50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_0321 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_0321  general secretion pathway protein J  100 
 
 		 203 aa  399  9.999999999999999e-111  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1385  general secretion pathway protein J  35.83 
 
 		 198 aa  112  3e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.44929  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1354  general secretion pathway protein J  29.21 
 
 		 254 aa  85.9  4e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2035  general secretion pathway protein J  27.36 
 
 		 237 aa  76.6  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2920  general secretion pathway protein J  29.83 
 
 		 239 aa  76.3  0.0000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.34948  normal  0.107134 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24060  general secretion pathway protein J  27.94 
 
 		 237 aa  72.4  0.000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1310  type II secretory pathway protein LspJ  25 
 
 		 205 aa  70.9  0.00000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1313  type II secretory pathway protein LspJ  25 
 
 		 205 aa  70.5  0.00000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0147  general secretion pathway protein J  29.41 
 
 		 253 aa  69.3  0.00000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1410  general secretion pathway protein J  27.66 
 
 		 199 aa  68.2  0.00000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0118952  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0256  general secretion pathway protein J  28.04 
 
 		 204 aa  67.4  0.0000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.745018  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3241  general secretion pathway protein GspJ  29.44 
 
 		 201 aa  67.8  0.0000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.575634 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3406  general secretion pathway protein GspJ  29.7 
 
 		 199 aa  66.6  0.0000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03962  general secretion pathway protein J  30.37 
 
 		 208 aa  65.1  0.0000000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3421  general secretion pathway protein J  29.7 
 
 		 199 aa  64.7  0.0000000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3132  general secretion pathway protein J  29.09 
 
 		 201 aa  63.9  0.000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4245  general secretion pathway protein J  28.22 
 
 		 197 aa  62  0.000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0360831 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0237  general secretion pathway protein J  27.66 
 
 		 232 aa  60.8  0.00000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0387  prepilin-type cleavage/methylation-like protein  31.37 
 
 		 220 aa  61.2  0.00000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.618821 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2375  general secretion pathway protein J  33.03 
 
 		 223 aa  60.8  0.00000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.69272  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00607  general secretion pathway protein J  27.09 
 
 		 250 aa  60.1  0.00000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001886  general secretion pathway protein J  26.88 
 
 		 225 aa  56.2  0.0000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2388  general secretion pathway protein J  29.15 
 
 		 212 aa  54.3  0.000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000292779 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4585  general secretion pathway protein J  22.73 
 
 		 219 aa  54.3  0.000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.979233  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2300  general secretion pathway protein J  27.84 
 
 		 221 aa  51.6  0.000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02782  hypothetical protein  26.44 
 
 		 189 aa  51.2  0.000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000034032  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0103  general secretion pathway protein J  26.13 
 
 		 211 aa  50.4  0.00002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2854  general secretion pathway protein J  24.1 
 
 		 216 aa  49.7  0.00003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.400784  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1476  general secretion pathway protein J  31.86 
 
 		 237 aa  49.7  0.00003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3574  general secretion pathway protein J  26.36 
 
 		 212 aa  49.3  0.00004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.629666 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2580  hypothetical protein  35.29 
 
 		 202 aa  48.5  0.00006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.214724  normal  1 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0009  general secretion pathway protein J  30.96 
 
 		 199 aa  48.5  0.00006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.264866 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1418  general secretion pathway protein J  23.47 
 
 		 216 aa  48.5  0.00007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1305  general secretion pathway protein J  25.85 
 
 		 246 aa  47.8  0.0001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0958  general secretion pathway protein J  23.33 
 
 		 198 aa  47.8  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.83965  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0150  general secretion pathway protein J  24.64 
 
 		 241 aa  46.2  0.0003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02832  hypothetical type II secretion protein GspJ  25 
 
 		 187 aa  46.2  0.0003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000053878  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1119  general secretory pathway protein J  27.96 
 
 		 200 aa  46.6  0.0003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1010  general secretion pathway protein J  22.78 
 
 		 198 aa  46.2  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2918  general secretion pathway protein J  27.74 
 
 		 215 aa  44.7  0.001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0234  general secretion pathway protein J  26.73 
 
 		 193 aa  44.3  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0382  general secretion pathway protein J  27.94 
 
 		 195 aa  43.5  0.002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3525  general secretion pathway protein J  27.94 
 
 		 195 aa  43.5  0.002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03133  hypothetical protein  27.94 
 
 		 195 aa  43.5  0.002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0382  general secretion pathway protein J  27.94 
 
 		 195 aa  43.5  0.002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.278127 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03182  predicted general secretory pathway component, cryptic  27.94 
 
 		 195 aa  43.5  0.002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1895  general secretion pathway protein J  30.86 
 
 		 206 aa  42.4  0.005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0175  general secretion pathway protein J  26.36 
 
 		 259 aa  42  0.006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.729564  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4352  general secretion pathway protein J  24.23 
 
 		 250 aa  41.6  0.009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0756  general secretion pathway protein J  27.66 
 
 		 258 aa  41.2  0.009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.602108  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>