 aa  45.4  0.0003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.653734  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0686  hypothetical protein  30.49 
 
 		 192 aa  45.1  0.0003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0669  hypothetical protein  30.49 
 
 		 192 aa  45.4  0.0003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0783  general secretion pathway protein H  35.29 
 
 		 182 aa  45.1  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1865  pilus assembly protein  50 
 
 		 134 aa  45.1  0.0003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0219  putative type IV pilin  32.88 
 
 		 182 aa  45.4  0.0003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.130638 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0702  Tfp pilus assembly protein FimT-like protein  26.67 
 
 		 186 aa  45.4  0.0003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.686484  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3919  putative type IV pilus biogenesis protein  26.79 
 
 		 208 aa  45.1  0.0004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.159309  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3040  general secretion pathway protein H  29.03 
 
 		 177 aa  44.7  0.0004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.504644  normal  0.141498 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0562  putative fimT protein  33.94 
 
 		 178 aa  44.7  0.0004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000705405  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1621  type 4 pili biogenesis protein (prepilin-like protein)  42.86 
 
 		 186 aa  44.7  0.0004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.000506995  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2447  hypothetical protein  22.35 
 
 		 186 aa  45.1  0.0004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.631468  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5685  Type IV pilus transmembrane protein, FimT  25.64 
 
 		 164 aa  44.7  0.0004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.695953  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0962  N-terminal methylation  33.33 
 
 		 189 aa  44.7  0.0005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3388  methylation  53.12 
 
 		 138 aa  44.7  0.0005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>