More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene XfasM23_2031 on replicon NC_010577
Organism: Xylella fastidiosa M23



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010577  XfasM23_2031  fimbrial protein pilin  100 
 
 		 148 aa  298  2e-80  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.187958  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2109  fimbrial protein  84.46 
 
 		 149 aa  228  3e-59  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2112  fimbrial protein  63.7 
 
 		 146 aa  150  5e-36  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2033  fimbrial protein pilin  63.7 
 
 		 146 aa  149  8.999999999999999e-36  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.244331  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0638  fimbrillin  49.41 
 
 		 177 aa  137  3.9999999999999997e-32  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.37134  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1143  fimbrillin  45.24 
 
 		 180 aa  136  1e-31  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0896  fimbrillin  44.64 
 
 		 180 aa  135  2e-31  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3175  Fimbrial protein pilin  44.52 
 
 		 134 aa  113  1.0000000000000001e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3896  Fimbrial protein pilin  45.93 
 
 		 133 aa  107  8.000000000000001e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0475  fimbrial protein pilin  44.9 
 
 		 139 aa  100  1e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.665132  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3176  Fimbrial protein pilin  49.34 
 
 		 137 aa  96.3  1e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1999  fimbrial protein  42.18 
 
 		 153 aa  91.3  5e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0680  fimbrial protein pilin  36.91 
 
 		 136 aa  88.6  3e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0634  fimbrial protein pilin  37.84 
 
 		 136 aa  87.8  5e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0675  fimbrial protein pilin  36.91 
 
 		 136 aa  87.4  6e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0357739 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4819  general secretion pathway protein H  43.97 
 
 		 138 aa  81.6  0.000000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.80083  normal  0.111143 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4536  fimbrial protein pilin  34.9 
 
 		 136 aa  82  0.000000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3356  fimbrial protein pilin: general secretion pathway protein H  37.93 
 
 		 137 aa  79  0.00000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.669833  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2449  Fimbrial protein pilin  38.12 
 
 		 162 aa  79  0.00000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.000426279  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00107  predicted major pilin subunit  34.29 
 
 		 146 aa  73.9  0.0000000000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.686894  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3494  putative major pilin subunit  34.29 
 
 		 146 aa  73.9  0.0000000000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00106  hypothetical protein  34.29 
 
 		 146 aa  73.9  0.0000000000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3551  putative major pilin subunit  34.29 
 
 		 146 aa  73.9  0.0000000000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000125636 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0110  putative major pilin subunit  34.29 
 
 		 146 aa  73.9  0.0000000000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000976692  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0111  putative major pilin subunit  34.29 
 
 		 146 aa  73.9  0.0000000000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.273778  normal  0.482641 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0065  pilin  52.05 
 
 		 170 aa  73.6  0.0000000000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.154072 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0158  putative major pilin subunit  34.29 
 
 		 145 aa  72.8  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.320147 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0156  putative major pilin subunit  34.29 
 
 		 145 aa  72.8  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0157  putative major pilin subunit  34.29 
 
 		 145 aa  72.8  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0161  putative major pilin subunit  34.29 
 
 		 145 aa  72  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0114  putative major pilin subunit  33.57 
 
 		 146 aa  72  0.000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00878541  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0652  putative major pilin subunit  34.25 
 
 		 145 aa  72  0.000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0164  putative major pilin subunit  34.06 
 
 		 145 aa  70.9  0.000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.268979  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03468  Tfp pilus assembly protein major pilin PilA  31.16 
 
 		 141 aa  68.9  0.00000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2173  methylation  35.53 
 
 		 146 aa  68.9  0.00000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2629  type IV pilus subunit PilA  35.59 
 
 		 138 aa  68.9  0.00000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3422  fimbrial protein pilin  37.16 
 
 		 148 aa  68.6  0.00000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4040  fimbrial protein pilin  35.11 
 
 		 178 aa  67.8  0.00000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.736529  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0627  putative major pilin subunit  34.75 
 
 		 147 aa  67.4  0.00000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58730  type IV pilin structural subunit  52.38 
 
 		 179 aa  67  0.00000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.279942  normal  0.457351 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0558  type 4 fimbrial pilin signal peptide protein  35.66 
 
 		 168 aa  66.6  0.0000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.791178  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0480  pilin subfamily protein  45.95 
 
 		 174 aa  65.5  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2126  methylation  40.13 
 
 		 146 aa  65.9  0.0000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.196428  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3387  fgenesh4_pg.C_scaffold_2883000002  47.22 
 
 		 196 aa  65.5  0.0000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.437334  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0864  pilin  65.22 
 
 		 163 aa  65.1  0.0000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.484071 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5161  type IV pilin structural subunit  67.5 
 
 		 179 aa  64.7  0.0000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0472  fimbrial protein pilin  49.25 
 
 		 182 aa  64.3  0.0000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.877435  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0461  fimbrial protein precursor PilE (MS11 antigen)  32.85 
 
 		 167 aa  63.9  0.0000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.653734  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4782  Tfp pilus assembly protein  61.9 
 
 		 179 aa  63.5  0.000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.26372 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2680  fimbrial protein pilin  62.79 
 
 		 169 aa  63.2  0.000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0726827  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2663  type IV pilus biogenesis protein PilE  30.22 
 
 		 142 aa  62  0.000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.839094  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0478  type 4 fimbrial pilin signal peptide protein  60.47 
 
 		 169 aa  61.6  0.000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.322644  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0249  fimbrial protein pilin  34.23 
 
 		 165 aa  62  0.000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0557  type 4 fimbrial pilin signal peptide protein  62.79 
 
 		 173 aa  61.2  0.000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0477  putative type 4 fimbrial pilin signal peptide protein  45.45 
 
 		 173 aa  60.8  0.000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0748911  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0271  putative pilin protein PilA  30.08 
 
 		 154 aa  61.2  0.000000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.148513  normal  0.384028 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3918  methylation site containing protein  70.27 
 
 		 143 aa  60.8  0.000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000265425  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0250  fimbrial subunit  45.16 
 
 		 152 aa  61.2  0.000000005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0333044  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1828  fimbrial protein pilin  54.76 
 
 		 170 aa  59.7  0.00000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.10224  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12104  fimbrial protein  40.51 
 
 		 165 aa  59.7  0.00000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.246946  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3344  prepilin-type cleavage/methylation  49.15 
 
 		 148 aa  59.7  0.00000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.62769  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60320  type 4 fimbrial biogenesis protein PilE  40.43 
 
 		 141 aa  59.7  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000362369 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2904  putative type 4 fimbrial biogenesis transmembrane protein  35.82 
 
 		 168 aa  59.7  0.00000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.3004 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1510  fimbrial protein  67.57 
 
 		 138 aa  59.3  0.00000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  unclonable  0.0000000690325  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0441  Fimbrial protein pilin  33.97 
 
 		 167 aa  59.3  0.00000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2567  general secretion pathway protein H  61.9 
 
 		 198 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2540  general secretion pathway protein H  57.14 
 
 		 147 aa  58.9  0.00000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.13206  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5973  general secretion pathway protein H  61.9 
 
 		 198 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0600966 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2693  general secretion pathway protein H  61.9 
 
 		 198 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.289926  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0417  pilin, putative  67.57 
 
 		 138 aa  58.5  0.00000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0463  type 4 fimbrial pilin signal peptide protein  45.33 
 
 		 167 aa  58.2  0.00000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.961425  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2675  general secretion pathway protein H  61.9 
 
 		 198 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1889  hypothetical protein  35.79 
 
 		 137 aa  58.2  0.00000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4674  methylation  59.52 
 
 		 169 aa  57.8  0.00000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.953976  normal  0.930835 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2035  hypothetical protein  61.9 
 
 		 198 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0656  general secretion pathway protein H  63.41 
 
 		 199 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2646  hypothetical protein  61.9 
 
 		 198 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0477  prepilin-type cleavage/methylation  49.25 
 
 		 148 aa  58.2  0.00000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.695821  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2200  pilus assembly protein PilA  58.7 
 
 		 111 aa  57.8  0.00000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.360457  hitchhiker  0.000654211 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3945  fimbrial protein pilin  65 
 
 		 166 aa  57.8  0.00000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.373423  hitchhiker  0.00130999 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0649  pilin family protein  59.52 
 
 		 207 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1078  pilin  61.9 
 
 		 162 aa  57.8  0.00000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.18456 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0421  methylation site containing protein  49.15 
 
 		 142 aa  57.8  0.00000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000175547  normal  0.0256712 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0467  type 4 fimbrial pilin signal peptide protein  63.16 
 
 		 171 aa  57.4  0.00000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.568157  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0446  putative type IV fimbrial pilin protein  54.55 
 
 		 205 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.590776 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4444  type IV pilin  47.62 
 
 		 160 aa  57.4  0.00000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3385  fgenesh4_pg.C_scaffold_2883000002  57.78 
 
 		 199 aa  57.4  0.00000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3944  fimbrial protein pilin  60 
 
 		 166 aa  57.4  0.00000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.736158  hitchhiker  0.00123211 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1383  type IV pilin PilE  50.94 
 
 		 135 aa  57.4  0.00000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.140998  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0927  type IV pilus biogenesis protein  54.35 
 
 		 142 aa  57.4  0.00000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4679  Tfp pilus assembly protein major pilin PilA  59.52 
 
 		 168 aa  57.4  0.00000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002546  type IV pilin PilA  61.54 
 
 		 157 aa  57  0.00000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.790868  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3289  putative type IV fimbrial pilin protein  64.1 
 
 		 207 aa  57  0.00000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.213615  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3946  fimbrial protein pilin  68.57 
 
 		 169 aa  57  0.00000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00129399 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0677  putative type IV fimbrial pilin protein  64.1 
 
 		 207 aa  57  0.00000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.458693 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1866  hypothetical protein  51.28 
 
 		 446 aa  56.6  0.0000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.287595  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1265  methylation  59.52 
 
 		 160 aa  57  0.0000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00964428  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2523  methylation  40.28 
 
 		 141 aa  56.6  0.0000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0349  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  40 
 
 		 179 aa  56.2  0.0000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000000875622  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5196  type 4 fimbrial biogenesis protein PilE  36.76 
 
 		 141 aa  56.2  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>