40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMA10247_1936 on replicon NC_009080
Organism: Burkholderia mallei NCTC 10247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009080  BMA10247_1936  putative type IV pilus biogenesis protein  100 
 
 		 133 aa  261  3e-69  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2070  type IV pilus biogenesis protein, putative  99.25 
 
 		 150 aa  259  1e-68  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3228  type IV pilus protein  99.25 
 
 		 150 aa  259  1e-68  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.61962  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3190  type IV pilus protein  99.25 
 
 		 150 aa  259  1e-68  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2673  putative type IV pilus biogenesis protein  99.25 
 
 		 150 aa  259  1e-68  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.822471  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0840  putative type IV pilus biogenesis protein  99.25 
 
 		 150 aa  259  1e-68  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3243  fimbrial protein pilin  99.25 
 
 		 150 aa  259  1e-68  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1384  type IV pilus biogenesis protein, putative  79.66 
 
 		 150 aa  191  2e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0771  hypothetical protein  50 
 
 		 142 aa  123  8.000000000000001e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.25436 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3901  putative Tfp pilus assembly protein PilE  46.62 
 
 		 148 aa  112  1.0000000000000001e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0706  putative Tfp pilus assembly protein PilE  45.93 
 
 		 151 aa  106  1e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.33887  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0689  putative Tfp pilus assembly protein PilE  45.93 
 
 		 151 aa  104  5e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.786204  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3909  hypothetical protein  49.21 
 
 		 154 aa  102  2e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0873326 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2575  putative Tfp pilus assembly protein PilE  39.55 
 
 		 143 aa  95.9  1e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.253595  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2443  hypothetical protein  47.33 
 
 		 139 aa  95.1  2e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.103414  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5180  fimbrial protein pilin  26.8 
 
 		 169 aa  60.5  0.000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.0088813  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2540  fimbrial protein pilin  33.93 
 
 		 140 aa  59.7  0.00000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1764  type IV pilin  26.12 
 
 		 151 aa  59.3  0.00000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.940075  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1702  type IV pilin  26.12 
 
 		 151 aa  59.3  0.00000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.135824  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5198  fimbrial protein pilin  34.21 
 
 		 148 aa  57.4  0.00000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3189  fimbrial protein pilin  29.94 
 
 		 162 aa  56.2  0.0000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.208  normal  0.535395 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0505  fimbrial protein pilin  26.03 
 
 		 159 aa  54.3  0.0000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5192  fimbrial protein pilin  30.83 
 
 		 143 aa  53.5  0.0000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.373526  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3102  fimbrial protein pilin  36.76 
 
 		 148 aa  53.1  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.193045  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2914  type IV pilin PilE  28.89 
 
 		 144 aa  52.4  0.000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0462503 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0788  fimbrial protein pilin  31.25 
 
 		 163 aa  48.9  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.684386  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0816  type IV pilus biogenesis protein  29.01 
 
 		 133 aa  47  0.00008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2886  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  30.22 
 
 		 170 aa  46.2  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.308484  normal  0.94282 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0777  putative Tfp pilus assembly protein PilE  36.14 
 
 		 105 aa  46.2  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.206246  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0720  fimbrial protein pilin  28.57 
 
 		 133 aa  45.4  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0957  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  34.85 
 
 		 141 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.296711 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60320  type 4 fimbrial biogenesis protein PilE  27.78 
 
 		 141 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000362369 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0719  type IV pilin  26.67 
 
 		 144 aa  43.1  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.464442  normal  0.176419 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0676  type IV pilin  26.67 
 
 		 144 aa  42.4  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.256255  normal  0.685259 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0778  putative Tfp pilus assembly protein PilE  32.06 
 
 		 155 aa  42.4  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.32654  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0250  fimbrial subunit  35 
 
 		 152 aa  42  0.003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0333044  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4551  type IV pili biogenesis protein PilE  29.66 
 
 		 129 aa  40.8  0.005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.402137  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0657  type IV pili biogenesis protein PilE  27.34 
 
 		 129 aa  41.2  0.005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.96879 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01325  type IV pilin  25.83 
 
 		 122 aa  40.8  0.006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.113469  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2916  putative type 4 fimbrial biogenesis transmembrane protein  26.47 
 
 		 145 aa  40  0.01  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>