51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_1303 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007404  Tbd_1303  hypothetical protein  100 
 
 		 173 aa  353  5e-97  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.529272  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2411  hypothetical protein  53.15 
 
 		 192 aa  155  2e-37  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2296  hypothetical protein  48.43 
 
 		 175 aa  155  4e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.475849  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3475  hypothetical protein  47.8 
 
 		 176 aa  154  6e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.189272  normal  0.870698 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2462  hypothetical protein  47.8 
 
 		 175 aa  152  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.871251  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2580  hypothetical protein  47.44 
 
 		 270 aa  150  1e-35  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.10133  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02980  putative transmembrane protein  50.35 
 
 		 159 aa  142  3e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.174988  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2471  hypothetical protein  47.17 
 
 		 175 aa  140  6e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.623057  normal  0.331692 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1333  hypothetical protein  42.24 
 
 		 164 aa  135  3.0000000000000003e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.419421  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29070  hypothetical protein  50.33 
 
 		 160 aa  135  3.0000000000000003e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1442  hypothetical protein  45.7 
 
 		 189 aa  131  5e-30  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.000142032  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1990  hypothetical protein  44.44 
 
 		 169 aa  130  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0471488  normal  0.098607 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1441  hypothetical protein  49.18 
 
 		 179 aa  124  5e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0147619  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3219  hypothetical protein  43.15 
 
 		 177 aa  124  8.000000000000001e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.289131 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1448  hypothetical protein  40.76 
 
 		 172 aa  124  9e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3887  hypothetical protein  46.26 
 
 		 264 aa  121  5e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0128  type II secretory pathway, pseudopilin PulG  40.79 
 
 		 170 aa  117  7.999999999999999e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0493  hypothetical protein  39.02 
 
 		 192 aa  109  2.0000000000000002e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0553  hypothetical protein  39.87 
 
 		 191 aa  106  2e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4703  hypothetical protein  43.61 
 
 		 203 aa  104  6e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0262832  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2300  signal peptide protein  39.57 
 
 		 164 aa  103  1e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.590033  normal  0.0335477 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1415  hypothetical protein  42.28 
 
 		 150 aa  102  3e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0753464  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0595  hypothetical protein  37.84 
 
 		 168 aa  99.4  2e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  1.5318399999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2622  hypothetical protein  39.62 
 
 		 188 aa  98.2  6e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2917  hypothetical protein  34.29 
 
 		 160 aa  95.1  4e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.582849  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0266  hypothetical protein  37.8 
 
 		 187 aa  87  1e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00510012 
 
 
-
 
NC_003296  RS00347  hypothetical protein  38.93 
 
 		 154 aa  87  1e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0281  hypothetical protein  36.59 
 
 		 201 aa  82  0.000000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.534278  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1580  hypothetical protein  31.37 
 
 		 314 aa  59.7  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.528677  normal  0.0547488 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4704  Type II secretion system protein G  34.48 
 
 		 145 aa  58.5  0.00000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0140964  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2621  type II secretion system protein G  30.91 
 
 		 184 aa  52.8  0.000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS00348  general secretion pathway GSPG-like transmembrane protein  31.25 
 
 		 128 aa  52  0.000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2581  N-terminal methylation site  30.17 
 
 		 138 aa  50.8  0.000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2301  putative GSPG-related protein  30.77 
 
 		 130 aa  50.1  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.152629  normal  0.0321295 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2413  type II secretion system protein G  34.86 
 
 		 149 aa  50.1  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.330838  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3476  type II secretion system protein G  32.76 
 
 		 128 aa  47  0.0001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0390478  normal  0.854758 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0138  putative pilus assembly protein  26.85 
 
 		 149 aa  47  0.0001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2295  type II secretion system protein G  32.76 
 
 		 124 aa  47  0.0001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.478951  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2470  type II secretion system protein G  30 
 
 		 124 aa  47  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.335351  normal  0.427711 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1989  hypothetical protein  28.87 
 
 		 124 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0788365  normal  0.18788 
 
 
-
 
NC_003296  RS02979  putative general secretion pathway GSPG related transmembrane protein  29.17 
 
 		 129 aa  45.8  0.0003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.811632  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2461  type II secretion system protein G  31.9 
 
 		 124 aa  45.8  0.0003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.508549  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2582  N-terminal methylation site  30.83 
 
 		 170 aa  45.8  0.0003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1334  methylation  27.66 
 
 		 133 aa  45.4  0.0004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.372792  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3886  type II secretion system protein G  32.76 
 
 		 122 aa  45.1  0.0005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2302  GSPG-like signal peptide protein  35.51 
 
 		 172 aa  43.5  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.186261  normal  0.0333639 
 
 
-
 
NC_003296  RS02978  putative general secretion pathway GSPG related transmembrane protein  37.04 
 
 		 172 aa  43.1  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.671308  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1440  type II secretion system protein G  29.86 
 
 		 131 aa  43.1  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0197781  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29080  general secretion pathway protein G  28.69 
 
 		 124 aa  42.7  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1301  type II secretion system protein  28.29 
 
 		 168 aa  41.6  0.006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.12689  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1440  type II secretion system transmembrane protein  32.31 
 
 		 158 aa  41.2  0.008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00799419  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>