76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_0103 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008709  Ping_0103  general secretion pathway protein J  100 
 
 
211 aa  426  1e-119  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2854  general secretion pathway protein J  41 
 
 
216 aa  158  7e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.400784  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1418  general secretion pathway protein J  39.07 
 
 
216 aa  157  1e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4585  general secretion pathway protein J  44.55 
 
 
219 aa  156  2e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.979233  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2300  general secretion pathway protein J  38.73 
 
 
221 aa  153  2e-36  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00607  general secretion pathway protein J  38.61 
 
 
250 aa  151  8e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001886  general secretion pathway protein J  37.38 
 
 
225 aa  150  2e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1476  general secretion pathway protein J  39.18 
 
 
237 aa  149  3e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1305  general secretion pathway protein J  39.5 
 
 
246 aa  140  9.999999999999999e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0237  general secretion pathway protein J  40.19 
 
 
232 aa  139  3.9999999999999997e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03962  general secretion pathway protein J  40.87 
 
 
208 aa  138  4.999999999999999e-32  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2918  general secretion pathway protein J  36.95 
 
 
215 aa  137  8.999999999999999e-32  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3613  general secretion pathway protein J  37.07 
 
 
259 aa  133  1.9999999999999998e-30  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0009  general secretion pathway protein J  39.2 
 
 
199 aa  132  3e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.264866 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0111  general secretion pathway protein J  34.33 
 
 
236 aa  131  7.999999999999999e-30  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0150  general secretion pathway protein J  36.32 
 
 
241 aa  129  3e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0127  general secretion pathway protein J  36 
 
 
251 aa  128  7.000000000000001e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3561  general secretion pathway protein J  37.81 
 
 
252 aa  126  2.0000000000000002e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4352  general secretion pathway protein J  35.82 
 
 
250 aa  125  3e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0157  general secretion pathway protein J  36.82 
 
 
255 aa  124  8.000000000000001e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3421  general secretion pathway protein J  36.04 
 
 
199 aa  124  1e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3406  general secretion pathway protein GspJ  36.04 
 
 
199 aa  124  1e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0159  general secretion pathway protein J  36.87 
 
 
259 aa  123  2e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0570071 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0155  general secretion pathway protein J  36.87 
 
 
257 aa  123  2e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3241  general secretion pathway protein GspJ  36.04 
 
 
201 aa  123  2e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.575634 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0157  general secretion pathway protein J  36.87 
 
 
253 aa  123  2e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0162  general secretion pathway protein J  37.37 
 
 
253 aa  123  2e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.933728 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3132  general secretion pathway protein J  35.53 
 
 
201 aa  123  2e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4200  general secretion pathway protein J  36.87 
 
 
263 aa  123  2e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0172  general secretion pathway protein J  36.87 
 
 
255 aa  122  3e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0159  general secretion pathway protein J  36.36 
 
 
259 aa  121  7e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4728  general secretion pathway protein J  34.52 
 
 
264 aa  121  8e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0175  general secretion pathway protein J  34.63 
 
 
259 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.729564  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2035  general secretion pathway protein J  34.63 
 
 
237 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24060  general secretion pathway protein J  34.98 
 
 
237 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02782  hypothetical protein  35.48 
 
 
189 aa  112  3e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000034032  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2920  general secretion pathway protein J  33.33 
 
 
239 aa  112  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.34948  normal  0.107134 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02832  hypothetical type II secretion protein GspJ  35.33 
 
 
187 aa  110  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000053878  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4245  general secretion pathway protein J  33.33 
 
 
197 aa  109  3e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0360831 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1410  general secretion pathway protein J  34.95 
 
 
199 aa  94.4  1e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0118952  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1354  general secretion pathway protein J  31.82 
 
 
254 aa  84  0.000000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1010  general secretion pathway protein J  29.15 
 
 
198 aa  82.4  0.000000000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0147  general secretion pathway protein J  30.77 
 
 
253 aa  80.1  0.00000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0958  general secretion pathway protein J  28.64 
 
 
198 aa  79.7  0.00000000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.83965  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1313  type II secretory pathway protein LspJ  29.27 
 
 
205 aa  78.6  0.00000000000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1310  type II secretory pathway protein LspJ  28.78 
 
 
205 aa  77  0.0000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1385  general secretion pathway protein J  28.21 
 
 
198 aa  75.5  0.0000000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.44929  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0256  general secretion pathway protein J  29.11 
 
 
204 aa  71.2  0.00000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.745018  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2388  general secretion pathway protein J  27.48 
 
 
212 aa  70.5  0.00000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000292779 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3574  general secretion pathway protein J  25.23 
 
 
212 aa  65.9  0.0000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.629666 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0387  prepilin-type cleavage/methylation-like protein  26.61 
 
 
220 aa  64.7  0.0000000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.618821 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1528  general secretion pathway protein J  44.12 
 
 
291 aa  63.2  0.000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.81636  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03182  predicted general secretory pathway component, cryptic  26.42 
 
 
195 aa  60.1  0.00000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0382  general secretion pathway protein J  26.42 
 
 
195 aa  60.1  0.00000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03133  hypothetical protein  26.42 
 
 
195 aa  60.1  0.00000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3525  general secretion pathway protein J  26.56 
 
 
195 aa  60.1  0.00000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0382  general secretion pathway protein J  26.42 
 
 
195 aa  60.1  0.00000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.278127 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2580  hypothetical protein  35.59 
 
 
202 aa  51.2  0.00001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.214724  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0321  general secretion pathway protein J  27.47 
 
 
203 aa  50.4  0.00002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2375  general secretion pathway protein J  41.27 
 
 
223 aa  50.4  0.00002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.69272  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55530  putative type II secretion system protein  26.53 
 
 
213 aa  48.5  0.00008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0378882 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1895  general secretion pathway protein J  22.17 
 
 
206 aa  47.8  0.0001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3196  hypothetical protein  26.32 
 
 
202 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.114017  hitchhiker  0.00348326 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3394  putative general secretory pathway J transmembrane protein  33.33 
 
 
247 aa  46.6  0.0003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3422  general secretion pathway protein J  25.97 
 
 
232 aa  46.2  0.0003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000633509 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3047  general secretory pathway J transmembrane protein  32.84 
 
 
240 aa  45.4  0.0006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.353213  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0672  hypothetical protein  28.79 
 
 
227 aa  44.7  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.142154  normal  0.272491 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3109  general secretory pathway J transmembrane protein  33.87 
 
 
240 aa  44.7  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.388678  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2614  putative general secretion pathway protein J  26.44 
 
 
237 aa  44.3  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.460481 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0651  hypothetical protein  29.23 
 
 
225 aa  44.3  0.002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.00814892  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3310  Type II secretory pathway component PulJ-like protein  21.57 
 
 
181 aa  43.5  0.002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3131  general secretion pathway protein J  35.59 
 
 
215 aa  42.7  0.004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.702697  normal  0.037121 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0234  general secretion pathway protein J  36.07 
 
 
193 aa  42.4  0.005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3264  general secretion pathway protein J  29.31 
 
 
131 aa  41.6  0.008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000089395  hitchhiker  0.00000000000000309054 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2205  type II secretion system protein J  26.4 
 
 
204 aa  41.6  0.008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0654355  normal  0.781056 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3524  hypothetical protein  34 
 
 
282 aa  41.6  0.009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0132086  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>