31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_3337 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_3337  MSHA biogenesis protein MshO precursor  100 
 
 		 278 aa  564  1e-160  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.131781  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4102  MSHA biogenesis protein MshO  63 
 
 		 282 aa  327  2.0000000000000001e-88  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0519  MSHA biogenesis protein MshO  59.86 
 
 		 282 aa  325  6e-88  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3475  methylation site containing protein  61.29 
 
 		 287 aa  325  6e-88  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00218559  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0515  MSHA biogenesis protein MshO  60.07 
 
 		 290 aa  323  1e-87  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.141751  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0494  MSHA biogenesis protein MshO  59.5 
 
 		 282 aa  323  2e-87  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0709841  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0476  methylation site containing protein  61.29 
 
 		 287 aa  323  2e-87  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0553768  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3825  MSHA biogenesis protein MshO  59.5 
 
 		 282 aa  322  3e-87  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0143391  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3651  methylation site containing protein  61.29 
 
 		 287 aa  321  8e-87  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0571  MSHA biogenesis protein MshO  59.71 
 
 		 281 aa  318  7e-86  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0464  MSHA biogenesis protein MshO precursor  51.25 
 
 		 282 aa  261  1e-68  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.467537  normal  0.968118 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0400  methylation site containing protein  49.64 
 
 		 265 aa  259  3e-68  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.642203  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3757  methylation site containing protein  48.94 
 
 		 295 aa  254  9e-67  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0511874  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4405  methylation site containing protein  48.56 
 
 		 277 aa  249  4e-65  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3741  methylation site containing protein  52.69 
 
 		 275 aa  244  1.9999999999999999e-63  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.772407  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0555  methylation site containing protein  46.43 
 
 		 269 aa  233  2.0000000000000002e-60  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0166475  normal  0.583012 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0180  prepilin-type cleavage/methylation  37.02 
 
 		 280 aa  172  7.999999999999999e-42  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4566  putative MSHA biogenesis protein MshO  31.25 
 
 		 292 aa  137  2e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.842341  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1144  MSHA biogenesis protein MshO  31.07 
 
 		 282 aa  106  5e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0763  hypothetical protein  29.89 
 
 		 261 aa  94.4  2e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0696342  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3265  type II secretory pathway pseudopilin PulG  29.39 
 
 		 287 aa  90.9  2e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.226057  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002380  MSHA biogenesis protein MshO  27.7 
 
 		 253 aa  85.9  6e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.197407  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03688  hypothetical protein  25 
 
 		 237 aa  81.3  0.00000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0480  exported protein MshO  26.41 
 
 		 251 aa  77.8  0.0000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.772217  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0886  general secretion pathway protein H  29.72 
 
 		 283 aa  72  0.00000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.115142 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2830  hypothetical protein  32.43 
 
 		 192 aa  71.6  0.00000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.496531  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3339  methylation  28.23 
 
 		 283 aa  70.9  0.00000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.510017  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00261  Tfp pilus assembly protein PilW  26.52 
 
 		 251 aa  68.9  0.00000000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3104  hypothetical protein  37.89 
 
 		 297 aa  65.1  0.000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0394  type II secretory pathway pseudopilin PulG  26.41 
 
 		 268 aa  57.8  0.0000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1798  hypothetical protein  39.34 
 
 		 1145 aa  43.1  0.005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.314403 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>