52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_3422 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_3422  general secretion pathway protein J  100 
 
 		 232 aa  465  9.999999999999999e-131  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000633509 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3131  general secretion pathway protein J  49.77 
 
 		 215 aa  201  6e-51  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.702697  normal  0.037121 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1078  hypothetical protein  37.1 
 
 		 227 aa  117  9.999999999999999e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5692  hypothetical protein  33.19 
 
 		 233 aa  115  5e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.434625  normal  0.174572 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1324  methylation  37.23 
 
 		 235 aa  115  6e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3524  hypothetical protein  35.71 
 
 		 282 aa  111  8.000000000000001e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0132086  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0672  hypothetical protein  36.77 
 
 		 227 aa  110  1.0000000000000001e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.142154  normal  0.272491 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0651  hypothetical protein  37.33 
 
 		 225 aa  109  3e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.00814892  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0922  Type II secretory pathway component  34.55 
 
 		 217 aa  101  1e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.235402  normal  0.870714 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0537  methylation  35.59 
 
 		 226 aa  100  2e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0761  methylation precursor  37.66 
 
 		 238 aa  95.5  7e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.327041  normal  0.127693 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0056  putative general secretion pathway protein J  31.54 
 
 		 231 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0045  putative general secretion pathway protein J  30.88 
 
 		 234 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0074  putative general secretion pathway protein J  32.09 
 
 		 222 aa  62.8  0.000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0055  putative general secretion pathway protein J  31.06 
 
 		 224 aa  62.8  0.000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0954003  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0014  general secretory pathway protein J  28.46 
 
 		 242 aa  61.6  0.000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3237  putative general secretion pathway protein J  31.62 
 
 		 229 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.722967  normal  0.701162 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0015  general secretion pathway protein J  28.69 
 
 		 242 aa  59.7  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1883  general secretory pathway protein J  28.69 
 
 		 242 aa  59.7  0.00000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0015  general secretion pathway protein J  28.69 
 
 		 242 aa  59.7  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0530373  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2669  general secretory pathway protein J  28.69 
 
 		 242 aa  59.7  0.00000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.393113  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2778  general secretory pathway protein J  28.69 
 
 		 242 aa  59.7  0.00000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0227  general secretory pathway protein J  28.69 
 
 		 242 aa  59.7  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.291181  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3109  general secretory pathway J transmembrane protein  32.74 
 
 		 240 aa  58.2  0.0000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.388678  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3047  general secretory pathway J transmembrane protein  31.96 
 
 		 240 aa  55.8  0.0000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.353213  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3394  putative general secretory pathway J transmembrane protein  37.5 
 
 		 247 aa  54.7  0.000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3943  putative general secretory pathway protein J  30.09 
 
 		 228 aa  53.5  0.000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.173018 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3077  putative general secretory pathway protein J  27.35 
 
 		 234 aa  53.1  0.000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000785542 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1528  general secretion pathway protein J  39.71 
 
 		 291 aa  52.4  0.000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.81636  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1064  Type II secretory pathway component PulJ  29.73 
 
 		 226 aa  51.2  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00786562  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0147  general secretion pathway protein J  37.5 
 
 		 253 aa  50.1  0.00003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3574  general secretion pathway protein J  37.1 
 
 		 212 aa  47.4  0.0002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.629666 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0055  general secretion pathway protein  30.88 
 
 		 232 aa  47.4  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.163391  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2388  general secretion pathway protein J  37.1 
 
 		 212 aa  46.6  0.0003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000292779 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0103  general secretion pathway protein J  25.97 
 
 		 211 aa  46.2  0.0004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1354  general secretion pathway protein J  31.03 
 
 		 254 aa  46.2  0.0005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0015  putative general secretion pathway protein J  31.15 
 
 		 222 aa  45.8  0.0006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.293753  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3387  Type II secretory pathway component PulJ  28.69 
 
 		 230 aa  45.4  0.0007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1895  general secretion pathway protein J  36.07 
 
 		 206 aa  45.4  0.0008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4245  general secretion pathway protein J  35.48 
 
 		 197 aa  45.1  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0360831 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3511  general secretory pathway protein J  24.35 
 
 		 203 aa  44.7  0.001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3224  general secretory pathway J transmembrane protein  30 
 
 		 212 aa  44.7  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2580  hypothetical protein  40.24 
 
 		 202 aa  45.1  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.214724  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3196  hypothetical protein  44.9 
 
 		 202 aa  45.1  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.114017  hitchhiker  0.00348326 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00607  general secretion pathway protein J  28.42 
 
 		 250 aa  45.1  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55530  putative type II secretion system protein  31.62 
 
 		 213 aa  43.5  0.003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0378882 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1523  putative pseudopilin I precursor  41.67 
 
 		 134 aa  42.7  0.004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.261509  normal  0.295629 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2854  general secretion pathway protein J  25.77 
 
 		 216 aa  43.1  0.004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.400784  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1418  general secretion pathway protein J  25 
 
 		 216 aa  43.1  0.004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2375  general secretion pathway protein J  32.5 
 
 		 223 aa  42.7  0.005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.69272  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1999  general secretion pathway protein G  33.33 
 
 		 131 aa  42  0.007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.607295  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2920  general secretion pathway protein J  28.49 
 
 		 239 aa  41.6  0.01  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.34948  normal  0.107134 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>