68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_1354 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008740  Maqu_1354  general secretion pathway protein J  100 
 
 
254 aa  511  1e-144  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2920  general secretion pathway protein J  42.16 
 
 
239 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.34948  normal  0.107134 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2035  general secretion pathway protein J  40.78 
 
 
237 aa  148  8e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24060  general secretion pathway protein J  40.89 
 
 
237 aa  144  1e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2388  general secretion pathway protein J  33.33 
 
 
212 aa  106  4e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000292779 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0256  general secretion pathway protein J  31.6 
 
 
204 aa  103  3e-21  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.745018  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0111  general secretion pathway protein J  31.8 
 
 
236 aa  97.1  3e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1305  general secretion pathway protein J  32.41 
 
 
246 aa  94  2e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0172  general secretion pathway protein J  28.51 
 
 
255 aa  92  9e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0127  general secretion pathway protein J  29.54 
 
 
251 aa  89.7  5e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3613  general secretion pathway protein J  33.5 
 
 
259 aa  89  7e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0237  general secretion pathway protein J  32.24 
 
 
232 aa  88.2  1e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1385  general secretion pathway protein J  31.48 
 
 
198 aa  85.5  7e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.44929  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0321  general secretion pathway protein J  29.21 
 
 
203 aa  85.5  7e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1476  general secretion pathway protein J  27.43 
 
 
237 aa  85.5  8e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0159  general secretion pathway protein J  31.09 
 
 
259 aa  84.7  0.000000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0150  general secretion pathway protein J  29.13 
 
 
241 aa  84.7  0.000000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1410  general secretion pathway protein J  30.1 
 
 
199 aa  85.1  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0118952  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4585  general secretion pathway protein J  32.54 
 
 
219 aa  85.1  0.000000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.979233  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00607  general secretion pathway protein J  27.36 
 
 
250 aa  84.3  0.000000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3561  general secretion pathway protein J  26.98 
 
 
252 aa  84  0.000000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0175  general secretion pathway protein J  29.72 
 
 
259 aa  84.3  0.000000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.729564  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0103  general secretion pathway protein J  31.82 
 
 
211 aa  84  0.000000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001886  general secretion pathway protein J  26.94 
 
 
225 aa  84  0.000000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0159  general secretion pathway protein J  30.67 
 
 
259 aa  82.8  0.000000000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0570071 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4200  general secretion pathway protein J  30.67 
 
 
263 aa  83.2  0.000000000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4245  general secretion pathway protein J  30.37 
 
 
197 aa  81.6  0.00000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0360831 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03962  general secretion pathway protein J  30 
 
 
208 aa  80.5  0.00000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0155  general secretion pathway protein J  30 
 
 
257 aa  80.1  0.00000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0157  general secretion pathway protein J  29.19 
 
 
253 aa  80.1  0.00000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0162  general secretion pathway protein J  27.53 
 
 
253 aa  80.1  0.00000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.933728 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3574  general secretion pathway protein J  29.33 
 
 
212 aa  79.7  0.00000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.629666 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1313  type II secretory pathway protein LspJ  26.83 
 
 
205 aa  79.7  0.00000000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0157  general secretion pathway protein J  29.33 
 
 
255 aa  79.3  0.00000000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0234  general secretion pathway protein J  32.38 
 
 
193 aa  79  0.00000000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1310  type II secretory pathway protein LspJ  26.83 
 
 
205 aa  79  0.00000000000007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3241  general secretion pathway protein GspJ  29.81 
 
 
201 aa  78.2  0.0000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.575634 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2854  general secretion pathway protein J  31.28 
 
 
216 aa  78.6  0.0000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.400784  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1418  general secretion pathway protein J  30.29 
 
 
216 aa  78.2  0.0000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0009  general secretion pathway protein J  33.33 
 
 
199 aa  77.4  0.0000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.264866 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3406  general secretion pathway protein GspJ  29.95 
 
 
199 aa  75.5  0.0000000000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2300  general secretion pathway protein J  26.7 
 
 
221 aa  74.7  0.000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4352  general secretion pathway protein J  27.96 
 
 
250 aa  75.1  0.000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2375  general secretion pathway protein J  33.52 
 
 
223 aa  74.3  0.000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.69272  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3421  general secretion pathway protein J  29.95 
 
 
199 aa  74.3  0.000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3132  general secretion pathway protein J  29.33 
 
 
201 aa  74.3  0.000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2918  general secretion pathway protein J  28.39 
 
 
215 aa  71.2  0.00000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4728  general secretion pathway protein J  26.89 
 
 
264 aa  71.6  0.00000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02782  hypothetical protein  29.65 
 
 
189 aa  66.6  0.0000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000034032  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0147  general secretion pathway protein J  25.94 
 
 
253 aa  64.7  0.000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0387  prepilin-type cleavage/methylation-like protein  29.11 
 
 
220 aa  65.1  0.000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.618821 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02832  hypothetical type II secretion protein GspJ  29.44 
 
 
187 aa  64.3  0.000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000053878  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1010  general secretion pathway protein J  25.36 
 
 
198 aa  62  0.000000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0958  general secretion pathway protein J  24.88 
 
 
198 aa  59.7  0.00000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.83965  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2535  general secretory pathway protein J  26.24 
 
 
223 aa  58.9  0.00000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0358104  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1528  general secretion pathway protein J  22.17 
 
 
291 aa  57.4  0.0000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.81636  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03133  hypothetical protein  25 
 
 
195 aa  51.6  0.00001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03182  predicted general secretory pathway component, cryptic  25 
 
 
195 aa  51.6  0.00001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2205  type II secretion system protein J  29.94 
 
 
204 aa  51.6  0.00001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0654355  normal  0.781056 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0382  general secretion pathway protein J  25 
 
 
195 aa  51.6  0.00001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.278127 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0382  general secretion pathway protein J  25 
 
 
195 aa  51.6  0.00001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3525  general secretion pathway protein J  24.09 
 
 
195 aa  50.4  0.00003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2580  hypothetical protein  26.9 
 
 
202 aa  47.8  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.214724  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3131  general secretion pathway protein J  29.01 
 
 
215 aa  47.8  0.0002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.702697  normal  0.037121 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1895  general secretion pathway protein J  20.1 
 
 
206 aa  47.8  0.0002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3422  general secretion pathway protein J  31.03 
 
 
232 aa  46.2  0.0005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000633509 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3196  hypothetical protein  23.38 
 
 
202 aa  45.4  0.0009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.114017  hitchhiker  0.00348326 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0680  hypothetical protein  30.6 
 
 
220 aa  42.4  0.007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.197262  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>