37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_0761 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_0761  methylation precursor  100 
 
 		 238 aa  464  9.999999999999999e-131  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.327041  normal  0.127693 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0537  methylation  61.16 
 
 		 226 aa  262  4e-69  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1324  methylation  56.65 
 
 		 235 aa  247  1e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3524  hypothetical protein  55.9 
 
 		 282 aa  241  7e-63  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0132086  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0672  hypothetical protein  56.25 
 
 		 227 aa  227  1e-58  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.142154  normal  0.272491 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0651  hypothetical protein  55.86 
 
 		 225 aa  223  2e-57  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.00814892  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5692  hypothetical protein  48.51 
 
 		 233 aa  221  8e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.434625  normal  0.174572 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0922  Type II secretory pathway component  53.42 
 
 		 217 aa  220  9.999999999999999e-57  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.235402  normal  0.870714 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1078  hypothetical protein  49.36 
 
 		 227 aa  196  2.0000000000000003e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3422  general secretion pathway protein J  37.6 
 
 		 232 aa  127  2.0000000000000002e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000633509 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3131  general secretion pathway protein J  36.84 
 
 		 215 aa  118  7e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.702697  normal  0.037121 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3109  general secretory pathway J transmembrane protein  36.84 
 
 		 240 aa  65.9  0.0000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.388678  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3047  general secretory pathway J transmembrane protein  34.38 
 
 		 240 aa  58.5  0.0000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.353213  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3394  putative general secretory pathway J transmembrane protein  43.33 
 
 		 247 aa  56.6  0.0000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3387  Type II secretory pathway component PulJ  28.19 
 
 		 230 aa  50.8  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3943  putative general secretory pathway protein J  63.89 
 
 		 228 aa  49.3  0.00005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.173018 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3077  putative general secretory pathway protein J  35.9 
 
 		 234 aa  49.3  0.00005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000785542 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0045  putative general secretion pathway protein J  55.26 
 
 		 234 aa  49.3  0.00006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0055  putative general secretion pathway protein J  55.26 
 
 		 224 aa  48.9  0.00006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0954003  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3196  hypothetical protein  38.33 
 
 		 202 aa  47.8  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.114017  hitchhiker  0.00348326 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0056  putative general secretion pathway protein J  51.28 
 
 		 231 aa  48.1  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1895  general secretion pathway protein J  40.35 
 
 		 206 aa  47  0.0002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55530  putative type II secretion system protein  37.7 
 
 		 213 aa  46.6  0.0003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0378882 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0014  general secretory pathway protein J  50 
 
 		 242 aa  46.6  0.0003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2778  general secretory pathway protein J  50 
 
 		 242 aa  46.6  0.0004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2669  general secretory pathway protein J  50 
 
 		 242 aa  46.6  0.0004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.393113  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0015  general secretion pathway protein J  50 
 
 		 242 aa  46.6  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0530373  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0015  general secretion pathway protein J  50 
 
 		 242 aa  46.6  0.0004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1883  general secretory pathway protein J  50 
 
 		 242 aa  46.6  0.0004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0227  general secretory pathway protein J  50 
 
 		 242 aa  46.6  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.291181  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3237  putative general secretion pathway protein J  52.78 
 
 		 229 aa  45.8  0.0005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.722967  normal  0.701162 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0074  putative general secretion pathway protein J  52.78 
 
 		 222 aa  45.8  0.0006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1528  general secretion pathway protein J  38.6 
 
 		 291 aa  45.1  0.001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.81636  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1064  Type II secretory pathway component PulJ  42.37 
 
 		 226 aa  44.7  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00786562  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0147  general secretion pathway protein J  32.35 
 
 		 253 aa  44.7  0.001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2388  general secretion pathway protein J  32.84 
 
 		 212 aa  44.3  0.002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000292779 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1303  general secretion pathway protein I  50 
 
 		 134 aa  42.4  0.006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0186089 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>