More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BTH_I1384 on replicon NC_007651
Organism: Burkholderia thailandensis E264



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007651  BTH_I1384  type IV pilus biogenesis protein, putative  100 
 
 
150 aa  295  1e-79  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2070  type IV pilus biogenesis protein, putative  79.05 
 
 
150 aa  209  1e-53  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2673  putative type IV pilus biogenesis protein  79.05 
 
 
150 aa  209  1e-53  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.822471  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3243  fimbrial protein pilin  79.05 
 
 
150 aa  209  1e-53  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3190  type IV pilus protein  79.05 
 
 
150 aa  209  1e-53  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3228  type IV pilus protein  79.05 
 
 
150 aa  209  1e-53  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.61962  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0840  putative type IV pilus biogenesis protein  79.05 
 
 
150 aa  209  1e-53  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1936  putative type IV pilus biogenesis protein  79.66 
 
 
133 aa  191  2e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0771  hypothetical protein  47.59 
 
 
142 aa  128  3e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.25436 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3901  putative Tfp pilus assembly protein PilE  49.3 
 
 
148 aa  124  5e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0706  putative Tfp pilus assembly protein PilE  46.48 
 
 
151 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.33887  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0689  putative Tfp pilus assembly protein PilE  45.33 
 
 
151 aa  115  3e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.786204  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2443  hypothetical protein  50 
 
 
139 aa  107  4.0000000000000004e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.103414  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3909  hypothetical protein  55 
 
 
154 aa  105  2e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0873326 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2575  putative Tfp pilus assembly protein PilE  40.28 
 
 
143 aa  105  3e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.253595  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5180  fimbrial protein pilin  32.28 
 
 
169 aa  86.3  1e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.0088813  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5198  fimbrial protein pilin  39.44 
 
 
148 aa  79.7  0.00000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2540  fimbrial protein pilin  36.62 
 
 
140 aa  79.7  0.00000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3189  fimbrial protein pilin  35.37 
 
 
162 aa  78.2  0.00000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.208  normal  0.535395 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3102  fimbrial protein pilin  38.62 
 
 
148 aa  69.7  0.00000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.193045  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0505  fimbrial protein pilin  30.07 
 
 
159 aa  69.3  0.00000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2914  type IV pilin PilE  31.76 
 
 
144 aa  67.4  0.00000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0462503 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1764  type IV pilin  28.77 
 
 
151 aa  65.5  0.0000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.940075  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1702  type IV pilin  29.92 
 
 
151 aa  65.5  0.0000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.135824  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0816  type IV pilus biogenesis protein  32.85 
 
 
133 aa  65.5  0.0000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0720  fimbrial protein pilin  33.58 
 
 
133 aa  65.1  0.0000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0788  fimbrial protein pilin  35.44 
 
 
163 aa  63.2  0.000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.684386  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5192  fimbrial protein pilin  30.92 
 
 
143 aa  60.1  0.00000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.373526  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60320  type 4 fimbrial biogenesis protein PilE  30.87 
 
 
141 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000362369 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2886  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  32.89 
 
 
170 aa  58.2  0.00000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.308484  normal  0.94282 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0719  type IV pilin  30.67 
 
 
144 aa  57.8  0.00000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.464442  normal  0.176419 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0676  type IV pilin  30.67 
 
 
144 aa  57.4  0.00000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.256255  normal  0.685259 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0384  putative pilin  26.8 
 
 
147 aa  56.2  0.0000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3255  hypothetical protein  28.23 
 
 
140 aa  55.1  0.0000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3824  fimbrial protein pilin  24.05 
 
 
164 aa  55.1  0.0000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0456668 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2680  type 4 fimbrial biogenesis transmembrane protein  30.52 
 
 
146 aa  53.5  0.0000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0580057 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0657  type IV pili biogenesis protein PilE  29.45 
 
 
129 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.96879 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2916  putative type 4 fimbrial biogenesis transmembrane protein  26.17 
 
 
145 aa  52.8  0.000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2686  pilus assembly protein PilE  39.19 
 
 
158 aa  52.4  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.516424  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5684  pilus assembly protein PilE  32.89 
 
 
167 aa  52.8  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.148368  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1287  type 4 fimbrial biogenesis signal peptide protein  32.89 
 
 
155 aa  51.2  0.000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.54364 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0957  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  32.24 
 
 
141 aa  51.6  0.000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.296711 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0852  methylation site containing protein  51.02 
 
 
131 aa  51.6  0.000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3170  methylation site containing protein  51.02 
 
 
131 aa  51.6  0.000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0086  type 4 fimbrial biogenesis protein PilE  30.15 
 
 
150 aa  50.8  0.000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2949  methylation site containing protein  40.35 
 
 
147 aa  51.2  0.000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0811797  normal  0.399462 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3128  methylation site containing protein  40.35 
 
 
132 aa  50.8  0.000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.932633 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2904  putative type 4 fimbrial biogenesis transmembrane protein  31.25 
 
 
168 aa  50.8  0.000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.3004 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1107  methylation site containing protein  41.82 
 
 
130 aa  50.4  0.000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.963603 
 
 
-
 
NC_003296  RS05337  putative type-4 fimbrial pilin related signal peptide protein  36.36 
 
 
181 aa  50.1  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.693608 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2882  methylation  46.67 
 
 
132 aa  50.1  0.00001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.938712  normal  0.364905 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0493  methylation  33.33 
 
 
131 aa  50.1  0.00001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0872  general secretion pathway protein H  48.94 
 
 
152 aa  50.1  0.00001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.854476  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0250  fimbrial subunit  36.62 
 
 
152 aa  50.1  0.00001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0333044  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1067  methylation site containing protein  44.23 
 
 
130 aa  49.3  0.00002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4679  Tfp pilus assembly protein major pilin PilA  30.56 
 
 
168 aa  49.7  0.00002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1822  type IV pilin  30.28 
 
 
138 aa  48.9  0.00002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0523524  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004288  putative fimbrial assembly protein PilE  44.23 
 
 
163 aa  48.9  0.00002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1383  type IV pilin PilE  27.15 
 
 
135 aa  49.3  0.00002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.140998  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0778  putative Tfp pilus assembly protein PilE  31.88 
 
 
155 aa  48.5  0.00003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.32654  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1202  type IV pilus biogenesis protein PilE  40.74 
 
 
130 aa  48.9  0.00003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20891  pilin  37.1 
 
 
170 aa  48.5  0.00003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1931  type II secretion system protein G  26.32 
 
 
138 aa  48.5  0.00003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000053439  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3031  methylation site containing protein  35.09 
 
 
133 aa  48.1  0.00004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.161431 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2154  Tfp pilus assembly protein PilE  40.74 
 
 
138 aa  47.8  0.00005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29090  general secretion pathway protein G  42.11 
 
 
160 aa  47.4  0.00006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.260708  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0193  pilus assembly protein PilE  32.26 
 
 
147 aa  47.8  0.00006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.648056 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0446  putative type IV fimbrial pilin protein  44.16 
 
 
205 aa  47.4  0.00007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.590776 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5196  type 4 fimbrial biogenesis protein PilE  26.35 
 
 
141 aa  47.4  0.00007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2663  type IV pilus biogenesis protein PilE  38.78 
 
 
142 aa  47.4  0.00008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.839094  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2275  general secretion pathway protein H  50 
 
 
164 aa  47.4  0.00008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4551  type IV pili biogenesis protein PilE  28.08 
 
 
129 aa  47  0.00008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.402137  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0723  type-4 fimbrial pilin-like transmembrane protein  42 
 
 
161 aa  47  0.00009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1661  type 4 pili biogenesis protein (prepilin-like protein)  26.77 
 
 
136 aa  46.6  0.0001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.507585  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1988  hypothetical protein  45.45 
 
 
157 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0923651  normal  0.190547 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2143  pilin, putative  38.1 
 
 
185 aa  46.6  0.0001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.200029  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0520  type IV pilin  26.77 
 
 
136 aa  46.6  0.0001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02835  hypothetical type II secretion protein GspG  28.19 
 
 
151 aa  45.4  0.0002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000370073  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1164  type IV pilus biogenesis protein PilE  38.89 
 
 
130 aa  45.4  0.0002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.536283 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3227  type IV pilus biogenesis protein PilE  38.89 
 
 
130 aa  45.4  0.0002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0656  general secretion pathway protein H  39.8 
 
 
199 aa  45.8  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3135  general secretion pathway protein G  28.19 
 
 
151 aa  45.4  0.0002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02979  putative general secretion pathway GSPG related transmembrane protein  42.11 
 
 
129 aa  46.2  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.811632  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4444  type IV pilin  28.28 
 
 
160 aa  45.4  0.0002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4588  general secretion pathway protein G  27.61 
 
 
143 aa  45.8  0.0002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0417  pilin, putative  45 
 
 
138 aa  45.8  0.0002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1062  type IV pilus biogenesis protein PilE  38.89 
 
 
130 aa  45.4  0.0002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002546  type IV pilin PilA  40.54 
 
 
157 aa  46.2  0.0002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.790868  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0278  type IV pilin, putative  55.88 
 
 
172 aa  45.4  0.0002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0799  fimbrial protein pilin  27.2 
 
 
139 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0744296  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1129  type IV pilus biogenesis protein PilE  38.89 
 
 
130 aa  45.4  0.0002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03468  Tfp pilus assembly protein major pilin PilA  39.47 
 
 
141 aa  46.2  0.0002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0820  putative type IV pilin protein PilA  55.88 
 
 
172 aa  45.4  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2664  methylation  43.14 
 
 
160 aa  45.4  0.0002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1999  fimbrial protein  28.83 
 
 
153 aa  45.8  0.0002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0461  fimbrial protein precursor PilE (MS11 antigen)  43.75 
 
 
167 aa  45.4  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.653734  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02785  hypothetical protein  28.19 
 
 
151 aa  45.4  0.0002  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000404727  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5161  type IV pilin structural subunit  42.5 
 
 
179 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0816  putative type IV pilin protein PilA  55.88 
 
 
172 aa  45.4  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60280  type 4 fimbrial biogenesis protein FimU  44 
 
 
162 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000431898 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>