20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_0922 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008752  Aave_0922  Type II secretory pathway component  100 
 
 		 217 aa  424  1e-118  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.235402  normal  0.870714 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0672  hypothetical protein  66.21 
 
 		 227 aa  263  1e-69  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.142154  normal  0.272491 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0651  hypothetical protein  65.75 
 
 		 225 aa  261  4.999999999999999e-69  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.00814892  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3524  hypothetical protein  56.68 
 
 		 282 aa  236  2e-61  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0132086  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5692  hypothetical protein  51.34 
 
 		 233 aa  226  2e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.434625  normal  0.174572 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1324  methylation  50.45 
 
 		 235 aa  207  7e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0537  methylation  50.93 
 
 		 226 aa  197  7.999999999999999e-50  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1078  hypothetical protein  49.32 
 
 		 227 aa  193  2e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0761  methylation precursor  53.2 
 
 		 238 aa  187  1e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.327041  normal  0.127693 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3422  general secretion pathway protein J  34.55 
 
 		 232 aa  101  1e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000633509 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3131  general secretion pathway protein J  31.88 
 
 		 215 aa  87  2e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.702697  normal  0.037121 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3394  putative general secretory pathway J transmembrane protein  31.43 
 
 		 247 aa  58.5  0.00000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3109  general secretory pathway J transmembrane protein  34.9 
 
 		 240 aa  57  0.0000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.388678  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3047  general secretory pathway J transmembrane protein  30.43 
 
 		 240 aa  53.5  0.000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.353213  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3077  putative general secretory pathway protein J  33.33 
 
 		 234 aa  49.3  0.00005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000785542 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3943  putative general secretory pathway protein J  29.84 
 
 		 228 aa  46.6  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.173018 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3387  Type II secretory pathway component PulJ  30.59 
 
 		 230 aa  44.7  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1528  general secretion pathway protein J  36.54 
 
 		 291 aa  43.1  0.003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.81636  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3196  hypothetical protein  31.75 
 
 		 202 aa  42.4  0.005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.114017  hitchhiker  0.00348326 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0014  general secretory pathway protein J  26.23 
 
 		 242 aa  42.4  0.006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>