149 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A3909 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007951  Bxe_A3909  hypothetical protein  100 
 
 		 154 aa  312  9e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0873326 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0771  hypothetical protein  79.22 
 
 		 142 aa  246  8e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.25436 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2443  hypothetical protein  57.89 
 
 		 139 aa  150  7e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.103414  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3901  putative Tfp pilus assembly protein PilE  50.38 
 
 		 148 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0706  putative Tfp pilus assembly protein PilE  45.39 
 
 		 151 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.33887  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0689  putative Tfp pilus assembly protein PilE  52.85 
 
 		 151 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.786204  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2575  putative Tfp pilus assembly protein PilE  47.29 
 
 		 143 aa  112  1.0000000000000001e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.253595  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2070  type IV pilus biogenesis protein, putative  49.33 
 
 		 150 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3243  fimbrial protein pilin  49.33 
 
 		 150 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0840  putative type IV pilus biogenesis protein  49.33 
 
 		 150 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2673  putative type IV pilus biogenesis protein  49.33 
 
 		 150 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.822471  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3190  type IV pilus protein  49.33 
 
 		 150 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3228  type IV pilus protein  49.33 
 
 		 150 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.61962  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1384  type IV pilus biogenesis protein, putative  55 
 
 		 150 aa  108  4.0000000000000004e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1936  putative type IV pilus biogenesis protein  50.39 
 
 		 133 aa  107  6e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2540  fimbrial protein pilin  40.44 
 
 		 140 aa  84  6e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5180  fimbrial protein pilin  32.12 
 
 		 169 aa  77.8  0.00000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.0088813  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3189  fimbrial protein pilin  33.33 
 
 		 162 aa  76.6  0.0000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.208  normal  0.535395 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5198  fimbrial protein pilin  32.35 
 
 		 148 aa  70.1  0.000000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0505  fimbrial protein pilin  30.23 
 
 		 159 aa  67.4  0.00000000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0816  type IV pilus biogenesis protein  31.87 
 
 		 133 aa  66.2  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1764  type IV pilin  29.69 
 
 		 151 aa  63.9  0.0000000008  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.940075  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1702  type IV pilin  29.69 
 
 		 151 aa  63.9  0.0000000008  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.135824  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1287  type 4 fimbrial biogenesis signal peptide protein  33.1 
 
 		 155 aa  63.2  0.000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.54364 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0788  fimbrial protein pilin  34.38 
 
 		 163 aa  62  0.000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.684386  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2914  type IV pilin PilE  33.55 
 
 		 144 aa  62  0.000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0462503 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0086  type 4 fimbrial biogenesis protein PilE  37.09 
 
 		 150 aa  61.2  0.000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3102  fimbrial protein pilin  37.75 
 
 		 148 aa  61.6  0.000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.193045  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0720  fimbrial protein pilin  31.25 
 
 		 133 aa  60.8  0.000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5192  fimbrial protein pilin  33.62 
 
 		 143 aa  60.5  0.000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.373526  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3824  fimbrial protein pilin  30.14 
 
 		 164 aa  60.1  0.00000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0456668 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2886  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  36.07 
 
 		 170 aa  58.9  0.00000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.308484  normal  0.94282 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2154  Tfp pilus assembly protein PilE  33.08 
 
 		 138 aa  55.8  0.0000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0852  methylation site containing protein  30.83 
 
 		 131 aa  56.2  0.0000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3170  methylation site containing protein  30.83 
 
 		 131 aa  56.2  0.0000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0657  type IV pili biogenesis protein PilE  31.2 
 
 		 129 aa  55.5  0.0000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.96879 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5196  type 4 fimbrial biogenesis protein PilE  29.01 
 
 		 141 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0778  putative Tfp pilus assembly protein PilE  36.8 
 
 		 155 aa  54.7  0.0000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.32654  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2916  putative type 4 fimbrial biogenesis transmembrane protein  34.71 
 
 		 145 aa  54.3  0.0000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4551  type IV pili biogenesis protein PilE  31.2 
 
 		 129 aa  54.3  0.0000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.402137  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1067  methylation site containing protein  31.36 
 
 		 130 aa  53.9  0.0000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1217  type IV pilus biogenesis protein PilE  29.8 
 
 		 141 aa  53.1  0.000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1383  type IV pilin PilE  35.96 
 
 		 135 aa  52.4  0.000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.140998  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0493  methylation  31.45 
 
 		 131 aa  52.8  0.000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0719  type IV pilin  34.17 
 
 		 144 aa  51.6  0.000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.464442  normal  0.176419 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0676  type IV pilin  33.33 
 
 		 144 aa  51.2  0.000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.256255  normal  0.685259 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0723  type-4 fimbrial pilin-like transmembrane protein  29.93 
 
 		 161 aa  50.4  0.000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0208  putative prepilin like protein  32.19 
 
 		 139 aa  50.4  0.000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0480818 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2680  type 4 fimbrial biogenesis transmembrane protein  29.61 
 
 		 146 aa  49.7  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0580057 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0239  pilus assembly protein PilE  30.57 
 
 		 145 aa  49.7  0.00001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.179125  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0520  type IV pilin  30.83 
 
 		 136 aa  49.7  0.00001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1091  methylation site containing protein  30.71 
 
 		 130 aa  50.1  0.00001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1661  type 4 pili biogenesis protein (prepilin-like protein)  30.83 
 
 		 136 aa  49.7  0.00001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.507585  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3168  prepilin-type cleavage/methylation  47.62 
 
 		 130 aa  49.3  0.00002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60320  type 4 fimbrial biogenesis protein PilE  33.08 
 
 		 141 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000362369 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3255  hypothetical protein  30.19 
 
 		 140 aa  48.9  0.00002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1822  type IV pilin  29.03 
 
 		 138 aa  48.9  0.00002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0523524  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0651  type IV pili biogenesis protein PilE  28.8 
 
 		 129 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.384502 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0611  type IV pili biogenesis protein PilE  29.27 
 
 		 129 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0853  pilin, putative  40 
 
 		 144 aa  48.9  0.00003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0193  pilus assembly protein PilE  31.39 
 
 		 147 aa  48.1  0.00004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.648056 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5684  pilus assembly protein PilE  34.45 
 
 		 167 aa  48.5  0.00004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.148368  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1202  type IV pilus biogenesis protein PilE  29.66 
 
 		 130 aa  48.1  0.00005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0854  type IV pilin, putative  33.87 
 
 		 123 aa  47.8  0.00005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2882  methylation site containing protein  32 
 
 		 138 aa  47.8  0.00005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1107  methylation site containing protein  28.81 
 
 		 130 aa  47.8  0.00005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.963603 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3128  methylation site containing protein  26.61 
 
 		 132 aa  47.8  0.00006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.932633 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1129  type IV pilus biogenesis protein PilE  29.37 
 
 		 130 aa  47.8  0.00006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0932  type IV pilus biogenesis protein PilE  32.54 
 
 		 132 aa  47.4  0.00007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0340511  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3227  type IV pilus biogenesis protein PilE  29.37 
 
 		 130 aa  47.4  0.00007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1062  type IV pilus biogenesis protein PilE  29.37 
 
 		 130 aa  47.4  0.00007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1164  type IV pilus biogenesis protein PilE  29.37 
 
 		 130 aa  47.4  0.00008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.536283 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3031  methylation site containing protein  28.57 
 
 		 133 aa  47.4  0.00008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.161431 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2949  methylation site containing protein  26.09 
 
 		 147 aa  47  0.00009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0811797  normal  0.399462 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0864  methylation site containing protein  36.99 
 
 		 145 aa  46.6  0.0001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0872  general secretion pathway protein H  52.5 
 
 		 152 aa  46.6  0.0001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.854476  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2275  general secretion pathway protein H  55 
 
 		 164 aa  45.8  0.0002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0138  putative pilus assembly protein  34.43 
 
 		 149 aa  46.2  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0446  putative type IV fimbrial pilin protein  42.59 
 
 		 205 aa  46.2  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.590776 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0852  methylation site containing protein  38.81 
 
 		 145 aa  46.2  0.0002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.992733 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0421  methylation site containing protein  48.72 
 
 		 142 aa  45.8  0.0002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000175547  normal  0.0256712 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0829  methylation site containing protein  36.99 
 
 		 145 aa  46.2  0.0002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0417  pilin, putative  48.72 
 
 		 138 aa  45.4  0.0003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3918  methylation site containing protein  48.72 
 
 		 143 aa  45.1  0.0003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000265425  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3313  methylation site containing protein  42.11 
 
 		 144 aa  45.1  0.0004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.936741  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2663  type IV pilus biogenesis protein PilE  39.29 
 
 		 142 aa  44.3  0.0006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.839094  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0709  methylation site containing protein  42.11 
 
 		 144 aa  44.3  0.0006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1999  general secretion pathway protein G  27.18 
 
 		 131 aa  44.3  0.0007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.607295  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0250  fimbrial subunit  48.89 
 
 		 152 aa  43.9  0.0007  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0333044  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0384  putative pilin  27.97 
 
 		 147 aa  43.9  0.0009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0717  putative type-4 frimbrial pilin-related signal peptide protein  31.97 
 
 		 143 aa  43.5  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.57248 
 
 
-
 
NC_003296  RS02979  putative general secretion pathway GSPG related transmembrane protein  38.46 
 
 		 129 aa  43.5  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.811632  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2686  pilus assembly protein PilE  41.67 
 
 		 158 aa  43.5  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.516424  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3344  prepilin-type cleavage/methylation  31.96 
 
 		 148 aa  43.5  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.62769  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0865  methylation site containing protein  32.48 
 
 		 126 aa  43.5  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0853  methylation site containing protein  32.48 
 
 		 126 aa  43.5  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01325  type IV pilin  29.31 
 
 		 122 aa  43.5  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.113469  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0830  methylation site containing protein  32.48 
 
 		 126 aa  43.5  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03231  type IV pilin  35.56 
 
 		 141 aa  42.7  0.002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0578635  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0979  PilA  50 
 
 		 207 aa  42.4  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>