37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal_3825 on replicon NC_009052
Organism: Shewanella baltica OS155



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009052  Sbal_3825  MSHA biogenesis protein MshO  100 
 
 		 282 aa  575  1.0000000000000001e-163  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0143391  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0494  MSHA biogenesis protein MshO  97.52 
 
 		 282 aa  561  1.0000000000000001e-159  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0709841  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0519  MSHA biogenesis protein MshO  96.45 
 
 		 282 aa  556  1e-157  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0515  MSHA biogenesis protein MshO  89.68 
 
 		 290 aa  504  9.999999999999999e-143  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.141751  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0571  MSHA biogenesis protein MshO  82.16 
 
 		 281 aa  457  9.999999999999999e-129  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4102  MSHA biogenesis protein MshO  78.37 
 
 		 282 aa  457  1e-127  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3475  methylation site containing protein  78.47 
 
 		 287 aa  449  1e-125  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00218559  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0476  methylation site containing protein  77.78 
 
 		 287 aa  445  1.0000000000000001e-124  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0553768  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3651  methylation site containing protein  76.74 
 
 		 287 aa  442  1e-123  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3337  MSHA biogenesis protein MshO precursor  59.5 
 
 		 278 aa  322  3e-87  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.131781  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3757  methylation site containing protein  52.45 
 
 		 295 aa  285  5e-76  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0511874  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0400  methylation site containing protein  56.99 
 
 		 265 aa  279  3e-74  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.642203  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0555  methylation site containing protein  51.76 
 
 		 269 aa  263  2e-69  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0166475  normal  0.583012 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3741  methylation site containing protein  55.35 
 
 		 275 aa  261  8.999999999999999e-69  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.772407  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4405  methylation site containing protein  51.44 
 
 		 277 aa  260  1e-68  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0464  MSHA biogenesis protein MshO precursor  47.84 
 
 		 282 aa  253  2.0000000000000002e-66  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.467537  normal  0.968118 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0180  prepilin-type cleavage/methylation  36.3 
 
 		 280 aa  163  3e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4566  putative MSHA biogenesis protein MshO  34.6 
 
 		 292 aa  146  3e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.842341  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1144  MSHA biogenesis protein MshO  29.27 
 
 		 282 aa  103  2e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03688  hypothetical protein  30.26 
 
 		 237 aa  101  2e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3265  type II secretory pathway pseudopilin PulG  32.51 
 
 		 287 aa  99  9e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.226057  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002380  MSHA biogenesis protein MshO  30.14 
 
 		 253 aa  98.6  1e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.197407  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0763  hypothetical protein  29.45 
 
 		 261 aa  94.7  1e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0696342  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00261  Tfp pilus assembly protein PilW  25.18 
 
 		 251 aa  79.7  0.00000000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0394  type II secretory pathway pseudopilin PulG  28.42 
 
 		 268 aa  75.5  0.0000000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2830  hypothetical protein  42.39 
 
 		 192 aa  73.2  0.000000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.496531  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0480  exported protein MshO  24.29 
 
 		 251 aa  72.8  0.000000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.772217  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3339  methylation  26.42 
 
 		 283 aa  70.5  0.00000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.510017  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0886  general secretion pathway protein H  28.67 
 
 		 283 aa  70.5  0.00000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.115142 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3104  hypothetical protein  34.41 
 
 		 297 aa  62  0.00000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1798  hypothetical protein  35.09 
 
 		 1145 aa  46.2  0.0006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.314403 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1728  hypothetical protein  31.25 
 
 		 160 aa  45.4  0.001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.148636  normal  0.0609211 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0340  N-terminal methylation motif domain protein  34.48 
 
 		 567 aa  45.4  0.001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0757  hypothetical protein  27.27 
 
 		 261 aa  44.7  0.002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.538658  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1034  hypothetical protein  31.58 
 
 		 1104 aa  44.3  0.002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.881671 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1160  prepilin-type cleavage/methylation-like protein  29.33 
 
 		 207 aa  43.5  0.004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0017  hypothetical protein  35.48 
 
 		 343 aa  42.4  0.009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>