196 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xfasm12_0638 on replicon NC_010513
Organism: Xylella fastidiosa M12



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010513  Xfasm12_0638  fimbrillin  100 
 
 		 177 aa  363  1e-100  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.37134  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1143  fimbrillin  50.57 
 
 		 180 aa  177  7e-44  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0896  fimbrillin  50.57 
 
 		 180 aa  176  1e-43  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2109  fimbrial protein  50 
 
 		 149 aa  119  1.9999999999999998e-26  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2031  fimbrial protein pilin  49.41 
 
 		 148 aa  117  9.999999999999999e-26  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.187958  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2112  fimbrial protein  43.98 
 
 		 146 aa  113  2.0000000000000002e-24  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2033  fimbrial protein pilin  46.39 
 
 		 146 aa  113  2.0000000000000002e-24  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.244331  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3175  Fimbrial protein pilin  34.31 
 
 		 134 aa  83.6  0.000000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3896  Fimbrial protein pilin  35.12 
 
 		 133 aa  82  0.000000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3176  Fimbrial protein pilin  40.58 
 
 		 137 aa  73.2  0.000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0475  fimbrial protein pilin  47.5 
 
 		 139 aa  72  0.000000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.665132  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4819  general secretion pathway protein H  31.29 
 
 		 138 aa  64.7  0.0000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.80083  normal  0.111143 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2449  Fimbrial protein pilin  32.54 
 
 		 162 aa  62  0.000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.000426279  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0680  fimbrial protein pilin  27.54 
 
 		 136 aa  62  0.000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1999  fimbrial protein  30.77 
 
 		 153 aa  59.7  0.00000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03468  Tfp pilus assembly protein major pilin PilA  30 
 
 		 141 aa  59.3  0.00000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2629  type IV pilus subunit PilA  30.88 
 
 		 138 aa  58.2  0.00000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0161  putative major pilin subunit  43.84 
 
 		 145 aa  56.6  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0158  putative major pilin subunit  43.84 
 
 		 145 aa  56.6  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.320147 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0157  putative major pilin subunit  43.84 
 
 		 145 aa  56.6  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0156  putative major pilin subunit  43.84 
 
 		 145 aa  56.6  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3344  prepilin-type cleavage/methylation  42.62 
 
 		 148 aa  56.2  0.0000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.62769  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0065  pilin  47.69 
 
 		 170 aa  55.8  0.0000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.154072 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0164  putative major pilin subunit  42.47 
 
 		 145 aa  55.5  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.268979  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0634  fimbrial protein pilin  41.67 
 
 		 136 aa  54.7  0.0000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5161  type IV pilin structural subunit  53.49 
 
 		 179 aa  54.7  0.0000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00107  predicted major pilin subunit  45.45 
 
 		 146 aa  54.7  0.0000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.686894  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3494  putative major pilin subunit  45.45 
 
 		 146 aa  54.7  0.0000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0114  putative major pilin subunit  45.45 
 
 		 146 aa  54.7  0.0000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00878541  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00106  hypothetical protein  45.45 
 
 		 146 aa  54.7  0.0000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0111  putative major pilin subunit  45.45 
 
 		 146 aa  54.7  0.0000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.273778  normal  0.482641 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0675  fimbrial protein pilin  41.67 
 
 		 136 aa  54.7  0.0000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0357739 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0110  putative major pilin subunit  45.45 
 
 		 146 aa  54.7  0.0000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000976692  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3551  putative major pilin subunit  45.45 
 
 		 146 aa  54.7  0.0000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000125636 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3356  fimbrial protein pilin: general secretion pathway protein H  39.13 
 
 		 137 aa  54.7  0.0000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.669833  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0652  putative major pilin subunit  43.64 
 
 		 145 aa  53.5  0.000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3370  putative major pilin subunit  48.08 
 
 		 154 aa  52.8  0.000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.981789  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1041  putative major pilin subunit  48.08 
 
 		 154 aa  52.8  0.000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.131052 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3498  putative major pilin subunit  48.08 
 
 		 154 aa  52.8  0.000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4444  type IV pilin  29.32 
 
 		 160 aa  52.4  0.000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2200  pilus assembly protein PilA  30 
 
 		 111 aa  52  0.000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.360457  hitchhiker  0.000654211 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58730  type IV pilin structural subunit  52.5 
 
 		 179 aa  52  0.000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.279942  normal  0.457351 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2126  methylation  58.97 
 
 		 146 aa  51.6  0.000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.196428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3422  fimbrial protein pilin  31.79 
 
 		 148 aa  52  0.000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4536  fimbrial protein pilin  24.55 
 
 		 136 aa  51.6  0.000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3575  putative major pilin subunit  40 
 
 		 148 aa  51.2  0.000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.270372  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3918  methylation site containing protein  46.81 
 
 		 143 aa  51.2  0.000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000265425  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3387  fgenesh4_pg.C_scaffold_2883000002  37.21 
 
 		 196 aa  51.2  0.000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.437334  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0627  putative major pilin subunit  55 
 
 		 147 aa  51.2  0.000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0864  pilin  51.11 
 
 		 163 aa  50.8  0.000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.484071 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3255  hypothetical protein  44.44 
 
 		 140 aa  50.4  0.00001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0480  pilin subfamily protein  36.07 
 
 		 174 aa  50.4  0.00001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4782  Tfp pilus assembly protein  44.19 
 
 		 179 aa  50.1  0.00002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.26372 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0477  prepilin-type cleavage/methylation  40.58 
 
 		 148 aa  49.3  0.00003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.695821  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2680  fimbrial protein pilin  47.62 
 
 		 169 aa  48.9  0.00003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0726827  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4040  fimbrial protein pilin  45.65 
 
 		 178 aa  49.3  0.00003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.736529  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1097  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  27.34 
 
 		 151 aa  49.3  0.00003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.282151  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0472  fimbrial protein pilin  45.24 
 
 		 182 aa  48.9  0.00004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.877435  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0126  Tfp pilus assembly protein PilE-like  29.55 
 
 		 151 aa  48.9  0.00004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0148502  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0417  pilin, putative  47.62 
 
 		 138 aa  48.5  0.00005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3385  fgenesh4_pg.C_scaffold_2883000002  43.48 
 
 		 199 aa  48.5  0.00005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4679  Tfp pilus assembly protein major pilin PilA  45.65 
 
 		 168 aa  48.5  0.00005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1436  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  38.1 
 
 		 171 aa  48.5  0.00005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002546  type IV pilin PilA  51.28 
 
 		 157 aa  48.1  0.00006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.790868  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0461  fimbrial protein precursor PilE (MS11 antigen)  38.33 
 
 		 167 aa  48.1  0.00006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.653734  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0421  methylation site containing protein  47.62 
 
 		 142 aa  48.1  0.00006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000175547  normal  0.0256712 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2540  general secretion pathway protein H  31.76 
 
 		 147 aa  47.8  0.00007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.13206  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0441  Fimbrial protein pilin  31.61 
 
 		 167 aa  47.8  0.00007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1018  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  36.47 
 
 		 161 aa  47.8  0.00007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3945  fimbrial protein pilin  47.83 
 
 		 166 aa  47.8  0.00007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.373423  hitchhiker  0.00130999 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0463  type 4 fimbrial pilin signal peptide protein  47.83 
 
 		 167 aa  48.1  0.00007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.961425  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0927  type IV pilus biogenesis protein  36.23 
 
 		 142 aa  47.8  0.00008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3944  fimbrial protein pilin  40.91 
 
 		 166 aa  47.8  0.00008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.736158  hitchhiker  0.00123211 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0250  fimbrial subunit  40.38 
 
 		 152 aa  47.8  0.00009  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0333044  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5196  type 4 fimbrial biogenesis protein PilE  31.88 
 
 		 141 aa  47.8  0.00009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1866  hypothetical protein  40 
 
 		 446 aa  47.8  0.00009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.287595  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3386  hypothetical protein  40 
 
 		 438 aa  47.8  0.00009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00409988 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1510  fimbrial protein  51.35 
 
 		 138 aa  47  0.0001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  unclonable  0.0000000690325  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0558  type 4 fimbrial pilin signal peptide protein  45.24 
 
 		 168 aa  47.4  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.791178  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0478  type 4 fimbrial pilin signal peptide protein  45.24 
 
 		 169 aa  47  0.0001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.322644  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5185  protein involved in methylation  43.9 
 
 		 174 aa  47  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.101493  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0477  putative type 4 fimbrial pilin signal peptide protein  44.19 
 
 		 173 aa  47.4  0.0001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0748911  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2904  putative type 4 fimbrial biogenesis transmembrane protein  33.96 
 
 		 168 aa  47.4  0.0001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.3004 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3946  fimbrial protein pilin  48.78 
 
 		 169 aa  47.4  0.0001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00129399 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0467  type 4 fimbrial pilin signal peptide protein  47.37 
 
 		 171 aa  47  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.568157  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0666  putative major pilin subunit  48.78 
 
 		 147 aa  47.4  0.0001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1828  fimbrial protein pilin  43.9 
 
 		 170 aa  47  0.0001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.10224  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2019  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  51.16 
 
 		 130 aa  47.4  0.0001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0557  type 4 fimbrial pilin signal peptide protein  45.24 
 
 		 173 aa  46.2  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0096  hypothetical protein  38.03 
 
 		 163 aa  46.2  0.0002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.062594 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2275  general secretion pathway protein H  44.74 
 
 		 164 aa  47  0.0002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0649  pilin family protein  46.15 
 
 		 207 aa  46.6  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12104  fimbrial protein  46.15 
 
 		 165 aa  46.6  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.246946  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4674  methylation  41.3 
 
 		 169 aa  47  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.953976  normal  0.930835 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1280  hypothetical protein  41.3 
 
 		 152 aa  46.6  0.0002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2173  methylation  44.93 
 
 		 146 aa  46.6  0.0002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60320  type 4 fimbrial biogenesis protein PilE  35.14 
 
 		 141 aa  47  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000362369 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0059  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  44.07 
 
 		 151 aa  45.8  0.0003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.230525 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1702  type IV pilin  41.67 
 
 		 151 aa  46.2  0.0003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.135824  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1764  type IV pilin  41.67 
 
 		 151 aa  46.2  0.0003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.940075  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>