155 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_1858 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_1858  N-terminal methylation  100 
 
 		 161 aa  328  1e-89  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.450176 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1777  hypothetical protein  61.35 
 
 		 177 aa  203  8e-52  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00171207  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1930  hypothetical protein  61.88 
 
 		 164 aa  194  5.000000000000001e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000900532  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2414  general secretion pathway protein G  60.51 
 
 		 164 aa  179  1e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1285  hypothetical protein  61.59 
 
 		 164 aa  174  6e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2998  hypothetical protein  59.76 
 
 		 164 aa  172  9.999999999999999e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000440497 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1678  type II secretory pathway, pseudopilin PulG  50.31 
 
 		 163 aa  162  2.0000000000000002e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1461  hypothetical protein  58.75 
 
 		 162 aa  160  9e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0137  type II secretory pathway, pseudopilin PulG  51.22 
 
 		 161 aa  145  3e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3885  hypothetical protein  45.45 
 
 		 161 aa  140  6e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02978  putative general secretion pathway GSPG related transmembrane protein  45.57 
 
 		 172 aa  134  6.0000000000000005e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.671308  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2413  methylation  44.94 
 
 		 157 aa  132  1.9999999999999998e-30  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4705  putative secretion type II protein  42.95 
 
 		 176 aa  129  1.0000000000000001e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0420147  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1998  general secretion pathway protein G  46.36 
 
 		 140 aa  129  1.0000000000000001e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.484444  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29090  general secretion pathway protein G  42.68 
 
 		 160 aa  126  1.0000000000000001e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.260708  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1988  hypothetical protein  41.03 
 
 		 157 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0923651  normal  0.190547 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1301  type II secretion system protein  43.23 
 
 		 168 aa  125  3e-28  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.12689  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3217  N-terminal methylation site  43.04 
 
 		 159 aa  124  5e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.280155 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1440  type II secretion system transmembrane protein  39.87 
 
 		 158 aa  123  9e-28  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00799419  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2302  GSPG-like signal peptide protein  42.31 
 
 		 172 aa  120  8e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.186261  normal  0.0333639 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2620  putative general secretion pathway GspG related transmembrane protein  40.99 
 
 		 159 aa  120  8e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2582  N-terminal methylation site  40.65 
 
 		 170 aa  109  2.0000000000000002e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2469  G protein signal peptide-like secretion type II protein  42.68 
 
 		 157 aa  108  3e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.354384  normal  0.562325 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2294  Type II secretory pathway pseudopilin PulG-like protein  40.99 
 
 		 159 aa  108  3e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.797755  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2460  secretion type II protein  40.99 
 
 		 159 aa  107  5e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.839329  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3477  hypothetical protein  40.76 
 
 		 159 aa  107  7.000000000000001e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.103302  normal  0.864591 
 
 
-
 
NC_003296  RS00349  putative general secretion pathway GSPG-related transmembrane protein  37.91 
 
 		 158 aa  102  3e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1335  methylation  40.26 
 
 		 161 aa  100  1e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0885873  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1439  general secretion pathway GspG related transmembrane protein  35.85 
 
 		 160 aa  84.7  5e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0119159  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1460  type II secretion system protein G  33.13 
 
 		 153 aa  79  0.00000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.52288  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1857  N-terminal methylation  31.93 
 
 		 140 aa  76.6  0.0000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.36825 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2997  type II secretion system protein G  33.12 
 
 		 135 aa  75.5  0.0000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000413298 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3311  fimbrial protein pilin  33.97 
 
 		 137 aa  74.7  0.0000000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1441  type II secretion system protein G  31.45 
 
 		 129 aa  70.1  0.00000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.000189967  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3886  type II secretion system protein G  30.97 
 
 		 122 aa  69.3  0.00000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1931  type II secretion system protein G  31.52 
 
 		 138 aa  66.6  0.0000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000053439  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3218  general secretion pathway protein G  29.75 
 
 		 126 aa  65.1  0.0000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.427151 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0138  putative pilus assembly protein  29.87 
 
 		 149 aa  63.9  0.0000000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1440  type II secretion system protein G  27.5 
 
 		 131 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0197781  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2413  type II secretion system protein G  29.48 
 
 		 149 aa  61.2  0.000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.330838  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29080  general secretion pathway protein G  29.11 
 
 		 124 aa  60.1  0.00000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2412  methylation  29.03 
 
 		 126 aa  59.3  0.00000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2923  general secretion pathway protein G  31.58 
 
 		 141 aa  58.9  0.00000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.370501  normal  0.274003 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1989  hypothetical protein  27.22 
 
 		 124 aa  57.8  0.00000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0788365  normal  0.18788 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1776  pilin domain-containing protein  32 
 
 		 121 aa  57.4  0.00000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0337137  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2581  N-terminal methylation site  29.81 
 
 		 138 aa  57.4  0.00000009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2621  type II secretion system protein G  35.58 
 
 		 184 aa  56.6  0.0000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1413  general secretion pathway protein G  29.66 
 
 		 144 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0288958  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1286  type II secretion system protein G  32.5 
 
 		 135 aa  55.8  0.0000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2032  general secretion pathway protein G  29.14 
 
 		 142 aa  56.6  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3476  type II secretion system protein G  27.22 
 
 		 128 aa  55.5  0.0000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0390478  normal  0.854758 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2295  type II secretion system protein G  27.22 
 
 		 124 aa  55.5  0.0000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.478951  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS00348  general secretion pathway GSPG-like transmembrane protein  28.85 
 
 		 128 aa  54.7  0.0000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24020  general secretion pathway protein G  30.7 
 
 		 148 aa  55.1  0.0000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1999  general secretion pathway protein G  26.11 
 
 		 131 aa  54.3  0.0000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.607295  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1116  general secretion pathway protein G  28.7 
 
 		 143 aa  54.3  0.0000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2461  type II secretion system protein G  26.58 
 
 		 124 aa  54.3  0.0000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.508549  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1334  methylation  29.52 
 
 		 133 aa  53.9  0.000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.372792  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2301  putative GSPG-related protein  32.08 
 
 		 130 aa  52.8  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.152629  normal  0.0321295 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4704  Type II secretion system protein G  29.25 
 
 		 145 aa  53.1  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0140964  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1316  type II secretory pathway protein LspG  26.79 
 
 		 140 aa  50.1  0.00001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1313  type II secretory pathway protein LspG  26.79 
 
 		 140 aa  50.1  0.00001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1302  type II secretion system protein  33.65 
 
 		 124 aa  49.7  0.00002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0879623  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2612  general secretion pathway protein G  27.21 
 
 		 153 aa  49.7  0.00002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.688921 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1488  hypothetical protein  34.52 
 
 		 158 aa  49.3  0.00002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.109192  normal  0.403243 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0144  general secretion pathway protein G  28.7 
 
 		 166 aa  47.8  0.00006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0779  hypothetical protein  37.5 
 
 		 136 aa  47.8  0.00006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0613  Type II secretory pathway pseudopilin PulG-like protein  41.38 
 
 		 165 aa  47.8  0.00007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0934015 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0124  general secretion pathway protein G  24.79 
 
 		 144 aa  47.8  0.00007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3030  general secretion pathway protein G  26.57 
 
 		 139 aa  47.4  0.00008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.187173  hitchhiker  0.00937307 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3179  general secretion pathway protein G  25.44 
 
 		 152 aa  47  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.223664  normal  0.0220476 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55490  HxcT pseudopilin  24.32 
 
 		 149 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.04599 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1024  hypothetical protein  28.81 
 
 		 162 aa  45.4  0.0003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1042  hypothetical protein  36.21 
 
 		 120 aa  45.4  0.0003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4829  HxcT pseudopilin  24.32 
 
 		 149 aa  45.8  0.0003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2580  hypothetical protein  28.67 
 
 		 270 aa  45.1  0.0004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.10133  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0169  general secretion pathway protein G  25.22 
 
 		 144 aa  44.7  0.0005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1265  methylation  28.44 
 
 		 160 aa  44.7  0.0005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00964428  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2471  protein of unknown function DUF1559  24.32 
 
 		 338 aa  45.1  0.0005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0154  general secretion pathway protein G  25.22 
 
 		 144 aa  44.7  0.0006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2532  general secretion pathway protein G  24.11 
 
 		 156 aa  44.7  0.0006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.211317  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4713  general secretion pathway protein G  25.18 
 
 		 166 aa  44.3  0.0007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0200  hypothetical protein  28.3 
 
 		 155 aa  44.3  0.0007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00000191145  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0147  general secretion pathway protein G  25.22 
 
 		 144 aa  43.9  0.0008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0877  N-terminal methylation motif domain protein  33.93 
 
 		 142 aa  43.9  0.0009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2303  general secretion pathway protein G  26.32 
 
 		 146 aa  43.9  0.0009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3419  general secretion pathway protein G  25 
 
 		 150 aa  43.1  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000422428 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0318  general secretion pathway protein G  22.64 
 
 		 163 aa  43.9  0.001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0159  general secretion pathway protein G  25.22 
 
 		 144 aa  43.9  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0154  general secretion pathway protein G  25.22 
 
 		 144 aa  43.9  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0878  N-terminal methylation motif domain protein  32.14 
 
 		 142 aa  43.1  0.001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3564  general secretion pathway protein G  25.22 
 
 		 144 aa  43.5  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4235  protein of unknown function DUF1559  24.29 
 
 		 313 aa  43.9  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0227549  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3248  hypothetical protein  29.57 
 
 		 132 aa  43.5  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0780  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  35.85 
 
 		 157 aa  42.7  0.002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2391  general secretion pathway protein G  28.44 
 
 		 144 aa  42.7  0.002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000271033 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0108  general secretion pathway protein G  23.48 
 
 		 144 aa  42.7  0.002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0384  general secretion pathway protein G  26.32 
 
 		 151 aa  42.7  0.002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.54833 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0260  pilin polypeptide  32.26 
 
 		 187 aa  42.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0231  general secretion pathway protein G  26.67 
 
 		 149 aa  42.7  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>