257 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xfasm12_0896 on replicon NC_010513
Organism: Xylella fastidiosa M12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010513  Xfasm12_0896  fimbrillin  100 
 
 		 180 aa  368  1e-101  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1143  fimbrillin  93.33 
 
 		 180 aa  347  5e-95  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0638  fimbrillin  50.57 
 
 		 177 aa  176  1e-43  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.37134  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2031  fimbrial protein pilin  44.64 
 
 		 148 aa  115  1.9999999999999998e-25  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.187958  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2109  fimbrial protein  43.45 
 
 		 149 aa  108  6e-23  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2033  fimbrial protein pilin  37.06 
 
 		 146 aa  106  1e-22  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.244331  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2112  fimbrial protein  37.06 
 
 		 146 aa  107  1e-22  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0475  fimbrial protein pilin  36.97 
 
 		 139 aa  80.9  0.000000000000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.665132  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3896  Fimbrial protein pilin  30.59 
 
 		 133 aa  79.3  0.00000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3175  Fimbrial protein pilin  29.78 
 
 		 134 aa  75.1  0.0000000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3176  Fimbrial protein pilin  34.71 
 
 		 137 aa  67.4  0.0000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1999  fimbrial protein  31.14 
 
 		 153 aa  63.9  0.000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2449  Fimbrial protein pilin  30.17 
 
 		 162 aa  62.4  0.000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.000426279  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3356  fimbrial protein pilin: general secretion pathway protein H  40.32 
 
 		 137 aa  60.8  0.00000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.669833  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0680  fimbrial protein pilin  26.32 
 
 		 136 aa  60.1  0.00000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4536  fimbrial protein pilin  26.32 
 
 		 136 aa  59.3  0.00000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0675  fimbrial protein pilin  23.53 
 
 		 136 aa  59.3  0.00000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0357739 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0634  fimbrial protein pilin  24.12 
 
 		 136 aa  58.2  0.00000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0652  putative major pilin subunit  40.26 
 
 		 145 aa  58.2  0.00000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4819  general secretion pathway protein H  37.8 
 
 		 138 aa  57.8  0.00000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.80083  normal  0.111143 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0161  putative major pilin subunit  48.21 
 
 		 145 aa  57  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0158  putative major pilin subunit  48.21 
 
 		 145 aa  57  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.320147 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00107  predicted major pilin subunit  45.28 
 
 		 146 aa  56.6  0.0000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.686894  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3494  putative major pilin subunit  45.28 
 
 		 146 aa  56.6  0.0000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0114  putative major pilin subunit  45.28 
 
 		 146 aa  56.6  0.0000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00878541  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0110  putative major pilin subunit  45.28 
 
 		 146 aa  56.6  0.0000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000976692  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0164  putative major pilin subunit  48.21 
 
 		 145 aa  57  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.268979  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2173  methylation  45.07 
 
 		 146 aa  56.2  0.0000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00106  hypothetical protein  45.28 
 
 		 146 aa  56.6  0.0000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0111  putative major pilin subunit  38.16 
 
 		 146 aa  57  0.0000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.273778  normal  0.482641 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0156  putative major pilin subunit  48.21 
 
 		 145 aa  57  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3551  putative major pilin subunit  45.28 
 
 		 146 aa  56.6  0.0000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000125636 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0461  fimbrial protein precursor PilE (MS11 antigen)  45.76 
 
 		 167 aa  56.6  0.0000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.653734  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0157  putative major pilin subunit  48.21 
 
 		 145 aa  57  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0441  Fimbrial protein pilin  29.65 
 
 		 167 aa  55.8  0.0000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0463  type 4 fimbrial pilin signal peptide protein  33.58 
 
 		 167 aa  55.8  0.0000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.961425  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0477  prepilin-type cleavage/methylation  42.86 
 
 		 148 aa  55.8  0.0000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.695821  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03468  Tfp pilus assembly protein major pilin PilA  41.3 
 
 		 141 aa  55.5  0.0000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2126  methylation  45.9 
 
 		 146 aa  55.5  0.0000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.196428  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3344  prepilin-type cleavage/methylation  42.37 
 
 		 148 aa  54.7  0.0000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.62769  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0250  fimbrial subunit  34.83 
 
 		 152 aa  54.7  0.0000006  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0333044  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1383  type IV pilin PilE  51.11 
 
 		 135 aa  54.3  0.0000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.140998  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5161  type IV pilin structural subunit  51.16 
 
 		 179 aa  53.9  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2629  type IV pilus subunit PilA  30.94 
 
 		 138 aa  53.5  0.000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2680  fimbrial protein pilin  48.89 
 
 		 169 aa  53.9  0.000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0726827  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4444  type IV pilin  34.12 
 
 		 160 aa  53.1  0.000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0864  pilin  53.66 
 
 		 163 aa  53.1  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.484071 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0480  pilin subfamily protein  51.16 
 
 		 174 aa  53.1  0.000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3918  methylation site containing protein  30.68 
 
 		 143 aa  52.4  0.000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000265425  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1510  fimbrial protein  51.22 
 
 		 138 aa  52.4  0.000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  unclonable  0.0000000690325  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002546  type IV pilin PilA  50 
 
 		 157 aa  52  0.000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.790868  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1041  putative major pilin subunit  44.23 
 
 		 154 aa  52.4  0.000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.131052 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2540  general secretion pathway protein H  40.74 
 
 		 147 aa  52.4  0.000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.13206  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3498  putative major pilin subunit  44.23 
 
 		 154 aa  52.4  0.000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5973  general secretion pathway protein H  36.9 
 
 		 198 aa  52.4  0.000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0600966 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3370  putative major pilin subunit  44.23 
 
 		 154 aa  52.4  0.000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.981789  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4782  Tfp pilus assembly protein  51.28 
 
 		 179 aa  52  0.000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.26372 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0656  general secretion pathway protein H  37.35 
 
 		 199 aa  52  0.000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58730  type IV pilin structural subunit  53.85 
 
 		 179 aa  52  0.000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.279942  normal  0.457351 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3387  fgenesh4_pg.C_scaffold_2883000002  43.86 
 
 		 196 aa  51.2  0.000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.437334  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0478  type 4 fimbrial pilin signal peptide protein  52.17 
 
 		 169 aa  51.2  0.000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.322644  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4040  fimbrial protein pilin  24.35 
 
 		 178 aa  51.6  0.000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.736529  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0558  type 4 fimbrial pilin signal peptide protein  52.17 
 
 		 168 aa  51.2  0.000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.791178  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5196  type 4 fimbrial biogenesis protein PilE  46.67 
 
 		 141 aa  51.2  0.000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2675  general secretion pathway protein H  43.1 
 
 		 198 aa  50.8  0.000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0472  fimbrial protein pilin  38.46 
 
 		 182 aa  50.8  0.000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.877435  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0065  pilin  41.27 
 
 		 170 aa  50.8  0.000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.154072 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0417  pilin, putative  48.72 
 
 		 138 aa  50.4  0.00001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0927  type IV pilus biogenesis protein  48 
 
 		 142 aa  50.8  0.00001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004288  putative fimbrial assembly protein PilE  37.5 
 
 		 163 aa  50.4  0.00001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2035  hypothetical protein  43.1 
 
 		 198 aa  50.8  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2567  general secretion pathway protein H  43.1 
 
 		 198 aa  50.8  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0797  pilin  37.5 
 
 		 148 aa  50.8  0.00001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2693  general secretion pathway protein H  43.1 
 
 		 198 aa  50.8  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.289926  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2646  hypothetical protein  43.1 
 
 		 198 aa  50.8  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4679  Tfp pilus assembly protein major pilin PilA  54.05 
 
 		 168 aa  50.8  0.00001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3944  fimbrial protein pilin  52.5 
 
 		 166 aa  50.8  0.00001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.736158  hitchhiker  0.00123211 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12104  fimbrial protein  48.72 
 
 		 165 aa  49.7  0.00002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.246946  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1865  pilus assembly protein  44.23 
 
 		 134 aa  50.1  0.00002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2200  pilus assembly protein PilA  43.48 
 
 		 111 aa  50.1  0.00002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.360457  hitchhiker  0.000654211 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3385  fgenesh4_pg.C_scaffold_2883000002  31.01 
 
 		 199 aa  49.7  0.00002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0627  putative major pilin subunit  36.54 
 
 		 147 aa  50.1  0.00002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0421  methylation site containing protein  48.72 
 
 		 142 aa  50.1  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000175547  normal  0.0256712 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0478  prepilin peptidase dependent protein D  51.22 
 
 		 134 aa  49.7  0.00002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.183909  normal  0.878303 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3946  fimbrial protein pilin  51.28 
 
 		 169 aa  50.1  0.00002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00129399 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3575  putative major pilin subunit  56.76 
 
 		 148 aa  49.7  0.00002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.270372  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3289  putative type IV fimbrial pilin protein  41.07 
 
 		 207 aa  49.3  0.00003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.213615  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1866  hypothetical protein  39.62 
 
 		 446 aa  49.3  0.00003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.287595  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0666  putative major pilin subunit  33.96 
 
 		 147 aa  48.9  0.00003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2523  methylation  33.33 
 
 		 141 aa  49.3  0.00003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0677  putative type IV fimbrial pilin protein  41.07 
 
 		 207 aa  49.3  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.458693 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0384  putative pilin  37.93 
 
 		 147 aa  49.3  0.00003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3386  hypothetical protein  39.62 
 
 		 438 aa  49.3  0.00003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00409988 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0477  putative type 4 fimbrial pilin signal peptide protein  45.45 
 
 		 173 aa  48.9  0.00003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0748911  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3040  general secretion pathway protein H  38 
 
 		 177 aa  48.9  0.00004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.504644  normal  0.141498 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1078  pilin  44.44 
 
 		 162 aa  48.9  0.00004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.18456 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0314  general secretion pathway protein  26.02 
 
 		 147 aa  48.9  0.00004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4674  methylation  48.65 
 
 		 169 aa  48.5  0.00005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.953976  normal  0.930835 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0820  putative type IV pilin protein PilA  54.05 
 
 		 172 aa  48.5  0.00005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0816  putative type IV pilin protein PilA  54.05 
 
 		 172 aa  48.5  0.00005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>