More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMA2070 on replicon NC_006348
Organism: Burkholderia mallei ATCC 23344



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006348  BMA2070  type IV pilus biogenesis protein, putative  100 
 
 		 150 aa  297  3e-80  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3190  type IV pilus protein  100 
 
 		 150 aa  297  3e-80  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3243  fimbrial protein pilin  100 
 
 		 150 aa  297  3e-80  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0840  putative type IV pilus biogenesis protein  100 
 
 		 150 aa  297  3e-80  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2673  putative type IV pilus biogenesis protein  100 
 
 		 150 aa  297  3e-80  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.822471  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3228  type IV pilus protein  100 
 
 		 150 aa  297  3e-80  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.61962  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1936  putative type IV pilus biogenesis protein  99.25 
 
 		 133 aa  259  1e-68  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1384  type IV pilus biogenesis protein, putative  79.05 
 
 		 150 aa  209  1e-53  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0771  hypothetical protein  50.34 
 
 		 142 aa  134  3.0000000000000003e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.25436 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3901  putative Tfp pilus assembly protein PilE  48.94 
 
 		 148 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0706  putative Tfp pilus assembly protein PilE  47.14 
 
 		 151 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.33887  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0689  putative Tfp pilus assembly protein PilE  47.14 
 
 		 151 aa  113  6.9999999999999995e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.786204  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3909  hypothetical protein  50.34 
 
 		 154 aa  110  8.000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0873326 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2575  putative Tfp pilus assembly protein PilE  41.43 
 
 		 143 aa  107  7.000000000000001e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.253595  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2443  hypothetical protein  46.76 
 
 		 139 aa  103  8e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.103414  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5180  fimbrial protein pilin  30.63 
 
 		 169 aa  76.6  0.0000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.0088813  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2540  fimbrial protein pilin  36.67 
 
 		 140 aa  72.4  0.000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5192  fimbrial protein pilin  34 
 
 		 143 aa  70.5  0.000000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.373526  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5198  fimbrial protein pilin  36.89 
 
 		 148 aa  70.1  0.000000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3189  fimbrial protein pilin  32.93 
 
 		 162 aa  70.1  0.00000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.208  normal  0.535395 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1764  type IV pilin  27.89 
 
 		 151 aa  67.8  0.00000000005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.940075  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1702  type IV pilin  27.89 
 
 		 151 aa  67.4  0.00000000006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.135824  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3102  fimbrial protein pilin  39.16 
 
 		 148 aa  67  0.00000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.193045  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0505  fimbrial protein pilin  28.95 
 
 		 159 aa  66.2  0.0000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2914  type IV pilin PilE  32.62 
 
 		 144 aa  65.9  0.0000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0462503 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0816  type IV pilus biogenesis protein  32.62 
 
 		 133 aa  62.8  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0720  fimbrial protein pilin  33.33 
 
 		 133 aa  61.2  0.000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60320  type 4 fimbrial biogenesis protein PilE  31.37 
 
 		 141 aa  59.7  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000362369 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2886  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  32.89 
 
 		 170 aa  58.9  0.00000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.308484  normal  0.94282 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0788  fimbrial protein pilin  32.24 
 
 		 163 aa  57.8  0.00000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.684386  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0719  type IV pilin  29.58 
 
 		 144 aa  57  0.00000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.464442  normal  0.176419 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0676  type IV pilin  29.58 
 
 		 144 aa  56.6  0.0000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.256255  normal  0.685259 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0778  putative Tfp pilus assembly protein PilE  35 
 
 		 155 aa  56.6  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.32654  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0250  fimbrial subunit  40 
 
 		 152 aa  55.5  0.0000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0333044  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2916  putative type 4 fimbrial biogenesis transmembrane protein  29.86 
 
 		 145 aa  54.7  0.0000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2904  putative type 4 fimbrial biogenesis transmembrane protein  32.45 
 
 		 168 aa  53.9  0.0000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.3004 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2680  type 4 fimbrial biogenesis transmembrane protein  30.87 
 
 		 146 aa  53.1  0.000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0580057 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1067  methylation site containing protein  32.52 
 
 		 130 aa  52.4  0.000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0723  type-4 fimbrial pilin-like transmembrane protein  26.47 
 
 		 161 aa  51.6  0.000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1383  type IV pilin PilE  33.33 
 
 		 135 aa  52  0.000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.140998  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3824  fimbrial protein pilin  25.74 
 
 		 164 aa  51.6  0.000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0456668 
 
 
-
 
NC_003296  RS05337  putative type-4 fimbrial pilin related signal peptide protein  32.38 
 
 		 181 aa  51.2  0.000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.693608 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3255  hypothetical protein  45.83 
 
 		 140 aa  51.2  0.000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5196  type 4 fimbrial biogenesis protein PilE  26.35 
 
 		 141 aa  50.8  0.000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5684  pilus assembly protein PilE  33.57 
 
 		 167 aa  50.8  0.000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.148368  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0872  general secretion pathway protein H  47.92 
 
 		 152 aa  50.8  0.000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.854476  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0384  putative pilin  28.81 
 
 		 147 aa  50.4  0.000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0957  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  36 
 
 		 141 aa  50.8  0.000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.296711 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0852  methylation site containing protein  51.02 
 
 		 131 aa  50.8  0.000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3170  methylation site containing protein  51.02 
 
 		 131 aa  50.8  0.000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0657  type IV pili biogenesis protein PilE  28.57 
 
 		 129 aa  50.4  0.000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.96879 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4551  type IV pili biogenesis protein PilE  30.95 
 
 		 129 aa  50.1  0.000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.402137  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4444  type IV pilin  28.86 
 
 		 160 aa  49.7  0.00001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1202  type IV pilus biogenesis protein PilE  46.15 
 
 		 130 aa  49.7  0.00001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3031  methylation site containing protein  42.31 
 
 		 133 aa  49.7  0.00001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.161431 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03468  Tfp pilus assembly protein major pilin PilA  43.59 
 
 		 141 aa  48.9  0.00002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1107  methylation site containing protein  46.15 
 
 		 130 aa  49.3  0.00002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.963603 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1091  methylation site containing protein  27.21 
 
 		 130 aa  49.3  0.00002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2949  methylation site containing protein  35.35 
 
 		 147 aa  49.3  0.00002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0811797  normal  0.399462 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1999  fimbrial protein  45.95 
 
 		 153 aa  49.3  0.00002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0611  type IV pili biogenesis protein PilE  28.57 
 
 		 129 aa  48.9  0.00003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0656  general secretion pathway protein H  39.8 
 
 		 199 aa  48.5  0.00003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1988  hypothetical protein  32.39 
 
 		 157 aa  48.9  0.00003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0923651  normal  0.190547 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4679  Tfp pilus assembly protein major pilin PilA  28.7 
 
 		 168 aa  48.5  0.00003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1661  type 4 pili biogenesis protein (prepilin-like protein)  28.23 
 
 		 136 aa  48.5  0.00003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.507585  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0520  type IV pilin  28.23 
 
 		 136 aa  48.5  0.00003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3128  methylation site containing protein  28.97 
 
 		 132 aa  48.5  0.00003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.932633 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08251  hypothetical protein  37.04 
 
 		 430 aa  48.1  0.00004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.328672  decreased coverage  0.0000133255 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0651  type IV pili biogenesis protein PilE  28.57 
 
 		 129 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.384502 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0086  type 4 fimbrial biogenesis protein PilE  29.41 
 
 		 150 aa  47.8  0.00006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1287  type 4 fimbrial biogenesis signal peptide protein  31.41 
 
 		 155 aa  47.4  0.00006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.54364 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002546  type IV pilin PilA  41.03 
 
 		 157 aa  47.4  0.00006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.790868  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2275  general secretion pathway protein H  47.92 
 
 		 164 aa  47.4  0.00006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0417  pilin, putative  47.5 
 
 		 138 aa  47.4  0.00007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2154  Tfp pilus assembly protein PilE  39.62 
 
 		 138 aa  47.4  0.00007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3313  methylation site containing protein  52.27 
 
 		 144 aa  47.4  0.00007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.936741  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02979  putative general secretion pathway GSPG related transmembrane protein  40 
 
 		 129 aa  47  0.00008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.811632  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20891  pilin  40.68 
 
 		 170 aa  47  0.00008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29090  general secretion pathway protein G  33.33 
 
 		 160 aa  47  0.00008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.260708  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0156  putative major pilin subunit  29.73 
 
 		 145 aa  47  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0157  putative major pilin subunit  29.73 
 
 		 145 aa  47  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0480  pilin subfamily protein  60.61 
 
 		 174 aa  47  0.00009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0158  putative major pilin subunit  29.73 
 
 		 145 aa  47  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.320147 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0421  methylation site containing protein  52.94 
 
 		 142 aa  47  0.00009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000175547  normal  0.0256712 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3945  fimbrial protein pilin  48.65 
 
 		 166 aa  46.2  0.0001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.373423  hitchhiker  0.00130999 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3498  putative major pilin subunit  53.12 
 
 		 154 aa  46.6  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1164  type IV pilus biogenesis protein PilE  42.31 
 
 		 130 aa  46.6  0.0001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.536283 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2663  type IV pilus biogenesis protein PilE  42.22 
 
 		 142 aa  46.2  0.0001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.839094  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3370  putative major pilin subunit  53.12 
 
 		 154 aa  46.6  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.981789  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3227  type IV pilus biogenesis protein PilE  42.31 
 
 		 130 aa  46.6  0.0001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0475  fimbrial protein pilin  53.12 
 
 		 139 aa  46.6  0.0001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.665132  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2143  pilin, putative  38.71 
 
 		 185 aa  46.6  0.0001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.200029  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2629  type IV pilus subunit PilA  38.71 
 
 		 138 aa  46.6  0.0001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1129  type IV pilus biogenesis protein PilE  42.31 
 
 		 130 aa  46.6  0.0001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3175  Fimbrial protein pilin  60.53 
 
 		 134 aa  46.6  0.0001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1062  type IV pilus biogenesis protein PilE  42.31 
 
 		 130 aa  46.6  0.0001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0164  putative major pilin subunit  29.73 
 
 		 145 aa  46.2  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.268979  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2686  pilus assembly protein PilE  33.77 
 
 		 158 aa  46.6  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.516424  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1041  putative major pilin subunit  53.12 
 
 		 154 aa  46.6  0.0001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.131052 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0161  putative major pilin subunit  29.73 
 
 		 145 aa  45.8  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>