50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_0387 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008347  Mmar10_0387  prepilin-type cleavage/methylation-like protein  100 
 
 		 220 aa  427  1e-119  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.618821 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0172  general secretion pathway protein J  27.65 
 
 		 255 aa  75.1  0.0000000000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0162  general secretion pathway protein J  27.19 
 
 		 253 aa  75.1  0.0000000000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.933728 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0157  general secretion pathway protein J  27.19 
 
 		 253 aa  74.3  0.000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4728  general secretion pathway protein J  27.19 
 
 		 264 aa  73.6  0.000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0157  general secretion pathway protein J  27.19 
 
 		 255 aa  72.8  0.000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0155  general secretion pathway protein J  28.91 
 
 		 257 aa  72  0.000000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3561  general secretion pathway protein J  27.01 
 
 		 252 aa  71.2  0.00000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3613  general secretion pathway protein J  28.99 
 
 		 259 aa  71.2  0.00000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4352  general secretion pathway protein J  27.03 
 
 		 250 aa  71.2  0.00000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0127  general secretion pathway protein J  26.76 
 
 		 251 aa  70.1  0.00000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4200  general secretion pathway protein J  28.44 
 
 		 263 aa  69.3  0.00000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0159  general secretion pathway protein J  28.44 
 
 		 259 aa  69.3  0.00000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0570071 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0159  general secretion pathway protein J  28.44 
 
 		 259 aa  68.9  0.00000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0175  general secretion pathway protein J  29.05 
 
 		 259 aa  69.3  0.00000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.729564  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03962  general secretion pathway protein J  25.79 
 
 		 208 aa  67.4  0.0000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2920  general secretion pathway protein J  31.43 
 
 		 239 aa  67.8  0.0000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.34948  normal  0.107134 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4585  general secretion pathway protein J  26.27 
 
 		 219 aa  67  0.0000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.979233  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0237  general secretion pathway protein J  27.95 
 
 		 232 aa  67.4  0.0000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3406  general secretion pathway protein GspJ  30.84 
 
 		 199 aa  66.2  0.0000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3132  general secretion pathway protein J  29.86 
 
 		 201 aa  66.6  0.0000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0111  general secretion pathway protein J  26.88 
 
 		 236 aa  66.2  0.0000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1354  general secretion pathway protein J  29.11 
 
 		 254 aa  65.1  0.0000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0103  general secretion pathway protein J  26.61 
 
 		 211 aa  64.7  0.000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0150  general secretion pathway protein J  25.59 
 
 		 241 aa  63.9  0.000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3421  general secretion pathway protein J  29.55 
 
 		 199 aa  63.9  0.000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1313  type II secretory pathway protein LspJ  24.54 
 
 		 205 aa  63.2  0.000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1310  type II secretory pathway protein LspJ  25 
 
 		 205 aa  62.8  0.000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3241  general secretion pathway protein GspJ  29.41 
 
 		 201 aa  62.4  0.000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.575634 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0321  general secretion pathway protein J  31.37 
 
 		 203 aa  60.5  0.00000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0147  general secretion pathway protein J  31.82 
 
 		 253 aa  59.7  0.00000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2300  general secretion pathway protein J  29.03 
 
 		 221 aa  58.5  0.00000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02782  hypothetical protein  28.77 
 
 		 189 aa  57  0.0000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000034032  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1385  general secretion pathway protein J  29.63 
 
 		 198 aa  56.6  0.0000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.44929  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001886  general secretion pathway protein J  26.98 
 
 		 225 aa  55.8  0.0000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4245  general secretion pathway protein J  29.77 
 
 		 197 aa  55.1  0.0000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0360831 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02832  hypothetical type II secretion protein GspJ  28.73 
 
 		 187 aa  54.3  0.000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000053878  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2388  general secretion pathway protein J  26.92 
 
 		 212 aa  53.9  0.000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000292779 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00607  general secretion pathway protein J  26.76 
 
 		 250 aa  53.5  0.000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2854  general secretion pathway protein J  26.01 
 
 		 216 aa  51.2  0.00001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.400784  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2918  general secretion pathway protein J  25.7 
 
 		 215 aa  50.4  0.00002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1305  general secretion pathway protein J  28.74 
 
 		 246 aa  50.4  0.00002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1418  general secretion pathway protein J  25.71 
 
 		 216 aa  50.4  0.00002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1476  general secretion pathway protein J  26.97 
 
 		 237 aa  50.1  0.00003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24060  general secretion pathway protein J  29.94 
 
 		 237 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2035  general secretion pathway protein J  31.08 
 
 		 237 aa  47  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0009  general secretion pathway protein J  26.74 
 
 		 199 aa  46.6  0.0003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.264866 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1410  general secretion pathway protein J  24.76 
 
 		 199 aa  45.4  0.0006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0118952  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3574  general secretion pathway protein J  25.15 
 
 		 212 aa  44.7  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.629666 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1528  general secretion pathway protein J  24.55 
 
 		 291 aa  42  0.007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.81636  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>