51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_1078 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_1078  hypothetical protein  100 
 
 		 227 aa  443  1e-123  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3524  hypothetical protein  50.9 
 
 		 282 aa  208  7e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0132086  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0672  hypothetical protein  54.05 
 
 		 227 aa  204  8e-52  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.142154  normal  0.272491 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1324  methylation  49.33 
 
 		 235 aa  204  1e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0651  hypothetical protein  53.57 
 
 		 225 aa  203  2e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.00814892  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0922  Type II secretory pathway component  49.32 
 
 		 217 aa  201  7e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.235402  normal  0.870714 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5692  hypothetical protein  45.13 
 
 		 233 aa  189  4e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.434625  normal  0.174572 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0537  methylation  46.79 
 
 		 226 aa  181  8.000000000000001e-45  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0761  methylation precursor  50.85 
 
 		 238 aa  172  5e-42  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.327041  normal  0.127693 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3131  general secretion pathway protein J  37.04 
 
 		 215 aa  125  4.0000000000000003e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.702697  normal  0.037121 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3422  general secretion pathway protein J  37.1 
 
 		 232 aa  125  7e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000633509 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3047  general secretory pathway J transmembrane protein  36.54 
 
 		 240 aa  83.2  0.000000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.353213  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3394  putative general secretory pathway J transmembrane protein  39.47 
 
 		 247 aa  78.6  0.00000000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3109  general secretory pathway J transmembrane protein  37.33 
 
 		 240 aa  77  0.0000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.388678  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3387  Type II secretory pathway component PulJ  31.97 
 
 		 230 aa  61.6  0.000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3943  putative general secretory pathway protein J  36.23 
 
 		 228 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.173018 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3077  putative general secretory pathway protein J  33.09 
 
 		 234 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000785542 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0045  putative general secretion pathway protein J  35.16 
 
 		 234 aa  55.8  0.0000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0055  putative general secretion pathway protein J  35.16 
 
 		 224 aa  55.8  0.0000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0954003  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0056  putative general secretion pathway protein J  34.11 
 
 		 231 aa  53.1  0.000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0074  putative general secretion pathway protein J  34.09 
 
 		 222 aa  52.8  0.000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2778  general secretory pathway protein J  31.97 
 
 		 242 aa  52.8  0.000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2669  general secretory pathway protein J  31.97 
 
 		 242 aa  52.8  0.000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.393113  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0015  general secretion pathway protein J  31.97 
 
 		 242 aa  52.8  0.000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0530373  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1883  general secretory pathway protein J  31.97 
 
 		 242 aa  52.8  0.000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0015  general secretion pathway protein J  31.97 
 
 		 242 aa  52.8  0.000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0227  general secretory pathway protein J  31.97 
 
 		 242 aa  52.8  0.000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.291181  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3237  putative general secretion pathway protein J  34.62 
 
 		 229 aa  52.8  0.000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.722967  normal  0.701162 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0014  general secretory pathway protein J  31.15 
 
 		 242 aa  51.2  0.00001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3196  hypothetical protein  36.23 
 
 		 202 aa  50.8  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.114017  hitchhiker  0.00348326 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55530  putative type II secretion system protein  42.86 
 
 		 213 aa  50.1  0.00003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0378882 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2205  type II secretion system protein J  35.65 
 
 		 204 aa  50.1  0.00003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0654355  normal  0.781056 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1528  general secretion pathway protein J  35.94 
 
 		 291 aa  50.1  0.00003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.81636  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1342  hypothetical protein  29.75 
 
 		 210 aa  49.7  0.00004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1064  Type II secretory pathway component PulJ  30.26 
 
 		 226 aa  49.3  0.00005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00786562  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2854  general secretion pathway protein J  31.82 
 
 		 216 aa  47.4  0.0002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.400784  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0147  general secretion pathway protein J  32.5 
 
 		 253 aa  46.2  0.0005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1895  general secretion pathway protein J  26.03 
 
 		 206 aa  45.4  0.0007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24060  general secretion pathway protein J  41.67 
 
 		 237 aa  44.3  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2918  general secretion pathway protein J  32.79 
 
 		 215 aa  44.3  0.001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1418  general secretion pathway protein J  27.14 
 
 		 216 aa  44.3  0.001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2920  general secretion pathway protein J  36.36 
 
 		 239 aa  44.3  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.34948  normal  0.107134 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4782  Tfp pilus assembly protein  23.23 
 
 		 179 aa  43.9  0.002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.26372 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2035  general secretion pathway protein J  46.67 
 
 		 237 aa  43.9  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0394  hypothetical protein  63.33 
 
 		 252 aa  43.1  0.003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3241  general secretion pathway protein GspJ  30 
 
 		 201 aa  43.5  0.003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.575634 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3132  general secretion pathway protein J  30 
 
 		 201 aa  42.7  0.005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0842  hypothetical protein  32.5 
 
 		 193 aa  42.4  0.006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3224  general secretory pathway J transmembrane protein  26.05 
 
 		 212 aa  42  0.008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00607  general secretion pathway protein J  30.51 
 
 		 250 aa  41.6  0.009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3406  general secretion pathway protein GspJ  29.36 
 
 		 199 aa  41.6  0.01  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>