56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECD_02832 on replicon CP001509
Organism: Escherichia coli BL21(DE3)



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_02832  hypothetical type II secretion protein GspJ  100 
 
 		 187 aa  380  1e-105  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000053878  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02782  hypothetical protein  99.47 
 
 		 189 aa  379  1e-104  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000034032  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3421  general secretion pathway protein J  98.38 
 
 		 199 aa  372  1e-102  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3132  general secretion pathway protein J  96.79 
 
 		 201 aa  371  1e-102  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3406  general secretion pathway protein GspJ  97.84 
 
 		 199 aa  369  1e-101  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3241  general secretion pathway protein GspJ  96.79 
 
 		 201 aa  367  1e-101  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.575634 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2918  general secretion pathway protein J  33.86 
 
 		 215 aa  111  6e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0103  general secretion pathway protein J  35.33 
 
 		 211 aa  110  1.0000000000000001e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1476  general secretion pathway protein J  34.05 
 
 		 237 aa  108  6e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2300  general secretion pathway protein J  35.98 
 
 		 221 aa  107  9.000000000000001e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001886  general secretion pathway protein J  34.22 
 
 		 225 aa  105  3e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00607  general secretion pathway protein J  33.51 
 
 		 250 aa  101  5e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2854  general secretion pathway protein J  32.97 
 
 		 216 aa  101  8e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.400784  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4585  general secretion pathway protein J  32.8 
 
 		 219 aa  100  1e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.979233  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1305  general secretion pathway protein J  35.14 
 
 		 246 aa  99.8  2e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1418  general secretion pathway protein J  32.42 
 
 		 216 aa  99.4  3e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0237  general secretion pathway protein J  31.94 
 
 		 232 aa  91.3  8e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0009  general secretion pathway protein J  33.53 
 
 		 199 aa  90.9  9e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.264866 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03962  general secretion pathway protein J  31.61 
 
 		 208 aa  89.7  2e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2035  general secretion pathway protein J  31.47 
 
 		 237 aa  89.4  3e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24060  general secretion pathway protein J  31.98 
 
 		 237 aa  87.8  9e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0150  general secretion pathway protein J  31.72 
 
 		 241 aa  86.3  3e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4352  general secretion pathway protein J  32.07 
 
 		 250 aa  85.9  3e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0127  general secretion pathway protein J  32.24 
 
 		 251 aa  85.9  3e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3613  general secretion pathway protein J  31.15 
 
 		 259 aa  84  0.000000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0175  general secretion pathway protein J  31.69 
 
 		 259 aa  83.2  0.000000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.729564  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0111  general secretion pathway protein J  31.15 
 
 		 236 aa  82.4  0.000000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4245  general secretion pathway protein J  28.8 
 
 		 197 aa  82.4  0.000000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0360831 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0159  general secretion pathway protein J  30.05 
 
 		 259 aa  80.5  0.00000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4200  general secretion pathway protein J  30.05 
 
 		 263 aa  79.7  0.00000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0159  general secretion pathway protein J  30.05 
 
 		 259 aa  79.7  0.00000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0570071 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0155  general secretion pathway protein J  30.05 
 
 		 257 aa  79.7  0.00000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0172  general secretion pathway protein J  30.05 
 
 		 255 aa  77.4  0.0000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2920  general secretion pathway protein J  29.44 
 
 		 239 aa  76.6  0.0000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.34948  normal  0.107134 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0157  general secretion pathway protein J  29.51 
 
 		 255 aa  76.6  0.0000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3561  general secretion pathway protein J  29.51 
 
 		 252 aa  76.3  0.0000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0157  general secretion pathway protein J  29.51 
 
 		 253 aa  76.6  0.0000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4728  general secretion pathway protein J  29.35 
 
 		 264 aa  75.9  0.0000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0162  general secretion pathway protein J  29.51 
 
 		 253 aa  75.5  0.0000000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.933728 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0958  general secretion pathway protein J  24.32 
 
 		 198 aa  68.6  0.00000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.83965  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1010  general secretion pathway protein J  23.78 
 
 		 198 aa  67  0.0000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1410  general secretion pathway protein J  28.27 
 
 		 199 aa  65.1  0.0000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0118952  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1354  general secretion pathway protein J  29.44 
 
 		 254 aa  64.3  0.0000000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2388  general secretion pathway protein J  31.68 
 
 		 212 aa  60.8  0.00000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000292779 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0256  general secretion pathway protein J  28.88 
 
 		 204 aa  59.3  0.00000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.745018  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1385  general secretion pathway protein J  30.51 
 
 		 198 aa  57.8  0.00000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.44929  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0387  prepilin-type cleavage/methylation-like protein  28.73 
 
 		 220 aa  54.3  0.000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.618821 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2375  general secretion pathway protein J  30.95 
 
 		 223 aa  53.5  0.000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.69272  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3574  general secretion pathway protein J  25.13 
 
 		 212 aa  51.2  0.000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.629666 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3264  general secretion pathway protein J  26.09 
 
 		 131 aa  49.3  0.00003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000089395  hitchhiker  0.00000000000000309054 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0321  general secretion pathway protein J  25 
 
 		 203 aa  46.6  0.0002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1310  type II secretory pathway protein LspJ  20.51 
 
 		 205 aa  46.2  0.0002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1313  type II secretory pathway protein LspJ  20.51 
 
 		 205 aa  45.8  0.0004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0147  general secretion pathway protein J  29.53 
 
 		 253 aa  43.1  0.002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1895  general secretion pathway protein J  24.49 
 
 		 206 aa  42  0.005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0234  general secretion pathway protein J  25.52 
 
 		 193 aa  41.6  0.006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>