62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_0150 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009901  Spea_0150  general secretion pathway protein J  100 
 
 		 241 aa  496  1e-139  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0155  general secretion pathway protein J  70.37 
 
 		 257 aa  348  4e-95  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0172  general secretion pathway protein J  68.75 
 
 		 255 aa  346  2e-94  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3561  general secretion pathway protein J  67.76 
 
 		 252 aa  344  6e-94  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0159  general secretion pathway protein J  75.81 
 
 		 259 aa  342  2e-93  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4200  general secretion pathway protein J  75.81 
 
 		 263 aa  342  2e-93  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0159  general secretion pathway protein J  75.81 
 
 		 259 aa  343  2e-93  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0570071 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0157  general secretion pathway protein J  76.7 
 
 		 255 aa  340  2e-92  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0162  general secretion pathway protein J  68.33 
 
 		 253 aa  339  2.9999999999999998e-92  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.933728 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0157  general secretion pathway protein J  75.73 
 
 		 253 aa  337  9.999999999999999e-92  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0175  general secretion pathway protein J  67.21 
 
 		 259 aa  333  1e-90  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.729564  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3613  general secretion pathway protein J  73.66 
 
 		 259 aa  326  2.0000000000000001e-88  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4352  general secretion pathway protein J  74.87 
 
 		 250 aa  322  3e-87  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4728  general secretion pathway protein J  70.39 
 
 		 264 aa  320  1.9999999999999998e-86  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0127  general secretion pathway protein J  64.1 
 
 		 251 aa  313  9.999999999999999e-85  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0111  general secretion pathway protein J  61.86 
 
 		 236 aa  313  1.9999999999999998e-84  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4585  general secretion pathway protein J  38.34 
 
 		 219 aa  150  1e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.979233  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1476  general secretion pathway protein J  40.41 
 
 		 237 aa  142  6e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1305  general secretion pathway protein J  38.71 
 
 		 246 aa  140  9.999999999999999e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2854  general secretion pathway protein J  38.69 
 
 		 216 aa  139  3e-32  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.400784  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03962  general secretion pathway protein J  37.86 
 
 		 208 aa  139  3e-32  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1418  general secretion pathway protein J  37.81 
 
 		 216 aa  137  1e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0237  general secretion pathway protein J  38.76 
 
 		 232 aa  137  2e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001886  general secretion pathway protein J  33.94 
 
 		 225 aa  135  4e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00607  general secretion pathway protein J  32.51 
 
 		 250 aa  130  2.0000000000000002e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0103  general secretion pathway protein J  36.32 
 
 		 211 aa  129  4.0000000000000003e-29  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2918  general secretion pathway protein J  32.87 
 
 		 215 aa  129  5.0000000000000004e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2300  general secretion pathway protein J  29.95 
 
 		 221 aa  120  3e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4245  general secretion pathway protein J  35 
 
 		 197 aa  116  3e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0360831 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3406  general secretion pathway protein GspJ  33.5 
 
 		 199 aa  104  1e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0009  general secretion pathway protein J  35.05 
 
 		 199 aa  102  5e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.264866 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3421  general secretion pathway protein J  33 
 
 		 199 aa  102  8e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3132  general secretion pathway protein J  32.5 
 
 		 201 aa  101  9e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3241  general secretion pathway protein GspJ  32.99 
 
 		 201 aa  99  6e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.575634 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2920  general secretion pathway protein J  32.85 
 
 		 239 aa  94  2e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.34948  normal  0.107134 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02782  hypothetical protein  32.45 
 
 		 189 aa  90.1  2e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000034032  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2035  general secretion pathway protein J  32.16 
 
 		 237 aa  86.7  3e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02832  hypothetical type II secretion protein GspJ  31.72 
 
 		 187 aa  86.3  5e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000053878  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24060  general secretion pathway protein J  30.69 
 
 		 237 aa  85.9  5e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1354  general secretion pathway protein J  29.13 
 
 		 254 aa  84.7  0.000000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1410  general secretion pathway protein J  27.86 
 
 		 199 aa  74.3  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0118952  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1313  type II secretory pathway protein LspJ  25.24 
 
 		 205 aa  66.6  0.0000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1310  type II secretory pathway protein LspJ  25.73 
 
 		 205 aa  66.2  0.0000000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1385  general secretion pathway protein J  30.57 
 
 		 198 aa  65.9  0.0000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.44929  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0147  general secretion pathway protein J  27.11 
 
 		 253 aa  65.5  0.0000000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2388  general secretion pathway protein J  27.98 
 
 		 212 aa  64.7  0.000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000292779 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0387  prepilin-type cleavage/methylation-like protein  25.59 
 
 		 220 aa  63.9  0.000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.618821 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0958  general secretion pathway protein J  23.98 
 
 		 198 aa  56.6  0.0000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.83965  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1010  general secretion pathway protein J  23.47 
 
 		 198 aa  54.7  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2375  general secretion pathway protein J  30.83 
 
 		 223 aa  54.3  0.000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.69272  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1528  general secretion pathway protein J  28.08 
 
 		 291 aa  53.1  0.000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.81636  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0256  general secretion pathway protein J  25.37 
 
 		 204 aa  51.6  0.00001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.745018  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03133  hypothetical protein  24.66 
 
 		 195 aa  50.1  0.00003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03182  predicted general secretory pathway component, cryptic  24.66 
 
 		 195 aa  50.1  0.00003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0382  general secretion pathway protein J  24.66 
 
 		 195 aa  50.1  0.00003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.278127 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0382  general secretion pathway protein J  24.66 
 
 		 195 aa  50.1  0.00003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3525  general secretion pathway protein J  24.2 
 
 		 195 aa  49.3  0.00005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3574  general secretion pathway protein J  24.19 
 
 		 212 aa  47.8  0.0002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.629666 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0321  general secretion pathway protein J  24.73 
 
 		 203 aa  47  0.0003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3310  Type II secretory pathway component PulJ-like protein  23.86 
 
 		 181 aa  46.2  0.0005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2580  hypothetical protein  32.89 
 
 		 202 aa  44.3  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.214724  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3217  N-terminal methylation site  33.9 
 
 		 159 aa  42.7  0.005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.280155 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>