26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_3370 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_3370  N-terminal methylation  100 
 
 		 211 aa  423  1e-117  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.306452 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0323  general secretion pathway protein j, putative  68.48 
 
 		 186 aa  270  2e-71  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0677  hypothetical protein  52.13 
 
 		 190 aa  206  3e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0602  N-terminal methylation protein  51.74 
 
 		 201 aa  179  2.9999999999999997e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000162543 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0589  N-terminal methylation protein  52.74 
 
 		 201 aa  174  9.999999999999999e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1275  N-terminal methylation  47 
 
 		 202 aa  170  1e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4585  general secretion pathway protein J  27.36 
 
 		 219 aa  58.9  0.00000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.979233  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0714  hypothetical protein  29.47 
 
 		 220 aa  54.3  0.000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0511321  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0680  hypothetical protein  29.19 
 
 		 220 aa  53.5  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.197262  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2614  putative general secretion pathway protein J  27.15 
 
 		 237 aa  53.9  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.460481 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0715  hypothetical protein  29.47 
 
 		 220 aa  52.4  0.000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0724  hypothetical protein  31.1 
 
 		 239 aa  50.4  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.521463  normal  0.453877 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1093  hypothetical protein  28.11 
 
 		 196 aa  49.7  0.00003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.377212  normal  0.221471 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1418  general secretion pathway protein J  26.54 
 
 		 216 aa  48.5  0.00006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1052  type II secretion pathway protein XcpW  28.42 
 
 		 196 aa  48.1  0.00009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.192612  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4174  type II secretion system protein J  27.04 
 
 		 196 aa  46.6  0.0003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1049  type II secretion system protein J  29.63 
 
 		 196 aa  46.2  0.0004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001886  general secretion pathway protein J  22.34 
 
 		 225 aa  46.2  0.0004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0266  hypothetical protein  30.88 
 
 		 326 aa  44.3  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.343829  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2854  general secretion pathway protein J  20.73 
 
 		 216 aa  44.7  0.001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.400784  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2375  general secretion pathway protein J  40.32 
 
 		 223 aa  43.1  0.003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.69272  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00607  general secretion pathway protein J  22.28 
 
 		 250 aa  42.4  0.006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0958  general secretion pathway protein J  22.22 
 
 		 198 aa  41.6  0.008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.83965  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1354  general secretion pathway protein J  27.84 
 
 		 254 aa  41.6  0.008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1600  prepilin-type N-terminal cleavage/methylation domain-containing protein  32.76 
 
 		 245 aa  41.6  0.009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2388  general secretion pathway protein J  33.33 
 
 		 212 aa  41.2  0.01  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000292779 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>