More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xfasm12_2109 on replicon NC_010513
Organism: Xylella fastidiosa M12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010513  Xfasm12_2109  fimbrial protein  100 
 
 		 149 aa  300  3.0000000000000004e-81  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2031  fimbrial protein pilin  84.46 
 
 		 148 aa  228  2e-59  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.187958  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2112  fimbrial protein  61.38 
 
 		 146 aa  147  4e-35  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2033  fimbrial protein pilin  61.38 
 
 		 146 aa  147  7e-35  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.244331  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0638  fimbrillin  50 
 
 		 177 aa  140  8e-33  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.37134  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1143  fimbrillin  44.05 
 
 		 180 aa  128  2.0000000000000002e-29  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0896  fimbrillin  43.45 
 
 		 180 aa  127  6e-29  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3175  Fimbrial protein pilin  43.84 
 
 		 134 aa  111  4.0000000000000004e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3896  Fimbrial protein pilin  43.15 
 
 		 133 aa  103  9e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3176  Fimbrial protein pilin  49.32 
 
 		 137 aa  99.4  1e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0475  fimbrial protein pilin  41.78 
 
 		 139 aa  90.1  1e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.665132  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0634  fimbrial protein pilin  37.58 
 
 		 136 aa  84.7  3e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0680  fimbrial protein pilin  35.57 
 
 		 136 aa  85.1  3e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0675  fimbrial protein pilin  36.24 
 
 		 136 aa  84.7  4e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0357739 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4536  fimbrial protein pilin  35.57 
 
 		 136 aa  83.2  0.000000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1999  fimbrial protein  37.66 
 
 		 153 aa  82  0.000000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2449  Fimbrial protein pilin  38.75 
 
 		 162 aa  80.5  0.000000000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.000426279  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00107  predicted major pilin subunit  34.25 
 
 		 146 aa  75.5  0.0000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.686894  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3494  putative major pilin subunit  34.25 
 
 		 146 aa  75.5  0.0000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0111  putative major pilin subunit  34.25 
 
 		 146 aa  75.9  0.0000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.273778  normal  0.482641 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3551  putative major pilin subunit  34.25 
 
 		 146 aa  75.5  0.0000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000125636 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0652  putative major pilin subunit  34.93 
 
 		 145 aa  75.9  0.0000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4819  general secretion pathway protein H  40.87 
 
 		 138 aa  75.9  0.0000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.80083  normal  0.111143 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0110  putative major pilin subunit  34.25 
 
 		 146 aa  75.9  0.0000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000976692  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00106  hypothetical protein  34.25 
 
 		 146 aa  75.5  0.0000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3356  fimbrial protein pilin: general secretion pathway protein H  35.42 
 
 		 137 aa  75.1  0.0000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.669833  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0114  putative major pilin subunit  33.56 
 
 		 146 aa  73.6  0.0000000000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00878541  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2173  methylation  37.5 
 
 		 146 aa  72.4  0.000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0158  putative major pilin subunit  32.19 
 
 		 145 aa  71.6  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.320147 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0157  putative major pilin subunit  32.19 
 
 		 145 aa  71.6  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0156  putative major pilin subunit  32.19 
 
 		 145 aa  71.6  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0161  putative major pilin subunit  32.19 
 
 		 145 aa  70.9  0.000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0065  pilin  49.32 
 
 		 170 aa  70.1  0.00000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.154072 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0164  putative major pilin subunit  30.82 
 
 		 145 aa  68.2  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.268979  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3422  fimbrial protein pilin  37.16 
 
 		 148 aa  65.5  0.0000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0441  Fimbrial protein pilin  33.94 
 
 		 167 aa  65.9  0.0000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5161  type IV pilin structural subunit  61.36 
 
 		 179 aa  65.1  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0250  fimbrial subunit  35.66 
 
 		 152 aa  64.7  0.0000000004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0333044  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03468  Tfp pilus assembly protein major pilin PilA  44.44 
 
 		 141 aa  63.9  0.0000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58730  type IV pilin structural subunit  33.12 
 
 		 179 aa  63.9  0.0000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.279942  normal  0.457351 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0472  fimbrial protein pilin  47.76 
 
 		 182 aa  63.5  0.0000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.877435  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0249  fimbrial protein pilin  36.91 
 
 		 165 aa  63.5  0.0000000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2629  type IV pilus subunit PilA  31.58 
 
 		 138 aa  63.5  0.000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0461  fimbrial protein precursor PilE (MS11 antigen)  32.86 
 
 		 167 aa  62.8  0.000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.653734  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0480  pilin subfamily protein  43.24 
 
 		 174 aa  62.4  0.000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2663  type IV pilus biogenesis protein PilE  45 
 
 		 142 aa  62.4  0.000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.839094  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3387  fgenesh4_pg.C_scaffold_2883000002  44.44 
 
 		 196 aa  62  0.000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.437334  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2904  putative type 4 fimbrial biogenesis transmembrane protein  37.31 
 
 		 168 aa  62  0.000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.3004 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3918  methylation site containing protein  50.85 
 
 		 143 aa  62  0.000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000265425  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4040  fimbrial protein pilin  33.83 
 
 		 178 aa  61.6  0.000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.736529  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0463  type 4 fimbrial pilin signal peptide protein  43.62 
 
 		 167 aa  62  0.000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.961425  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3344  prepilin-type cleavage/methylation  49.15 
 
 		 148 aa  62  0.000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.62769  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0864  pilin  60.87 
 
 		 163 aa  62  0.000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.484071 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2680  fimbrial protein pilin  34.76 
 
 		 169 aa  61.6  0.000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0726827  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2126  methylation  71.79 
 
 		 146 aa  61.2  0.000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.196428  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0627  putative major pilin subunit  32.62 
 
 		 147 aa  61.2  0.000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0417  pilin, putative  49.15 
 
 		 138 aa  59.7  0.00000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4782  Tfp pilus assembly protein  57.14 
 
 		 179 aa  60.1  0.00000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.26372 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0558  type 4 fimbrial pilin signal peptide protein  46.55 
 
 		 168 aa  58.9  0.00000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.791178  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4444  type IV pilin  47.62 
 
 		 160 aa  58.9  0.00000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002546  type IV pilin PilA  64.1 
 
 		 157 aa  58.9  0.00000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.790868  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2540  general secretion pathway protein H  57.14 
 
 		 147 aa  58.9  0.00000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.13206  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0421  methylation site containing protein  49.15 
 
 		 142 aa  58.9  0.00000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000175547  normal  0.0256712 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1383  type IV pilin PilE  46.03 
 
 		 135 aa  59.3  0.00000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.140998  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0477  prepilin-type cleavage/methylation  52.73 
 
 		 148 aa  59.3  0.00000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.695821  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0927  type IV pilus biogenesis protein  56.82 
 
 		 142 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4674  methylation  59.52 
 
 		 169 aa  58.5  0.00000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.953976  normal  0.930835 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1510  fimbrial protein  64.86 
 
 		 138 aa  58.2  0.00000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  unclonable  0.0000000690325  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1217  type IV pilus biogenesis protein PilE  41.33 
 
 		 141 aa  58.2  0.00000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0477  putative type 4 fimbrial pilin signal peptide protein  42.42 
 
 		 173 aa  57.8  0.00000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0748911  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0478  type 4 fimbrial pilin signal peptide protein  55.81 
 
 		 169 aa  58.2  0.00000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.322644  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0557  type 4 fimbrial pilin signal peptide protein  58.14 
 
 		 173 aa  57.8  0.00000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3945  fimbrial protein pilin  65 
 
 		 166 aa  57.8  0.00000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.373423  hitchhiker  0.00130999 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12104  fimbrial protein  37.97 
 
 		 165 aa  57.8  0.00000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.246946  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3575  putative major pilin subunit  54 
 
 		 148 aa  57.8  0.00000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.270372  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1041  putative major pilin subunit  50.98 
 
 		 154 aa  57.8  0.00000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.131052 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1828  fimbrial protein pilin  27.67 
 
 		 170 aa  57.8  0.00000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.10224  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3498  putative major pilin subunit  50.98 
 
 		 154 aa  57.8  0.00000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3944  fimbrial protein pilin  60 
 
 		 166 aa  57.8  0.00000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.736158  hitchhiker  0.00123211 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4679  Tfp pilus assembly protein major pilin PilA  55.56 
 
 		 168 aa  57.8  0.00000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3370  putative major pilin subunit  50.98 
 
 		 154 aa  57.8  0.00000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.981789  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0485  fimbrial protein pilin  31.69 
 
 		 136 aa  57.8  0.00000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0349  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  42.65 
 
 		 179 aa  57.4  0.00000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000000875622  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1265  methylation  55.56 
 
 		 160 aa  57.4  0.00000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00964428  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0271  putative pilin protein PilA  28.57 
 
 		 154 aa  57.4  0.00000007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.148513  normal  0.384028 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3946  fimbrial protein pilin  68.57 
 
 		 169 aa  57  0.00000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00129399 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1702  type IV pilin  30.5 
 
 		 151 aa  57  0.00000008  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.135824  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1764  type IV pilin  30.5 
 
 		 151 aa  57  0.00000009  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.940075  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1866  hypothetical protein  51.28 
 
 		 446 aa  56.6  0.0000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.287595  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1865  pilus assembly protein  34.88 
 
 		 134 aa  57  0.0000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2200  pilus assembly protein PilA  56.52 
 
 		 111 aa  56.6  0.0000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.360457  hitchhiker  0.000654211 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2567  general secretion pathway protein H  40 
 
 		 198 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2523  methylation  43.33 
 
 		 141 aa  56.6  0.0000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0467  type 4 fimbrial pilin signal peptide protein  60.53 
 
 		 171 aa  56.2  0.0000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.568157  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3386  hypothetical protein  51.28 
 
 		 438 aa  56.6  0.0000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00409988 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2693  general secretion pathway protein H  40 
 
 		 198 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.289926  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60320  type 4 fimbrial biogenesis protein PilE  39.29 
 
 		 141 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000362369 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0126  Tfp pilus assembly protein PilE-like  43.64 
 
 		 151 aa  56.6  0.0000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0148502  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0656  general secretion pathway protein H  40.48 
 
 		 199 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0649  pilin family protein  58.97 
 
 		 207 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>