97 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_2998 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012918  GM21_2998  hypothetical protein  100 
 
 
164 aa  327  4e-89  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000440497 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1285  hypothetical protein  92.68 
 
 
164 aa  278  2e-74  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1930  hypothetical protein  66.27 
 
 
164 aa  213  9.999999999999999e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000900532  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1777  hypothetical protein  64.15 
 
 
177 aa  204  6e-52  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00171207  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1858  N-terminal methylation  59.76 
 
 
161 aa  191  3e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.450176 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2414  general secretion pathway protein G  61.21 
 
 
164 aa  183  1.0000000000000001e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1461  hypothetical protein  54.78 
 
 
162 aa  160  6e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0137  type II secretory pathway, pseudopilin PulG  56.88 
 
 
161 aa  155  3e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1678  type II secretory pathway, pseudopilin PulG  48.15 
 
 
163 aa  153  1e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1998  general secretion pathway protein G  47.37 
 
 
140 aa  130  6e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.484444  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2413  methylation  47.2 
 
 
157 aa  127  6e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3885  hypothetical protein  45.28 
 
 
161 aa  123  1e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1440  type II secretion system transmembrane protein  43.04 
 
 
158 aa  120  6e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00799419  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29090  general secretion pathway protein G  46.2 
 
 
160 aa  120  9.999999999999999e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.260708  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4705  putative secretion type II protein  43.9 
 
 
176 aa  119  1.9999999999999998e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0420147  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1988  hypothetical protein  42.77 
 
 
157 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0923651  normal  0.190547 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2302  GSPG-like signal peptide protein  44.38 
 
 
172 aa  117  4.9999999999999996e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.186261  normal  0.0333639 
 
 
-
 
NC_003296  RS02978  putative general secretion pathway GSPG related transmembrane protein  45.62 
 
 
172 aa  115  3e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.671308  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1301  type II secretion system protein  43.04 
 
 
168 aa  113  1.0000000000000001e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.12689  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2294  Type II secretory pathway pseudopilin PulG-like protein  45.22 
 
 
159 aa  107  1e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.797755  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3477  hypothetical protein  44.94 
 
 
159 aa  107  1e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.103302  normal  0.864591 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2460  secretion type II protein  44.59 
 
 
159 aa  104  5e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.839329  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2620  putative general secretion pathway GspG related transmembrane protein  44.72 
 
 
159 aa  103  8e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS00349  putative general secretion pathway GSPG-related transmembrane protein  41.4 
 
 
158 aa  101  5e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3217  N-terminal methylation site  42.5 
 
 
159 aa  100  8e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.280155 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2469  G protein signal peptide-like secretion type II protein  42.41 
 
 
157 aa  100  9e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.354384  normal  0.562325 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2582  N-terminal methylation site  38.65 
 
 
170 aa  97.4  8e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1335  methylation  42.86 
 
 
161 aa  92  3e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0885873  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1439  general secretion pathway GspG related transmembrane protein  39.62 
 
 
160 aa  89  2e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0119159  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2997  type II secretion system protein G  33.33 
 
 
135 aa  74.3  0.0000000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000413298 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3311  fimbrial protein pilin  33.55 
 
 
137 aa  72.8  0.000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1440  type II secretion system protein G  32.26 
 
 
131 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0197781  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1857  N-terminal methylation  28.4 
 
 
140 aa  68.2  0.00000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.36825 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1460  type II secretion system protein G  29.59 
 
 
153 aa  67  0.0000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.52288  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3886  type II secretion system protein G  29.94 
 
 
122 aa  65.9  0.0000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1441  type II secretion system protein G  32.48 
 
 
129 aa  65.5  0.0000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.000189967  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1286  type II secretion system protein G  33.54 
 
 
135 aa  63.9  0.0000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1334  methylation  32.26 
 
 
133 aa  61.6  0.000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.372792  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0138  putative pilus assembly protein  30.77 
 
 
149 aa  59.7  0.00000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3218  general secretion pathway protein G  27.95 
 
 
126 aa  58.9  0.00000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.427151 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1999  general secretion pathway protein G  29.94 
 
 
131 aa  58.9  0.00000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.607295  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2412  methylation  28.85 
 
 
126 aa  58.5  0.00000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1931  type II secretion system protein G  28.12 
 
 
138 aa  58.2  0.00000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000053439  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29080  general secretion pathway protein G  29.94 
 
 
124 aa  57.4  0.00000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1302  type II secretion system protein  33.56 
 
 
124 aa  56.2  0.0000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0879623  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3034  protein of unknown function DUF1559  36.07 
 
 
326 aa  56.2  0.0000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2581  N-terminal methylation site  30.32 
 
 
138 aa  55.5  0.0000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00348  general secretion pathway GSPG-like transmembrane protein  27.39 
 
 
128 aa  55.5  0.0000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2470  type II secretion system protein G  28.03 
 
 
124 aa  53.9  0.0000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.335351  normal  0.427711 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2471  protein of unknown function DUF1559  33.9 
 
 
338 aa  53.9  0.000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3476  type II secretion system protein G  26.83 
 
 
128 aa  53.5  0.000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0390478  normal  0.854758 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1989  hypothetical protein  28.03 
 
 
124 aa  53.5  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0788365  normal  0.18788 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0032  protein of unknown function DUF1559  36.84 
 
 
323 aa  52.8  0.000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.98147  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2295  type II secretion system protein G  27.39 
 
 
124 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.478951  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4704  Type II secretion system protein G  31.75 
 
 
145 aa  52.8  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0140964  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1776  pilin domain-containing protein  28.95 
 
 
121 aa  52.4  0.000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0337137  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3450  protein of unknown function DUF1559  32.79 
 
 
330 aa  52  0.000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.517501  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1892  protein of unknown function DUF1559  34.48 
 
 
325 aa  51.6  0.000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2461  type II secretion system protein G  26.75 
 
 
124 aa  51.2  0.000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.508549  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS02979  putative general secretion pathway GSPG related transmembrane protein  27.56 
 
 
129 aa  50.4  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.811632  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0033  protein of unknown function DUF1559  34.48 
 
 
323 aa  50.4  0.00001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4235  protein of unknown function DUF1559  33.33 
 
 
313 aa  50.1  0.00001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0227549  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2621  type II secretion system protein G  35.51 
 
 
184 aa  50.1  0.00002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1480  protein of unknown function DUF1559  36.36 
 
 
362 aa  49.7  0.00002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.546488  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2301  putative GSPG-related protein  33.33 
 
 
130 aa  48.9  0.00003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.152629  normal  0.0321295 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2923  general secretion pathway protein G  28.57 
 
 
141 aa  48.9  0.00003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.370501  normal  0.274003 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2678  protein of unknown function DUF1559  35.85 
 
 
349 aa  48.9  0.00003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.28415  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1313  type II secretory pathway protein LspG  28.07 
 
 
140 aa  47.4  0.00009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1316  type II secretory pathway protein LspG  28.07 
 
 
140 aa  47.4  0.00009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2413  type II secretion system protein G  24.86 
 
 
149 aa  47.4  0.00009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.330838  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1361  protein of unknown function DUF1559  27.12 
 
 
324 aa  46.6  0.0001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.462339  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2840  protein of unknown function DUF1559  36.54 
 
 
348 aa  47  0.0001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2587  general secretion pathway protein G  26.72 
 
 
161 aa  45.1  0.0004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0027  protein of unknown function DUF1559  29.31 
 
 
331 aa  44.7  0.0006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.13205  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0687  hypothetical protein  35.85 
 
 
138 aa  44.3  0.0007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.753224  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4074  protein of unknown function DUF1559  27.59 
 
 
321 aa  44.3  0.0007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0877  N-terminal methylation motif domain protein  27.47 
 
 
142 aa  44.3  0.0008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0779  hypothetical protein  26.19 
 
 
136 aa  43.9  0.0009  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3110  protein of unknown function DUF1559  29.82 
 
 
353 aa  43.9  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.413132  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1413  general secretion pathway protein G  26.55 
 
 
144 aa  43.9  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0288958  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0878  N-terminal methylation motif domain protein  22.76 
 
 
142 aa  43.9  0.001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1078  pilin  23.78 
 
 
162 aa  43.1  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.18456 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1856  hypothetical protein  33.33 
 
 
301 aa  42.7  0.002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2032  general secretion pathway protein G  25 
 
 
142 aa  42.7  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2857  general secretion pathway protein G  24.77 
 
 
157 aa  42.4  0.003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1415  general secretion pathway protein G  25.69 
 
 
146 aa  42.4  0.003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24020  general secretion pathway protein G  25.68 
 
 
148 aa  42.4  0.003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0100  general secretion pathway protein G  25.86 
 
 
144 aa  42.4  0.003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0592  general secretion pathway protein G  37.7 
 
 
147 aa  42.4  0.003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0200  hypothetical protein  28.3 
 
 
155 aa  41.6  0.004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00000191145  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0006  general secretion pathway protein G  24.77 
 
 
144 aa  40.8  0.007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0815216 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1302  general secretion pathway protein G  25.69 
 
 
153 aa  40.8  0.008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1473  general secretion pathway protein G  25.69 
 
 
150 aa  40.8  0.008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.660645  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0728  hypothetical protein  30.12 
 
 
174 aa  40.8  0.008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0926  Tfp pilus assembly protein major pilin PilA-like protein  33.96 
 
 
171 aa  40.8  0.008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000619994  hitchhiker  8.71814e-18 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0304  protein of unknown function DUF1559  32.08 
 
 
377 aa  40.8  0.009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.182759  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0613  Type II secretory pathway pseudopilin PulG-like protein  38.89 
 
 
165 aa  40.4  0.01  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.0934015 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>