72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A2940 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A2940  fimbrial biogenesis protein  100 
 
 		 176 aa  356  9e-98  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.637065 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2929  general secretion pathway protein H  42.94 
 
 		 188 aa  133  9.999999999999999e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1864  pilus assembly protein  28.32 
 
 		 172 aa  63.5  0.000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0783  general secretion pathway protein H  47.46 
 
 		 182 aa  57.8  0.00000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3313  methylation site containing protein  40.62 
 
 		 144 aa  54.3  0.0000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.936741  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0866  putative type-4 fimbrial pilin related signal peptide protein  32.56 
 
 		 194 aa  54.3  0.000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.197322  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3040  general secretion pathway protein H  38.67 
 
 		 177 aa  53.9  0.000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.504644  normal  0.141498 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0852  methylation site containing protein  35.94 
 
 		 145 aa  53.9  0.000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.992733 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0864  methylation site containing protein  36.36 
 
 		 145 aa  53.9  0.000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5190  type 4 fimbrial biogenesis protein FimU  37.37 
 
 		 168 aa  53.1  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.875037  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0709  methylation site containing protein  40.62 
 
 		 144 aa  53.1  0.000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0829  methylation site containing protein  36.36 
 
 		 145 aa  53.1  0.000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3425  methylation site containing protein  40.62 
 
 		 144 aa  52.8  0.000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0853  pilin, putative  40.62 
 
 		 144 aa  52.8  0.000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0962  Tfp pilus assembly protein FimT-like protein  46.43 
 
 		 162 aa  52.8  0.000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.582094  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05337  putative type-4 fimbrial pilin related signal peptide protein  43.1 
 
 		 181 aa  52  0.000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.693608 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0713  Tfp pilus assembly protein FimT-like protein  32.84 
 
 		 214 aa  52  0.000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.687986 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60280  type 4 fimbrial biogenesis protein FimU  40.62 
 
 		 162 aa  51.6  0.000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000431898 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2915  putative type 4 fimbrial pilin related transmembrane protein  33.33 
 
 		 157 aa  51.6  0.000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2270  putative type-4 fimbrial pilin related signal peptide protein  28.57 
 
 		 187 aa  50.4  0.00001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2909  pilus assembly protein  34.21 
 
 		 188 aa  49.7  0.00002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.256003  normal  0.0433853 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2664  fimbrial biogenesis protein  39.68 
 
 		 178 aa  49.7  0.00002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.470161  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3229  Tfp pilus assembly protein  38.16 
 
 		 147 aa  49.3  0.00003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004287  type 4 fimbrial biogenesis protein FimT  27.53 
 
 		 168 aa  48.9  0.00003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5193  N-terminal methylation site-containing protein  29.79 
 
 		 188 aa  48.5  0.00004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.17462  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0670  Tfp pilus assembly protein FimT-like protein  31.11 
 
 		 214 aa  48.5  0.00005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.648692  normal  0.521585 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0971  general secretion pathway protein H  26.06 
 
 		 173 aa  48.5  0.00005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0019  pre-pilin like leader sequence  42.86 
 
 		 191 aa  48.1  0.00007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.808404  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3230  fimbrial pilin related signal peptide protein  32 
 
 		 171 aa  48.1  0.00007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.591415  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0722  putative type 4 fimbrial pilin related transmembrane protein  26.74 
 
 		 203 aa  47.8  0.00008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.905296 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0767  hypothetical protein  41.94 
 
 		 186 aa  47  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.130879 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5187  putative type-4 fimbrial pilin related signal peptide protein  42.86 
 
 		 187 aa  46.2  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3181  N-terminal methylation site  25.21 
 
 		 175 aa  46.6  0.0002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0385  putative type IV pilin  25.14 
 
 		 184 aa  46.6  0.0002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0091  hypothetical protein  41.82 
 
 		 182 aa  46.6  0.0002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.152728  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0500  Tfp pilus assembly protein FimT-like protein  40.32 
 
 		 218 aa  46.2  0.0003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0716  putative type 4 fimbrial pilin related transmembrane protein  30.06 
 
 		 186 aa  45.8  0.0003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0214  pre-pilin like leader sequence  38.33 
 
 		 172 aa  45.4  0.0004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0250023 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2522  methylation  36.92 
 
 		 179 aa  45.1  0.0005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01137  Tfp pilus assembly protein FimT  27.47 
 
 		 185 aa  45.1  0.0005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0811  pillin, putative  25.45 
 
 		 157 aa  44.7  0.0007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0714  type IV pilus biogenesis protein  36.25 
 
 		 166 aa  44.7  0.0008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3182  putative type-4 fimbrial pilin related signal peptide protein  36.67 
 
 		 194 aa  44.3  0.0009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0219  putative type IV pilin  27.87 
 
 		 182 aa  44.3  0.001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.130638 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0486  pilin assembly protein  27.43 
 
 		 167 aa  43.9  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00295768  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0558  type 4 fimbrial pilin signal peptide protein  44.26 
 
 		 168 aa  43.9  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.791178  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0669  hypothetical protein  26.15 
 
 		 192 aa  43.9  0.001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4847  hypothetical protein  25.47 
 
 		 157 aa  43.9  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.603969 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3404  fimbrial biogenesis protein  38.33 
 
 		 199 aa  43.1  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0205912 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0679  type IV pilin  23.3 
 
 		 181 aa  43.5  0.002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.639618  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0816  type IV pilus biogenesis protein  30.86 
 
 		 133 aa  42.7  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0686  hypothetical protein  26.15 
 
 		 192 aa  43.5  0.002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0670  hypothetical protein  37.88 
 
 		 171 aa  43.1  0.002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.177225  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3829  Tfp pilus assembly protein FimT-like protein  40 
 
 		 222 aa  42.7  0.003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.198337 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0723  type-4 fimbrial pilin-like transmembrane protein  27.52 
 
 		 161 aa  42.4  0.003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0253  putative type-4 fimbrial pilin related signal peptide protein  28.69 
 
 		 168 aa  42.4  0.003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3912  hypothetical protein  38.89 
 
 		 186 aa  42.4  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.580591  normal  0.0873326 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2877  methylation  31.15 
 
 		 192 aa  42.4  0.003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.169243  normal  0.567354 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3175  Fimbrial protein pilin  25.19 
 
 		 134 aa  42.7  0.003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0557  type 4 fimbrial pilin signal peptide protein  45 
 
 		 173 aa  42.4  0.004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1723  N-terminal methylation  25 
 
 		 156 aa  42  0.004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.370416  normal  0.0331224 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3167  hypothetical protein  23.08 
 
 		 153 aa  42  0.004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08256  pili retraction protein PilT  32.39 
 
 		 192 aa  42  0.004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1301  type IV pilus biogenesis protein, putative  35 
 
 		 177 aa  42  0.005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.397112 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2914  type IV pilin PilE  33.33 
 
 		 144 aa  41.6  0.005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0462503 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0480  pilin subfamily protein  48.78 
 
 		 174 aa  41.6  0.006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0262  putative pilin protein FimT  25.58 
 
 		 155 aa  41.6  0.006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.691948 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0566  MSHA pilin protein MshB  40 
 
 		 205 aa  41.6  0.006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.571105  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0788  fimbrial protein pilin  29.66 
 
 		 163 aa  41.6  0.007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.684386  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0715  pillin, putative  29.11 
 
 		 157 aa  41.2  0.007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0720  fimbrial protein pilin  29.63 
 
 		 133 aa  41.2  0.008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0015  Tfp pilus assembly protein FimT-like protein  37.93 
 
 		 192 aa  41.2  0.008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>