85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_2035 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_2035  general secretion pathway protein J  100 
 
 		 237 aa  473  1e-132  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24060  general secretion pathway protein J  94.51 
 
 		 237 aa  430  1e-119  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2920  general secretion pathway protein J  60.8 
 
 		 239 aa  234  7e-61  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.34948  normal  0.107134 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1354  general secretion pathway protein J  38.14 
 
 		 254 aa  148  6e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4585  general secretion pathway protein J  37.44 
 
 		 219 aa  128  8.000000000000001e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.979233  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1305  general secretion pathway protein J  36.49 
 
 		 246 aa  124  1e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0103  general secretion pathway protein J  34.63 
 
 		 211 aa  113  2.0000000000000002e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0256  general secretion pathway protein J  37.63 
 
 		 204 aa  107  2e-22  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.745018  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03962  general secretion pathway protein J  35.64 
 
 		 208 aa  103  2e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3241  general secretion pathway protein GspJ  33.17 
 
 		 201 aa  103  3e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.575634 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3132  general secretion pathway protein J  33.17 
 
 		 201 aa  102  5e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3421  general secretion pathway protein J  33.17 
 
 		 199 aa  101  1e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3406  general secretion pathway protein GspJ  33.17 
 
 		 199 aa  101  1e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1418  general secretion pathway protein J  32.02 
 
 		 216 aa  100  2e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2854  general secretion pathway protein J  31.53 
 
 		 216 aa  99.8  3e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.400784  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1410  general secretion pathway protein J  32.82 
 
 		 199 aa  98.2  9e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0118952  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2388  general secretion pathway protein J  37.86 
 
 		 212 aa  97.8  1e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000292779 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0111  general secretion pathway protein J  32.14 
 
 		 236 aa  97.1  2e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00607  general secretion pathway protein J  33.99 
 
 		 250 aa  97.4  2e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0155  general secretion pathway protein J  32.59 
 
 		 257 aa  96.7  3e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1476  general secretion pathway protein J  30.84 
 
 		 237 aa  96.7  3e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0237  general secretion pathway protein J  33.33 
 
 		 232 aa  95.1  8e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0159  general secretion pathway protein J  32.59 
 
 		 259 aa  95.1  8e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0570071 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0159  general secretion pathway protein J  32.59 
 
 		 259 aa  95.1  8e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4200  general secretion pathway protein J  32.59 
 
 		 263 aa  95.1  9e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0175  general secretion pathway protein J  31.22 
 
 		 259 aa  94  2e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.729564  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1385  general secretion pathway protein J  33.7 
 
 		 198 aa  92  6e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.44929  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0150  general secretion pathway protein J  30.7 
 
 		 241 aa  91.7  9e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02782  hypothetical protein  31.66 
 
 		 189 aa  91.7  1e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000034032  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0172  general secretion pathway protein J  31.74 
 
 		 255 aa  91.3  1e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3613  general secretion pathway protein J  33.83 
 
 		 259 aa  90.9  1e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0162  general secretion pathway protein J  29.96 
 
 		 253 aa  90.5  2e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.933728 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001886  general secretion pathway protein J  30.45 
 
 		 225 aa  90.1  3e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0157  general secretion pathway protein J  31.34 
 
 		 253 aa  89  5e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0127  general secretion pathway protein J  29.69 
 
 		 251 aa  89  6e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4352  general secretion pathway protein J  32.5 
 
 		 250 aa  89  6e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02832  hypothetical type II secretion protein GspJ  31.47 
 
 		 187 aa  88.6  7e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000053878  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0157  general secretion pathway protein J  31.48 
 
 		 255 aa  88.6  8e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1310  type II secretory pathway protein LspJ  28.79 
 
 		 205 aa  86.7  3e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1313  type II secretory pathway protein LspJ  28.79 
 
 		 205 aa  85.9  5e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2918  general secretion pathway protein J  26.63 
 
 		 215 aa  85.9  5e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0009  general secretion pathway protein J  37 
 
 		 199 aa  83.6  0.000000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.264866 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4728  general secretion pathway protein J  30.24 
 
 		 264 aa  83.2  0.000000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3561  general secretion pathway protein J  30.73 
 
 		 252 aa  82.4  0.000000000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0147  general secretion pathway protein J  29.18 
 
 		 253 aa  80.9  0.00000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4245  general secretion pathway protein J  29.56 
 
 		 197 aa  79.3  0.00000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0360831 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2375  general secretion pathway protein J  35.88 
 
 		 223 aa  78.6  0.00000000000008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.69272  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2300  general secretion pathway protein J  30.15 
 
 		 221 aa  76.3  0.0000000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0321  general secretion pathway protein J  27.92 
 
 		 203 aa  73.9  0.000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3574  general secretion pathway protein J  24.51 
 
 		 212 aa  72  0.000000000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.629666 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2580  hypothetical protein  29.81 
 
 		 202 aa  68.2  0.0000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.214724  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1528  general secretion pathway protein J  30.36 
 
 		 291 aa  65.1  0.0000000009  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.81636  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0234  general secretion pathway protein J  31.34 
 
 		 193 aa  65.1  0.0000000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3525  general secretion pathway protein J  26.34 
 
 		 195 aa  59.7  0.00000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1895  general secretion pathway protein J  27.13 
 
 		 206 aa  59.7  0.00000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0958  general secretion pathway protein J  22.11 
 
 		 198 aa  58.9  0.00000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.83965  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0382  general secretion pathway protein J  26.34 
 
 		 195 aa  58.5  0.00000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03133  hypothetical protein  26.34 
 
 		 195 aa  58.5  0.00000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03182  predicted general secretory pathway component, cryptic  26.34 
 
 		 195 aa  58.5  0.00000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0382  general secretion pathway protein J  26.34 
 
 		 195 aa  58.5  0.00000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.278127 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1010  general secretion pathway protein J  21.61 
 
 		 198 aa  57.4  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3196  hypothetical protein  28.79 
 
 		 202 aa  53.1  0.000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.114017  hitchhiker  0.00348326 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0651  hypothetical protein  35.58 
 
 		 225 aa  52  0.000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.00814892  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3047  general secretory pathway J transmembrane protein  42.62 
 
 		 240 aa  51.2  0.00001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.353213  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3394  putative general secretory pathway J transmembrane protein  42.37 
 
 		 247 aa  49.7  0.00004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0672  hypothetical protein  36 
 
 		 227 aa  49.7  0.00004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.142154  normal  0.272491 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3109  general secretory pathway J transmembrane protein  42.37 
 
 		 240 aa  48.5  0.00009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.388678  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0387  prepilin-type cleavage/methylation-like protein  31.08 
 
 		 220 aa  47.4  0.0002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.618821 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55530  putative type II secretion system protein  31.65 
 
 		 213 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0378882 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0724  hypothetical protein  29.32 
 
 		 239 aa  47.4  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.521463  normal  0.453877 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2535  general secretory pathway protein J  25.7 
 
 		 223 aa  47  0.0003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0358104  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5692  hypothetical protein  36.67 
 
 		 233 aa  46.6  0.0003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.434625  normal  0.174572 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2205  type II secretion system protein J  39.29 
 
 		 204 aa  46.2  0.0004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0654355  normal  0.781056 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3524  hypothetical protein  41.38 
 
 		 282 aa  45.8  0.0005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0132086  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3310  Type II secretory pathway component PulJ-like protein  26.34 
 
 		 181 aa  44.3  0.002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1078  hypothetical protein  47.73 
 
 		 227 aa  43.5  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2614  putative general secretion pathway protein J  30.34 
 
 		 237 aa  42.7  0.005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.460481 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3034  prepilin-type cleavage/methylation-like protein  38.1 
 
 		 333 aa  42.4  0.006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0770225 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1104  prepilin-type cleavage/methylation  33.33 
 
 		 176 aa  42  0.008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.945124  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2952  prepilin-type cleavage/methylation-like protein  36.51 
 
 		 337 aa  42  0.009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.501472  normal  0.202788 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2301  general secretion pathway protein I  38.24 
 
 		 117 aa  42  0.009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0563  hypothetical protein  40 
 
 		 227 aa  42  0.009  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.731892 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0714  hypothetical protein  28.95 
 
 		 220 aa  42  0.009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0511321  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2553  Type II secretory pathway component PulJ-like  27.22 
 
 		 236 aa  41.6  0.01  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.562028  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0715  hypothetical protein  29.15 
 
 		 220 aa  41.6  0.01  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>