71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_0127 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_0127  general secretion pathway protein J  100 
 
 		 251 aa  508  1e-143  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0172  general secretion pathway protein J  64.03 
 
 		 255 aa  332  3e-90  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0111  general secretion pathway protein J  70.09 
 
 		 236 aa  326  3e-88  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0162  general secretion pathway protein J  64.54 
 
 		 253 aa  322  3e-87  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.933728 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0157  general secretion pathway protein J  71.09 
 
 		 253 aa  320  9.999999999999999e-87  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4200  general secretion pathway protein J  66.96 
 
 		 263 aa  319  1.9999999999999998e-86  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0155  general secretion pathway protein J  64.49 
 
 		 257 aa  319  1.9999999999999998e-86  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0159  general secretion pathway protein J  66.96 
 
 		 259 aa  319  1.9999999999999998e-86  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0570071 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0159  general secretion pathway protein J  66.96 
 
 		 259 aa  319  3e-86  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3561  general secretion pathway protein J  63.49 
 
 		 252 aa  318  6e-86  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0157  general secretion pathway protein J  72.2 
 
 		 255 aa  318  7e-86  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0150  general secretion pathway protein J  63.07 
 
 		 241 aa  316  2e-85  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3613  general secretion pathway protein J  68.93 
 
 		 259 aa  307  9e-83  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0175  general secretion pathway protein J  60.47 
 
 		 259 aa  305  6e-82  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.729564  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4352  general secretion pathway protein J  67.86 
 
 		 250 aa  292  3e-78  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4728  general secretion pathway protein J  65.82 
 
 		 264 aa  290  1e-77  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2854  general secretion pathway protein J  41.92 
 
 		 216 aa  148  8e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.400784  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1418  general secretion pathway protein J  41.84 
 
 		 216 aa  146  3e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4585  general secretion pathway protein J  36.95 
 
 		 219 aa  144  1e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.979233  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1476  general secretion pathway protein J  41.67 
 
 		 237 aa  137  1e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0237  general secretion pathway protein J  38.38 
 
 		 232 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1305  general secretion pathway protein J  40.95 
 
 		 246 aa  134  9.999999999999999e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0103  general secretion pathway protein J  36 
 
 		 211 aa  128  1.0000000000000001e-28  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03962  general secretion pathway protein J  34.78 
 
 		 208 aa  125  7e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2300  general secretion pathway protein J  34.45 
 
 		 221 aa  123  2e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00607  general secretion pathway protein J  32.2 
 
 		 250 aa  123  2e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001886  general secretion pathway protein J  30.48 
 
 		 225 aa  120  3e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2918  general secretion pathway protein J  34.69 
 
 		 215 aa  118  7.999999999999999e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3406  general secretion pathway protein GspJ  35.08 
 
 		 199 aa  103  3e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4245  general secretion pathway protein J  31.31 
 
 		 197 aa  102  5e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0360831 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0009  general secretion pathway protein J  36.04 
 
 		 199 aa  101  1e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.264866 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3421  general secretion pathway protein J  34.55 
 
 		 199 aa  100  2e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3132  general secretion pathway protein J  34.03 
 
 		 201 aa  100  3e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3241  general secretion pathway protein GspJ  35.08 
 
 		 201 aa  99.4  5e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.575634 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2920  general secretion pathway protein J  33.82 
 
 		 239 aa  93.2  3e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.34948  normal  0.107134 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1354  general secretion pathway protein J  29.54 
 
 		 254 aa  89.7  4e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02782  hypothetical protein  32.97 
 
 		 189 aa  89.7  4e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000034032  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24060  general secretion pathway protein J  30.88 
 
 		 237 aa  86.3  4e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2035  general secretion pathway protein J  29.49 
 
 		 237 aa  85.9  5e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02832  hypothetical type II secretion protein GspJ  32.24 
 
 		 187 aa  85.9  6e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000053878  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1410  general secretion pathway protein J  30.05 
 
 		 199 aa  77.8  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0118952  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0387  prepilin-type cleavage/methylation-like protein  26.89 
 
 		 220 aa  69.3  0.00000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.618821 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2388  general secretion pathway protein J  30.19 
 
 		 212 aa  69.3  0.00000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000292779 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1313  type II secretory pathway protein LspJ  25 
 
 		 205 aa  68.9  0.00000000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1310  type II secretory pathway protein LspJ  25.47 
 
 		 205 aa  67.8  0.0000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1010  general secretion pathway protein J  28.27 
 
 		 198 aa  67  0.0000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0958  general secretion pathway protein J  27.75 
 
 		 198 aa  64.7  0.000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.83965  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0147  general secretion pathway protein J  26.84 
 
 		 253 aa  58.5  0.00000009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1385  general secretion pathway protein J  30.69 
 
 		 198 aa  56.2  0.0000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.44929  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1528  general secretion pathway protein J  45.9 
 
 		 291 aa  55.1  0.000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.81636  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3394  putative general secretory pathway J transmembrane protein  29.63 
 
 		 247 aa  54.7  0.000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3047  general secretory pathway J transmembrane protein  32.95 
 
 		 240 aa  52  0.000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.353213  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03182  predicted general secretory pathway component, cryptic  25.7 
 
 		 195 aa  51.2  0.00001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0382  general secretion pathway protein J  25.7 
 
 		 195 aa  51.2  0.00001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.278127 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0382  general secretion pathway protein J  25.7 
 
 		 195 aa  51.2  0.00001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03133  hypothetical protein  25.7 
 
 		 195 aa  51.2  0.00001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2375  general secretion pathway protein J  31.75 
 
 		 223 aa  51.2  0.00002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.69272  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3525  general secretion pathway protein J  24.77 
 
 		 195 aa  50.8  0.00002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3574  general secretion pathway protein J  27.1 
 
 		 212 aa  49.7  0.00004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.629666 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3387  Type II secretory pathway component PulJ  36.62 
 
 		 230 aa  47  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3109  general secretory pathway J transmembrane protein  33.33 
 
 		 240 aa  46.2  0.0005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.388678  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0256  general secretion pathway protein J  24.62 
 
 		 204 aa  44.7  0.002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.745018  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0014  general secretory pathway protein J  26.92 
 
 		 242 aa  44.3  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0227  general secretory pathway protein J  26.92 
 
 		 242 aa  43.5  0.003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.291181  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1035  hypothetical protein  29.73 
 
 		 237 aa  43.5  0.003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2580  hypothetical protein  32 
 
 		 202 aa  43.5  0.003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.214724  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0045  putative general secretion pathway protein J  28.08 
 
 		 234 aa  43.5  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0015  general secretion pathway protein J  26.92 
 
 		 242 aa  43.5  0.003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0530373  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0015  general secretion pathway protein J  26.92 
 
 		 242 aa  43.5  0.003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0055  putative general secretion pathway protein J  28.08 
 
 		 224 aa  43.5  0.004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0954003  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3310  Type II secretory pathway component PulJ-like protein  26.29 
 
 		 181 aa  42.7  0.006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>